MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020544	CG	3	6	168	173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020544	CG	3	6	272	277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020544	CG	3	6	529	534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020544	CG	3	6	776	781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020544	GC	3	6	1735	1740	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
6	NC_020544	GC	3	6	1967	1972	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
7	NC_020544	GC	3	6	1990	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
8	NC_020544	CG	4	8	2013	2020	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
9	NC_020544	CG	3	6	2506	2511	0 %	0 %	50 %	50 %	472433927
10	NC_020544	GC	4	8	2861	2868	0 %	0 %	50 %	50 %	472433927
11	NC_020544	GC	3	6	3754	3759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020544	GC	3	6	4016	4021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020544	GC	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020544	CG	3	6	4964	4969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020544	AT	3	6	5267	5272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020544	GC	3	6	5664	5669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020544	CT	3	6	5771	5776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020544	GC	3	6	5997	6002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020544	GC	3	6	6040	6045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020544	GC	3	6	6193	6198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020544	AT	3	6	6530	6535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020544	CG	3	6	6623	6628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020544	GC	3	6	6860	6865	0 %	0 %	50 %	50 %	472433929
24	NC_020544	GC	3	6	7295	7300	0 %	0 %	50 %	50 %	472433929
25	NC_020544	GC	3	6	7340	7345	0 %	0 %	50 %	50 %	472433929
26	NC_020544	GC	3	6	8254	8259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020544	TC	3	6	8320	8325	0 %	50 %	0 %	50 %	472433931
28	NC_020544	CA	3	6	8525	8530	50 %	0 %	0 %	50 %	472433931
29	NC_020544	GC	3	6	8591	8596	0 %	0 %	50 %	50 %	472433931
30	NC_020544	GC	3	6	8720	8725	0 %	0 %	50 %	50 %	472433931
31	NC_020544	GC	3	6	8929	8934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020544	CG	3	6	9197	9202	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
33	NC_020544	CG	3	6	9442	9447	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
34	NC_020544	GC	3	6	11397	11402	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
35	NC_020544	TC	3	6	11417	11422	0 %	50 %	0 %	50 %	472433932
36	NC_020544	CG	3	6	11659	11664	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
37	NC_020544	GC	3	6	12140	12145	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
38	NC_020544	GT	3	6	12187	12192	0 %	50 %	50 %	0 %	472433933
39	NC_020544	CG	3	6	12392	12397	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
40	NC_020544	GC	3	6	12435	12440	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
41	NC_020544	GC	3	6	13009	13014	0 %	0 %	50 %	50 %	472433934
42	NC_020544	TC	3	6	14070	14075	0 %	50 %	0 %	50 %	472433935
43	NC_020544	CG	3	6	14364	14369	0 %	0 %	50 %	50 %	472433935
44	NC_020544	CT	3	6	15026	15031	0 %	50 %	0 %	50 %	472433936
45	NC_020544	CG	3	6	15150	15155	0 %	0 %	50 %	50 %	472433936
46	NC_020544	GA	3	6	15522	15527	50 %	0 %	50 %	0 %	472433937
47	NC_020544	GC	3	6	15771	15776	0 %	0 %	50 %	50 %	472433937
48	NC_020544	AC	3	6	15830	15835	50 %	0 %	0 %	50 %	472433937
49	NC_020544	CA	3	6	16518	16523	50 %	0 %	0 %	50 %	472433938
50	NC_020544	CG	3	6	16861	16866	0 %	0 %	50 %	50 %	472433938
51	NC_020544	CT	3	6	17228	17233	0 %	50 %	0 %	50 %	472433940
52	NC_020544	GA	3	6	18036	18041	50 %	0 %	50 %	0 %	472433940
53	NC_020544	CG	3	6	18272	18277	0 %	0 %	50 %	50 %	472433941
54	NC_020544	AC	3	6	18641	18646	50 %	0 %	0 %	50 %	472433941
55	NC_020544	CG	3	6	18887	18892	0 %	0 %	50 %	50 %	472433942
56	NC_020544	CG	3	6	19105	19110	0 %	0 %	50 %	50 %	472433942
57	NC_020544	CG	3	6	19953	19958	0 %	0 %	50 %	50 %	472433943
58	NC_020544	CA	3	6	20075	20080	50 %	0 %	0 %	50 %	472433943
59	NC_020544	CG	3	6	20459	20464	0 %	0 %	50 %	50 %	472433944
60	NC_020544	GC	3	6	20859	20864	0 %	0 %	50 %	50 %	472433944
61	NC_020544	GC	4	8	21679	21686	0 %	0 %	50 %	50 %	472433945
62	NC_020544	TC	3	6	22662	22667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020544	CG	3	6	22933	22938	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
64	NC_020544	CG	4	8	23060	23067	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
65	NC_020544	CG	3	6	23279	23284	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
66	NC_020544	GC	3	6	23308	23313	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
67	NC_020544	CG	3	6	23359	23364	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
68	NC_020544	GC	3	6	23696	23701	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
69	NC_020544	CG	3	6	23721	23726	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
70	NC_020544	CG	3	6	23860	23865	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
71	NC_020544	CG	3	6	23956	23961	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
72	NC_020544	CG	3	6	23993	23998	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
73	NC_020544	CG	3	6	24256	24261	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
74	NC_020544	CG	3	6	24408	24413	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
75	NC_020544	CG	3	6	24767	24772	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
76	NC_020544	CG	3	6	24831	24836	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
77	NC_020544	CG	3	6	24954	24959	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
78	NC_020544	CG	3	6	25260	25265	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
79	NC_020544	CG	3	6	25413	25418	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
80	NC_020544	CG	3	6	25691	25696	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
