MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 486

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020544	CCT	2	6	1554	1559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433926
2	NC_020544	TCA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433926
3	NC_020544	GGC	2	6	1710	1715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433926
4	NC_020544	TCT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433926
5	NC_020544	CTT	2	6	1912	1917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433926
6	NC_020544	AAC	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433926
7	NC_020544	CGC	2	6	2060	2065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433926
8	NC_020544	CGA	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433927
9	NC_020544	CTT	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433927
10	NC_020544	GTC	2	6	2431	2436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433927
11	NC_020544	GGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433927
12	NC_020544	ACG	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433927
13	NC_020544	GCT	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433927
14	NC_020544	CCG	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433927
15	NC_020544	ATC	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433927
16	NC_020544	GCC	2	6	2908	2913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433927
17	NC_020544	GAG	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433927
18	NC_020544	CTT	2	6	2958	2963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433927
19	NC_020544	AGC	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433927
20	NC_020544	GTC	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433928
21	NC_020544	TCG	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433928
22	NC_020544	CTA	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433928
23	NC_020544	GCC	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433928
24	NC_020544	CTG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433928
25	NC_020544	CGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433928
26	NC_020544	CAG	2	6	3372	3377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433928
27	NC_020544	TGG	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433928
28	NC_020544	ATG	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433929
29	NC_020544	CGA	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433929
30	NC_020544	GCG	2	6	7005	7010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433929
31	NC_020544	TGG	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433929
32	NC_020544	ACC	2	6	7130	7135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433929
33	NC_020544	GCG	2	6	7258	7263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433929
34	NC_020544	GCC	2	6	7334	7339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433929
35	NC_020544	GAA	2	6	7393	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433929
36	NC_020544	CGG	2	6	7721	7726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433930
37	NC_020544	CGG	2	6	7775	7780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433930
38	NC_020544	CAT	2	6	8348	8353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433931
39	NC_020544	AAC	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433931
40	NC_020544	GCT	2	6	8432	8437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433931
41	NC_020544	TAT	2	6	8442	8447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472433931
42	NC_020544	AGG	2	6	8467	8472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433931
43	NC_020544	TGA	2	6	8500	8505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433931
44	NC_020544	GAG	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433931
45	NC_020544	GAT	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433931
46	NC_020544	CAT	2	6	8672	8677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433931
47	NC_020544	TCG	2	6	8726	8731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433931
48	NC_020544	TGC	2	6	8734	8739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433931
49	NC_020544	TGT	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433932
50	NC_020544	GAC	2	6	9383	9388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433932
51	NC_020544	CCG	2	6	9450	9455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433932
52	NC_020544	TCT	2	6	9469	9474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433932
53	NC_020544	CGT	2	6	9553	9558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
54	NC_020544	TCA	2	6	9639	9644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433932
55	NC_020544	TCG	2	6	9654	9659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
56	NC_020544	AGC	2	6	9674	9679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433932
57	NC_020544	TCG	2	6	9689	9694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
58	NC_020544	CAG	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433932
59	NC_020544	GCA	2	6	9800	9805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433932
60	NC_020544	GGC	2	6	9806	9811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433932
61	NC_020544	TGT	2	6	9945	9950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433932
62	NC_020544	CGG	2	6	10066	10071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433932
63	NC_020544	CCA	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433932
64	NC_020544	AGC	2	6	10371	10376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433932
65	NC_020544	TCG	2	6	10437	10442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
66	NC_020544	TAT	2	6	10448	10453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472433932
67	NC_020544	GGT	2	6	10463	10468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433932
68	NC_020544	GGA	2	6	10477	10482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433932
69	NC_020544	CGG	2	6	10495	10500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433932
70	NC_020544	TCG	2	6	10512	10517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
71	NC_020544	CGC	2	6	10764	10769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433932
72	NC_020544	GAC	2	6	10849	10854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433932
73	NC_020544	CGC	2	6	10861	10866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433932
74	NC_020544	CCG	2	6	10874	10879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433932
75	NC_020544	TGC	2	6	10977	10982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
76	NC_020544	TGC	2	6	10990	10995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
77	NC_020544	CCT	2	6	11052	11057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433932
78	NC_020544	CGG	2	6	11142	11147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433932
79	NC_020544	GGA	2	6	11169	11174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433932
80	NC_020544	ATT	2	6	11301	11306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472433932
81	NC_020544	CCA	2	6	11316	11321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433932
82	NC_020544	GGC	2	6	11323	11328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433932
83	NC_020544	GTT	2	6	11350	11355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433932
84	NC_020544	CGA	2	6	11407	11412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433932
