MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020544	GC	3	6	1735	1740	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
2	NC_020544	GC	3	6	1967	1972	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
3	NC_020544	GC	3	6	1990	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
4	NC_020544	CG	4	8	2013	2020	0 %	0 %	50 %	50 %	472433926
5	NC_020544	CG	3	6	2506	2511	0 %	0 %	50 %	50 %	472433927
6	NC_020544	GC	4	8	2861	2868	0 %	0 %	50 %	50 %	472433927
7	NC_020544	GC	3	6	6860	6865	0 %	0 %	50 %	50 %	472433929
8	NC_020544	GC	3	6	7295	7300	0 %	0 %	50 %	50 %	472433929
9	NC_020544	GC	3	6	7340	7345	0 %	0 %	50 %	50 %	472433929
10	NC_020544	TC	3	6	8320	8325	0 %	50 %	0 %	50 %	472433931
11	NC_020544	CA	3	6	8525	8530	50 %	0 %	0 %	50 %	472433931
12	NC_020544	GC	3	6	8591	8596	0 %	0 %	50 %	50 %	472433931
13	NC_020544	GC	3	6	8720	8725	0 %	0 %	50 %	50 %	472433931
14	NC_020544	CG	3	6	9197	9202	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
15	NC_020544	CG	3	6	9442	9447	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
16	NC_020544	GC	3	6	11397	11402	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
17	NC_020544	TC	3	6	11417	11422	0 %	50 %	0 %	50 %	472433932
18	NC_020544	CG	3	6	11659	11664	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
19	NC_020544	GC	3	6	12140	12145	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
20	NC_020544	GT	3	6	12187	12192	0 %	50 %	50 %	0 %	472433933
21	NC_020544	CG	3	6	12392	12397	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
22	NC_020544	GC	3	6	12435	12440	0 %	0 %	50 %	50 %	472433933
23	NC_020544	GC	3	6	13009	13014	0 %	0 %	50 %	50 %	472433934
24	NC_020544	TC	3	6	14070	14075	0 %	50 %	0 %	50 %	472433935
25	NC_020544	CG	3	6	14364	14369	0 %	0 %	50 %	50 %	472433935
26	NC_020544	CT	3	6	15026	15031	0 %	50 %	0 %	50 %	472433936
27	NC_020544	CG	3	6	15150	15155	0 %	0 %	50 %	50 %	472433936
28	NC_020544	GA	3	6	15522	15527	50 %	0 %	50 %	0 %	472433937
29	NC_020544	GC	3	6	15771	15776	0 %	0 %	50 %	50 %	472433937
30	NC_020544	AC	3	6	15830	15835	50 %	0 %	0 %	50 %	472433937
31	NC_020544	CA	3	6	16518	16523	50 %	0 %	0 %	50 %	472433938
32	NC_020544	CG	3	6	16861	16866	0 %	0 %	50 %	50 %	472433938
33	NC_020544	CT	3	6	17228	17233	0 %	50 %	0 %	50 %	472433940
34	NC_020544	GA	3	6	18036	18041	50 %	0 %	50 %	0 %	472433940
35	NC_020544	CG	3	6	18272	18277	0 %	0 %	50 %	50 %	472433941
36	NC_020544	AC	3	6	18641	18646	50 %	0 %	0 %	50 %	472433941
37	NC_020544	CG	3	6	18887	18892	0 %	0 %	50 %	50 %	472433942
38	NC_020544	CG	3	6	19105	19110	0 %	0 %	50 %	50 %	472433942
39	NC_020544	CG	3	6	19953	19958	0 %	0 %	50 %	50 %	472433943
40	NC_020544	CA	3	6	20075	20080	50 %	0 %	0 %	50 %	472433943
41	NC_020544	CG	3	6	20459	20464	0 %	0 %	50 %	50 %	472433944
42	NC_020544	GC	3	6	20859	20864	0 %	0 %	50 %	50 %	472433944
43	NC_020544	GC	4	8	21679	21686	0 %	0 %	50 %	50 %	472433945
44	NC_020544	CG	3	6	22933	22938	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
45	NC_020544	CG	4	8	23060	23067	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
46	NC_020544	CG	3	6	23279	23284	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
47	NC_020544	GC	3	6	23308	23313	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
48	NC_020544	CG	3	6	23359	23364	0 %	0 %	50 %	50 %	472433947
49	NC_020544	GC	3	6	23696	23701	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
50	NC_020544	CG	3	6	23721	23726	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
51	NC_020544	CG	3	6	23860	23865	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
52	NC_020544	CG	3	6	23956	23961	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
53	NC_020544	CG	3	6	23993	23998	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
54	NC_020544	CG	3	6	24256	24261	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
55	NC_020544	CG	3	6	24408	24413	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
56	NC_020544	CG	3	6	24767	24772	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
57	NC_020544	CG	3	6	24831	24836	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
58	NC_020544	CG	3	6	24954	24959	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
59	NC_020544	CG	3	6	25260	25265	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
60	NC_020544	CG	3	6	25413	25418	0 %	0 %	50 %	50 %	472433948
61	NC_020544	CG	3	6	25691	25696	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
62	NC_020544	CG	3	6	26055	26060	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
63	NC_020544	GC	3	6	26956	26961	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
64	NC_020544	CG	4	8	26968	26975	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
65	NC_020544	GC	3	6	27016	27021	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