81	NC_020544	CG	3	6	26055	26060	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
82	NC_020544	GC	3	6	26956	26961	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
83	NC_020544	CG	4	8	26968	26975	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
84	NC_020544	GC	3	6	27016	27021	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
85	NC_020544	GC	3	6	27213	27218	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
86	NC_020544	GC	3	6	27486	27491	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
87	NC_020544	CG	4	8	27954	27961	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
88	NC_020544	GC	3	6	27988	27993	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
89	NC_020544	GC	3	6	28280	28285	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
90	NC_020544	GC	3	6	28371	28376	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
91	NC_020544	GC	3	6	28899	28904	0 %	0 %	50 %	50 %	472433950
92	NC_020544	GC	4	8	28942	28949	0 %	0 %	50 %	50 %	472433950
93	NC_020544	GC	4	8	29417	29424	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
94	NC_020544	CG	3	6	29486	29491	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
95	NC_020544	CG	4	8	29692	29699	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
96	NC_020544	GT	3	6	30001	30006	0 %	50 %	50 %	0 %	472433951
97	NC_020544	TG	3	6	30663	30668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020544	GC	3	6	30960	30965	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
99	NC_020544	CG	3	6	30994	30999	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
100	NC_020544	CG	3	6	31212	31217	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
101	NC_020544	GC	3	6	31343	31348	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
102	NC_020544	CG	3	6	31624	31629	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
103	NC_020544	CG	3	6	31706	31711	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
104	NC_020544	GC	3	6	31956	31961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020544	CT	3	6	31969	31974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020544	GA	3	6	32073	32078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020544	GC	3	6	32275	32280	0 %	0 %	50 %	50 %	472433953
108	NC_020544	GC	3	6	32527	32532	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
109	NC_020544	GC	3	6	32553	32558	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
110	NC_020544	GC	3	6	32600	32605	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
111	NC_020544	GA	3	6	32627	32632	50 %	0 %	50 %	0 %	472433954
112	NC_020544	CG	3	6	32678	32683	0 %	0 %	50 %	50 %	472433955
113	NC_020544	CG	3	6	32694	32699	0 %	0 %	50 %	50 %	472433955
114	NC_020544	CG	4	8	33291	33298	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
115	NC_020544	CG	3	6	33491	33496	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
116	NC_020544	CG	3	6	33644	33649	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
117	NC_020544	GC	3	6	33687	33692	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
118	NC_020544	CG	3	6	33904	33909	0 %	0 %	50 %	50 %	472433957
119	NC_020544	CT	3	6	33936	33941	0 %	50 %	0 %	50 %	472433957
120	NC_020544	GC	3	6	34044	34049	0 %	0 %	50 %	50 %	472433957
121	NC_020544	CG	3	6	34187	34192	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
122	NC_020544	GC	3	6	34205	34210	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
123	NC_020544	CG	3	6	34213	34218	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
124	NC_020544	GC	3	6	34435	34440	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
125	NC_020544	CG	3	6	35101	35106	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
126	NC_020544	GC	4	8	35348	35355	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
127	NC_020544	GC	3	6	35431	35436	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
128	NC_020544	CG	3	6	35501	35506	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
129	NC_020544	CG	3	6	35642	35647	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
130	NC_020544	CG	3	6	35692	35697	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
131	NC_020544	GA	3	6	35962	35967	50 %	0 %	50 %	0 %	472433959
132	NC_020544	GC	3	6	36164	36169	0 %	0 %	50 %	50 %	472433959
133	NC_020544	CG	3	6	37024	37029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020544	GC	3	6	37901	37906	0 %	0 %	50 %	50 %	472433960
135	NC_020544	GC	3	6	39171	39176	0 %	0 %	50 %	50 %	472433962
136	NC_020544	GC	3	6	39437	39442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020544	GC	3	6	39595	39600	0 %	0 %	50 %	50 %	472433963
138	NC_020544	GC	3	6	39770	39775	0 %	0 %	50 %	50 %	472433963
139	NC_020544	CG	3	6	40034	40039	0 %	0 %	50 %	50 %	472433963
140	NC_020544	CG	3	6	40186	40191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020544	GA	3	6	40203	40208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020544	CG	3	6	40712	40717	0 %	0 %	50 %	50 %	472433964
143	NC_020544	CG	3	6	40735	40740	0 %	0 %	50 %	50 %	472433964
144	NC_020544	GC	3	6	40759	40764	0 %	0 %	50 %	50 %	472433964
145	NC_020544	AG	3	6	40838	40843	50 %	0 %	50 %	0 %	472433965
146	NC_020544	GC	3	6	41077	41082	0 %	0 %	50 %	50 %	472433965
147	NC_020544	CG	4	8	41234	41241	0 %	0 %	50 %	50 %	472433966
148	NC_020544	CG	3	6	41262	41267	0 %	0 %	50 %	50 %	472433966
149	NC_020544	GC	3	6	41471	41476	0 %	0 %	50 %	50 %	472433966
150	NC_020544	GC	3	6	41653	41658	0 %	0 %	50 %	50 %	472433967
151	NC_020544	CA	3	6	42338	42343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020544	GA	3	6	42601	42606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020544	GT	3	6	42734	42739	0 %	50 %	50 %	0 %	472433968
154	NC_020544	CG	3	6	42766	42771	0 %	0 %	50 %	50 %	472433968
155	NC_020544	GC	3	6	42807	42812	0 %	0 %	50 %	50 %	472433968
156	NC_020544	GA	3	6	43376	43381	50 %	0 %	50 %	0 %	472433968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.