MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodanobacter sp. 2APBS1

Total Repeats: 3912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020541	CCGGG	2	10	571	580	0 %	0 %	60 %	40 %	469816340
2	NC_020541	GGCTG	2	10	944	953	0 %	20 %	60 %	20 %	469816340
3	NC_020541	CCCGA	2	10	5108	5117	20 %	0 %	20 %	60 %	469816343
4	NC_020541	CCGCG	2	10	6485	6494	0 %	0 %	40 %	60 %	469816343
5	NC_020541	ACGCG	2	10	6870	6879	20 %	0 %	40 %	40 %	469816344
6	NC_020541	TCGGC	2	10	7279	7288	0 %	20 %	40 %	40 %	469816344
7	NC_020541	GATCC	2	10	10361	10370	20 %	20 %	20 %	40 %	469816348
8	NC_020541	GCGCG	2	10	11333	11342	0 %	0 %	60 %	40 %	469816349
9	NC_020541	GGCCT	2	10	12433	12442	0 %	20 %	40 %	40 %	469816351
10	NC_020541	GGCGC	2	10	13517	13526	0 %	0 %	60 %	40 %	469816351
11	NC_020541	GCACG	2	10	13698	13707	20 %	0 %	40 %	40 %	469816351
12	NC_020541	GGCGC	2	10	14583	14592	0 %	0 %	60 %	40 %	469816351
13	NC_020541	TCCAG	2	10	18424	18433	20 %	20 %	20 %	40 %	469816353
14	NC_020541	GCTCG	2	10	18749	18758	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_020541	TCCAG	2	10	19730	19739	20 %	20 %	20 %	40 %	469816354
16	NC_020541	ATGCC	2	10	22357	22366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_020541	GGCGA	2	10	23221	23230	20 %	0 %	60 %	20 %	469816357
18	NC_020541	CGCGC	2	10	25143	25152	0 %	0 %	40 %	60 %	469816359
19	NC_020541	CAGCA	2	10	26149	26158	40 %	0 %	20 %	40 %	469816360
20	NC_020541	GCGCG	2	10	26213	26222	0 %	0 %	60 %	40 %	469816360
21	NC_020541	GCACA	2	10	26752	26761	40 %	0 %	20 %	40 %	469816360
22	NC_020541	GCCCG	2	10	26963	26972	0 %	0 %	40 %	60 %	469816360
23	NC_020541	CTGCA	2	10	27200	27209	20 %	20 %	20 %	40 %	469816360
24	NC_020541	CAGCG	2	10	27235	27244	20 %	0 %	40 %	40 %	469816360
25	NC_020541	GCGAG	2	10	27712	27721	20 %	0 %	60 %	20 %	469816361
26	NC_020541	GCCAG	2	10	27880	27889	20 %	0 %	40 %	40 %	469816361
27	NC_020541	TGGCG	2	10	30237	30246	0 %	20 %	60 %	20 %	469816363
28	NC_020541	AGGCG	2	10	30429	30438	20 %	0 %	60 %	20 %	469816363
29	NC_020541	ACGGC	2	10	30815	30824	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_020541	CTTCG	2	10	31437	31446	0 %	40 %	20 %	40 %	469816364
31	NC_020541	GCAGC	2	10	32431	32440	20 %	0 %	40 %	40 %	469816365
32	NC_020541	CGGCG	2	10	32802	32811	0 %	0 %	60 %	40 %	469816365
33	NC_020541	GACAC	2	10	33962	33971	40 %	0 %	20 %	40 %	469816368
34	NC_020541	GCGCC	2	10	35526	35535	0 %	0 %	40 %	60 %	469816370
35	NC_020541	GACCC	2	10	36095	36104	20 %	0 %	20 %	60 %	469816370
36	NC_020541	TCGGT	2	10	37176	37185	0 %	40 %	40 %	20 %	469816370
37	NC_020541	CGGGC	2	10	38089	38098	0 %	0 %	60 %	40 %	469816372
38	NC_020541	GATCG	2	10	42740	42749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020541	GCGCC	2	10	43378	43387	0 %	0 %	40 %	60 %	469816378
40	NC_020541	GGCGC	2	10	44111	44120	0 %	0 %	60 %	40 %	469816378
