MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020542	CG	3	6	138	143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020542	GC	3	6	333	338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020542	GC	3	6	1003	1008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020542	CG	3	6	1118	1123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020542	GC	3	6	1402	1407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020542	CG	4	8	1674	1681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020542	TG	3	6	2157	2162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020542	CG	3	6	3883	3888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020542	GC	3	6	9325	9330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020542	GC	3	6	18541	18546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020542	GC	3	6	18644	18649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020542	GC	3	6	22715	22720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020542	CT	3	6	34654	34659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020542	AT	3	6	41877	41882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020542	AT	3	6	41887	41892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020542	CG	3	6	43610	43615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020542	AG	3	6	45202	45207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020542	GC	3	6	45215	45220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020542	CG	4	8	49300	49307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020542	CG	3	6	49452	49457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020542	GC	4	8	49583	49590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020542	CT	3	6	50278	50283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020542	GC	3	6	54520	54525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020542	CG	3	6	54545	54550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020542	TA	3	6	54637	54642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020542	GC	3	6	55128	55133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020542	CG	3	6	55170	55175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020542	GA	3	6	55396	55401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020542	CG	3	6	55503	55508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020542	AT	3	6	55901	55906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020542	CG	3	6	56204	56209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020542	CG	3	6	56574	56579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020542	CG	3	6	57151	57156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020542	GC	3	6	57414	57419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020542	CA	3	6	58540	58545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020542	GC	3	6	58605	58610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020542	CG	3	6	62690	62695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020542	CG	3	6	62722	62727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020542	AG	3	6	68753	68758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020542	CG	3	6	72577	72582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020542	GC	3	6	72631	72636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020542	CG	3	6	72710	72715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020542	CT	3	6	72799	72804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020542	CG	3	6	72926	72931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020542	AT	3	6	73800	73805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020542	CG	3	6	74451	74456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020542	TA	3	6	75111	75116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020542	AC	3	6	90682	90687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020542	GC	3	6	90741	90746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020542	CG	3	6	96776	96781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020542	GC	3	6	97214	97219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020542	GC	3	6	97562	97567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020542	GA	3	6	104157	104162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020542	GC	3	6	104913	104918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020542	GC	3	6	105175	105180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020542	GC	3	6	105752	105757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020542	CG	3	6	106123	106128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020542	AT	3	6	106426	106431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020542	GC	3	6	106823	106828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020542	CT	3	6	106930	106935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020542	GC	3	6	107156	107161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020542	GC	3	6	107199	107204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020542	GC	3	6	107352	107357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020542	AT	3	6	107689	107694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020542	CG	3	6	107782	107787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020542	CT	3	6	111327	111332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020542	GC	3	6	113181	113186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020542	GC	3	6	114474	114479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020542	TC	3	6	116764	116769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020542	GA	3	6	118917	118922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020542	TC	6	12	119040	119051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020542	TG	3	6	119705	119710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020542	GC	3	6	119840	119845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020542	CT	3	6	121405	121410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020542	GC	3	6	121531	121536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020542	GC	3	6	122625	122630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020542	GA	4	8	132899	132906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020542	CT	3	6	140638	140643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020542	GC	3	6	142683	142688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020542	GC	3	6	142726	142731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020542	TA	3	6	145262	145267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020542	CG	3	6	148826	148831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020542	CG	3	6	149764	149769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020542	CG	3	6	149970	149975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020542	CT	3	6	153570	153575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020542	TC	3	6	154880	154885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020542	GA	4	8	160584	160591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020542	GC	4	8	165080	165087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020542	AT	3	6	165091	165096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020542	AT	3	6	165150	165155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020542	AT	3	6	165165	165170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020542	GC	3	6	171008	171013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020542	CG	4	8	182077	182084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020542	GA	3	6	182104	182109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020542	GC	3	6	186442	186447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020542	GC	3	6	186449	186454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020542	GC	3	6	187032	187037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020542	CG	3	6	187053	187058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020542	CG	3	6	187094	187099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020542	GC	3	6	189821	189826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020542	CT	3	6	190244	190249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020542	CT	3	6	192982	192987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020542	CT	3	6	203424	203429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020542	GC	3	6	203641	203646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020542	CG	3	6	204807	204812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020542	TC	3	6	208168	208173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020542	AT	3	6	245633	245638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020542	AT	3	6	245664	245669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020542	AT	3	6	251241	251246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020542	CG	3	6	251529	251534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020542	AC	3	6	254971	254976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020542	GC	3	6	256260	256265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020542	CG	3	6	256858	256863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020542	AG	3	6	259027	259032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020542	AC	3	6	269324	269329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020542	CT	3	6	269946	269951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020542	CG	3	6	272006	272011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.