MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP2

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020543	GGCCT	2	10	1516	1525	0 %	20 %	40 %	40 %	472434167
2	NC_020543	ATCGC	2	10	1607	1616	20 %	20 %	20 %	40 %	472434167
3	NC_020543	GCCCA	2	10	2471	2480	20 %	0 %	20 %	60 %	472434168
4	NC_020543	GCCAT	2	10	2843	2852	20 %	20 %	20 %	40 %	472434169
5	NC_020543	CGCAG	2	10	2925	2934	20 %	0 %	40 %	40 %	472434169
6	NC_020543	GCGCC	2	10	3901	3910	0 %	0 %	40 %	60 %	472434172
7	NC_020543	GCGGA	2	10	4526	4535	20 %	0 %	60 %	20 %	472434174
8	NC_020543	GTGAT	2	10	5344	5353	20 %	40 %	40 %	0 %	472434176
9	NC_020543	ATCGG	2	10	5757	5766	20 %	20 %	40 %	20 %	472434177
10	NC_020543	CCCGC	2	10	5824	5833	0 %	0 %	20 %	80 %	472434177
11	NC_020543	GTGAT	2	10	7406	7415	20 %	40 %	40 %	0 %	472434179
12	NC_020543	CGCTG	2	10	8712	8721	0 %	20 %	40 %	40 %	472434180
13	NC_020543	GACGG	2	10	9411	9420	20 %	0 %	60 %	20 %	472434181
14	NC_020543	CGGCG	2	10	9686	9695	0 %	0 %	60 %	40 %	472434181
15	NC_020543	GAATG	2	10	10898	10907	40 %	20 %	40 %	0 %	472434181
16	NC_020543	CCGAT	2	10	12425	12434	20 %	20 %	20 %	40 %	472434182
17	NC_020543	CAGGG	2	10	13182	13191	20 %	0 %	60 %	20 %	472434183
18	NC_020543	CCCGT	2	10	14046	14055	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_020543	ACGAT	2	10	14131	14140	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020543	GGGCC	2	10	14513	14522	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_020543	GCGCG	2	10	18056	18065	0 %	0 %	60 %	40 %	472434189
22	NC_020543	GACCA	2	10	18660	18669	40 %	0 %	20 %	40 %	472434191
23	NC_020543	CGCGG	2	10	19988	19997	0 %	0 %	60 %	40 %	472434192
24	NC_020543	CTGCG	2	10	20363	20372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020543	ATGCG	2	10	20869	20878	20 %	20 %	40 %	20 %	472434193
26	NC_020543	AGGCG	2	10	22175	22184	20 %	0 %	60 %	20 %	472434194
27	NC_020543	GCCGC	2	10	23112	23121	0 %	0 %	40 %	60 %	472434194
28	NC_020543	TTCCT	2	10	23308	23317	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020543	ACGGA	2	10	23681	23690	40 %	0 %	40 %	20 %	472434195
30	NC_020543	ACGCG	2	10	25065	25074	20 %	0 %	40 %	40 %	472434198
31	NC_020543	TGGCA	2	10	25567	25576	20 %	20 %	40 %	20 %	472434198
32	NC_020543	CGTGC	2	10	26231	26240	0 %	20 %	40 %	40 %	472434199
33	NC_020543	ATGCG	2	10	26579	26588	20 %	20 %	40 %	20 %	472434199
34	NC_020543	GGGAA	2	10	27264	27273	40 %	0 %	60 %	0 %	472434200
35	NC_020543	CGGAT	2	10	27615	27624	20 %	20 %	40 %	20 %	472434200
36	NC_020543	ATCGA	2	10	27906	27915	40 %	20 %	20 %	20 %	472434200
37	NC_020543	TCTGC	2	10	30004	30013	0 %	40 %	20 %	40 %	472434200
38	NC_020543	TCTCG	2	10	32636	32645	0 %	40 %	20 %	40 %	472434200
39	NC_020543	GGTGC	2	10	32798	32807	0 %	20 %	60 %	20 %	472434200
40	NC_020543	GCGCA	2	10	34070	34079	20 %	0 %	40 %	40 %	472434200
41	NC_020543	TCCCA	2	10	34167	34176	20 %	20 %	0 %	60 %	472434200
42	NC_020543	ACCGG	2	10	36856	36865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020543	CGGGC	2	10	38297	38306	0 %	0 %	60 %	40 %	472434202
44	NC_020543	CATCG	2	10	38769	38778	20 %	20 %	20 %	40 %	472434202
45	NC_020543	GTCGC	2	10	42417	42426	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_020543	GGCGC	2	10	42868	42877	0 %	0 %	60 %	40 %	472434206
47	NC_020543	TCCCA	2	10	43686	43695	20 %	20 %	0 %	60 %	472434207
48	NC_020543	CAGCG	2	10	43965	43974	20 %	0 %	40 %	40 %	472434207
49	NC_020543	TCGCC	2	10	44365	44374	0 %	20 %	20 %	60 %	472434207
50	NC_020543	AACCA	2	10	44542	44551	60 %	0 %	0 %	40 %	472434207
51	NC_020543	GCGCG	2	10	44596	44605	0 %	0 %	60 %	40 %	472434207
52	NC_020543	CATCG	2	10	45296	45305	20 %	20 %	20 %	40 %	472434207
53	NC_020543	CCGGC	2	10	45321	45330	0 %	0 %	40 %	60 %	472434207
54	NC_020543	CGGTG	2	10	45417	45426	0 %	20 %	60 %	20 %	472434207
55	NC_020543	CGGGC	2	10	45723	45732	0 %	0 %	60 %	40 %	472434207
56	NC_020543	AAGCG	2	10	45872	45881	40 %	0 %	40 %	20 %	472434207
57	NC_020543	GCGCC	2	10	46740	46749	0 %	0 %	40 %	60 %	472434208
58	NC_020543	ATCAC	2	10	48444	48453	40 %	20 %	0 %	40 %	472434209
59	NC_020543	ACGCC	2	10	49449	49458	20 %	0 %	20 %	60 %	472434212
60	NC_020543	CTGGC	2	10	49795	49804	0 %	20 %	40 %	40 %	472434212
61	NC_020543	CCCGG	2	10	51147	51156	0 %	0 %	40 %	60 %	472434214
62	NC_020543	GCGCC	2	10	51962	51971	0 %	0 %	40 %	60 %	472434214

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.