85	NC_020544	CAA	2	6	11446	11451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433932
86	NC_020544	CTG	2	6	11495	11500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433932
87	NC_020544	GTC	2	6	11709	11714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433933
88	NC_020544	GGC	2	6	11767	11772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433933
89	NC_020544	GCT	2	6	11877	11882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433933
90	NC_020544	CGA	2	6	11885	11890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433933
91	NC_020544	GAG	2	6	11919	11924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433933
92	NC_020544	TGA	2	6	12017	12022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433933
93	NC_020544	TCC	2	6	12055	12060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433933
94	NC_020544	ACA	2	6	12088	12093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433933
95	NC_020544	CGC	2	6	12158	12163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433933
96	NC_020544	CGC	2	6	12207	12212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433933
97	NC_020544	ATG	2	6	12262	12267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433933
98	NC_020544	CAG	2	6	12333	12338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433933
99	NC_020544	AAC	2	6	12345	12350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433933
100	NC_020544	GTG	2	6	12371	12376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433933
101	NC_020544	GCG	2	6	12487	12492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433933
102	NC_020544	ATG	2	6	12695	12700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433934
103	NC_020544	TCA	2	6	12727	12732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433934
104	NC_020544	TCT	2	6	12772	12777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433934
105	NC_020544	AAG	2	6	12806	12811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433934
106	NC_020544	ACG	2	6	12822	12827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433934
107	NC_020544	ATC	2	6	12843	12848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433934
108	NC_020544	GTG	2	6	12930	12935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433934
109	NC_020544	CGG	2	6	12948	12953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433934
110	NC_020544	TGG	2	6	12986	12991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433934
111	NC_020544	ATC	2	6	13097	13102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433934
112	NC_020544	AGG	2	6	13155	13160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433934
113	NC_020544	GAG	2	6	13208	13213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433934
114	NC_020544	TCA	2	6	13375	13380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433934
115	NC_020544	CGC	2	6	13381	13386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433934
116	NC_020544	GCG	2	6	13512	13517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433934
117	NC_020544	TGT	2	6	13518	13523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433934
118	NC_020544	CGC	2	6	13596	13601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433934
119	NC_020544	CTC	2	6	13625	13630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433934
120	NC_020544	CTG	2	6	13794	13799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433935
121	NC_020544	GGC	2	6	13925	13930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433935
122	NC_020544	TTG	2	6	13978	13983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433935
123	NC_020544	CGG	2	6	14026	14031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433935
124	NC_020544	GCA	2	6	14061	14066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433935
125	NC_020544	GCG	2	6	14128	14133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433935
126	NC_020544	CTG	2	6	14196	14201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433935
127	NC_020544	GAT	2	6	14216	14221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433935
128	NC_020544	CTT	2	6	14289	14294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433935
129	NC_020544	GCC	2	6	14340	14345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433935
130	NC_020544	CCG	2	6	14371	14376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433935
131	NC_020544	GCA	2	6	14435	14440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433935
132	NC_020544	GCC	2	6	14467	14472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433935
133	NC_020544	TGC	2	6	14557	14562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433936
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145	NC_020544	GGC	2	6	15348	15353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433937
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150	NC_020544	TGC	2	6	15694	15699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433937
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153	NC_020544	GCT	2	6	15755	15760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433937
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157	NC_020544	ATT	2	6	16158	16163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472433938
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161	NC_020544	CGG	2	6	16360	16365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433938
162	NC_020544	TCT	2	6	16372	16377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433938
163	NC_020544	CCG	2	6	16380	16385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433938
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239	NC_020544	TCG	2	6	24437	24442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433948
240	NC_020544	CGC	2	6	24583	24588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433948
241	NC_020544	TTC	2	6	24704	24709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433948
242	NC_020544	ATG	2	6	24740	24745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433948
243	NC_020544	GAT	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433948
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247	NC_020544	TGA	2	6	25474	25479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433949
248	NC_020544	GCG	2	6	25564	25569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433949
249	NC_020544	ATG	2	6	25659	25664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433949
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251	NC_020544	TTG	2	6	25785	25790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433949
252	NC_020544	CGG	2	6	25795	25800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433949
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375	NC_020544	TGA	2	6	34158	34163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433958
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378	NC_020544	TGA	2	6	34395	34400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433958
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382	NC_020544	CTG	2	6	34616	34621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433958
383	NC_020544	CAT	2	6	34660	34665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433958
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485	NC_020544	CAG	2	6	43495	43500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433968
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