66	NC_020544	GC	3	6	27213	27218	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
67	NC_020544	GC	3	6	27486	27491	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
68	NC_020544	CG	4	8	27954	27961	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
69	NC_020544	GC	3	6	27988	27993	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
70	NC_020544	GC	3	6	28280	28285	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
71	NC_020544	GC	3	6	28371	28376	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
72	NC_020544	GC	3	6	28899	28904	0 %	0 %	50 %	50 %	472433950
73	NC_020544	GC	4	8	28942	28949	0 %	0 %	50 %	50 %	472433950
74	NC_020544	GC	4	8	29417	29424	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
75	NC_020544	CG	3	6	29486	29491	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
76	NC_020544	CG	4	8	29692	29699	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
77	NC_020544	GT	3	6	30001	30006	0 %	50 %	50 %	0 %	472433951
78	NC_020544	GC	3	6	30960	30965	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
79	NC_020544	CG	3	6	30994	30999	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
80	NC_020544	CG	3	6	31212	31217	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
81	NC_020544	GC	3	6	31343	31348	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
82	NC_020544	CG	3	6	31624	31629	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
83	NC_020544	CG	3	6	31706	31711	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
84	NC_020544	GC	3	6	32275	32280	0 %	0 %	50 %	50 %	472433953
85	NC_020544	GC	3	6	32527	32532	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
86	NC_020544	GC	3	6	32553	32558	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
87	NC_020544	GC	3	6	32600	32605	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
88	NC_020544	GA	3	6	32627	32632	50 %	0 %	50 %	0 %	472433954
89	NC_020544	CG	3	6	32678	32683	0 %	0 %	50 %	50 %	472433955
90	NC_020544	CG	3	6	32694	32699	0 %	0 %	50 %	50 %	472433955
91	NC_020544	CG	4	8	33291	33298	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
92	NC_020544	CG	3	6	33491	33496	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
93	NC_020544	CG	3	6	33644	33649	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
94	NC_020544	GC	3	6	33687	33692	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
95	NC_020544	CG	3	6	33904	33909	0 %	0 %	50 %	50 %	472433957
96	NC_020544	CT	3	6	33936	33941	0 %	50 %	0 %	50 %	472433957
97	NC_020544	GC	3	6	34044	34049	0 %	0 %	50 %	50 %	472433957
98	NC_020544	CG	3	6	34187	34192	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
99	NC_020544	GC	3	6	34205	34210	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
100	NC_020544	CG	3	6	34213	34218	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
101	NC_020544	GC	3	6	34435	34440	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
102	NC_020544	CG	3	6	35101	35106	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
103	NC_020544	GC	4	8	35348	35355	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
104	NC_020544	GC	3	6	35431	35436	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
105	NC_020544	CG	3	6	35501	35506	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
106	NC_020544	CG	3	6	35642	35647	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
107	NC_020544	CG	3	6	35692	35697	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
108	NC_020544	GA	3	6	35962	35967	50 %	0 %	50 %	0 %	472433959
109	NC_020544	GC	3	6	36164	36169	0 %	0 %	50 %	50 %	472433959
110	NC_020544	GC	3	6	37901	37906	0 %	0 %	50 %	50 %	472433960
111	NC_020544	GC	3	6	39171	39176	0 %	0 %	50 %	50 %	472433962
112	NC_020544	GC	3	6	39595	39600	0 %	0 %	50 %	50 %	472433963
113	NC_020544	GC	3	6	39770	39775	0 %	0 %	50 %	50 %	472433963
114	NC_020544	CG	3	6	40034	40039	0 %	0 %	50 %	50 %	472433963
115	NC_020544	CG	3	6	40712	40717	0 %	0 %	50 %	50 %	472433964
116	NC_020544	CG	3	6	40735	40740	0 %	0 %	50 %	50 %	472433964
117	NC_020544	GC	3	6	40759	40764	0 %	0 %	50 %	50 %	472433964
118	NC_020544	AG	3	6	40838	40843	50 %	0 %	50 %	0 %	472433965
119	NC_020544	GC	3	6	41077	41082	0 %	0 %	50 %	50 %	472433965
120	NC_020544	CG	4	8	41234	41241	0 %	0 %	50 %	50 %	472433966
121	NC_020544	CG	3	6	41262	41267	0 %	0 %	50 %	50 %	472433966
122	NC_020544	GC	3	6	41471	41476	0 %	0 %	50 %	50 %	472433966
123	NC_020544	GC	3	6	41653	41658	0 %	0 %	50 %	50 %	472433967
124	NC_020544	GT	3	6	42734	42739	0 %	50 %	50 %	0 %	472433968
125	NC_020544	CG	3	6	42766	42771	0 %	0 %	50 %	50 %	472433968
126	NC_020544	GC	3	6	42807	42812	0 %	0 %	50 %	50 %	472433968
127	NC_020544	GA	3	6	43376	43381	50 %	0 %	50 %	0 %	472433968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.