41	NC_020541	ACCGC	2	10	44437	44446	20 %	0 %	20 %	60 %	469816378
42	NC_020541	CGCTG	2	10	44992	45001	0 %	20 %	40 %	40 %	469816378
43	NC_020541	CGCGC	2	10	45090	45099	0 %	0 %	40 %	60 %	469816378
44	NC_020541	GGGCC	2	10	45731	45740	0 %	0 %	60 %	40 %	469816378
45	NC_020541	ATCCG	2	10	47191	47200	20 %	20 %	20 %	40 %	469816381
46	NC_020541	CGAGT	2	10	48352	48361	20 %	20 %	40 %	20 %	469816382
47	NC_020541	CGTTG	2	10	49325	49334	0 %	40 %	40 %	20 %	469816384
48	NC_020541	CAGCC	2	10	49877	49886	20 %	0 %	20 %	60 %	469816384
49	NC_020541	GCCGC	2	10	51896	51905	0 %	0 %	40 %	60 %	469816386
50	NC_020541	TGGCG	2	10	52063	52072	0 %	20 %	60 %	20 %	469816386
51	NC_020541	GGCGT	2	10	52115	52124	0 %	20 %	60 %	20 %	469816386
52	NC_020541	CCTGG	2	10	53603	53612	0 %	20 %	40 %	40 %	469816388
53	NC_020541	GGACA	2	10	55340	55349	40 %	0 %	40 %	20 %	469816391
54	NC_020541	CGGCG	2	10	58467	58476	0 %	0 %	60 %	40 %	469816396
55	NC_020541	GCGGT	2	10	59289	59298	0 %	20 %	60 %	20 %	469816397
56	NC_020541	GTGTC	2	10	59746	59755	0 %	40 %	40 %	20 %	469816397
57	NC_020541	TGACG	2	10	62079	62088	20 %	20 %	40 %	20 %	469816400
58	NC_020541	CGGCG	2	10	62274	62283	0 %	0 %	60 %	40 %	469816401
59	NC_020541	CGACG	2	10	62913	62922	20 %	0 %	40 %	40 %	469816402
60	NC_020541	CCGCG	2	10	63657	63666	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_020541	ATCGC	2	10	64105	64114	20 %	20 %	20 %	40 %	469816403
62	NC_020541	GGCGC	2	10	64877	64886	0 %	0 %	60 %	40 %	469816404
63	NC_020541	TCCGG	2	10	64912	64921	0 %	20 %	40 %	40 %	469816404
64	NC_020541	GCGCT	2	10	65246	65255	0 %	20 %	40 %	40 %	469816404
65	NC_020541	AGCAC	2	10	66246	66255	40 %	0 %	20 %	40 %	469816405
66	NC_020541	CACAC	2	10	66369	66378	40 %	0 %	0 %	60 %	469816406
67	NC_020541	GGCGC	2	10	67046	67055	0 %	0 %	60 %	40 %	469816407
68	NC_020541	GAGGT	2	10	71236	71245	20 %	20 %	60 %	0 %	469816408
69	NC_020541	GCCGC	2	10	72611	72620	0 %	0 %	40 %	60 %	469816409
70	NC_020541	CGGCG	2	10	72728	72737	0 %	0 %	60 %	40 %	469816409
71	NC_020541	CTGAC	2	10	72964	72973	20 %	20 %	20 %	40 %	469816409
72	NC_020541	GCCGC	2	10	73567	73576	0 %	0 %	40 %	60 %	469816410
73	NC_020541	GCGCC	2	10	74446	74455	0 %	0 %	40 %	60 %	469816411
74	NC_020541	CGTGG	2	10	76690	76699	0 %	20 %	60 %	20 %	469816414
75	NC_020541	GGGCC	2	10	77124	77133	0 %	0 %	60 %	40 %	469816414
76	NC_020541	CGGCG	2	10	77296	77305	0 %	0 %	60 %	40 %	469816414
77	NC_020541	CGGCG	2	10	77362	77371	0 %	0 %	60 %	40 %	469816414
78	NC_020541	CGGCG	2	10	77707	77716	0 %	0 %	60 %	40 %	469816414
79	NC_020541	CCGGG	2	10	78538	78547	0 %	0 %	60 %	40 %	469816415
80	NC_020541	CCCGA	2	10	79189	79198	20 %	0 %	20 %	60 %	469816415
81	NC_020541	GCCGA	2	10	80399	80408	20 %	0 %	40 %	40 %	469816417
82	NC_020541	ACGCC	2	10	83321	83330	20 %	0 %	20 %	60 %	469816419
83	NC_020541	CTCGC	2	10	83724	83733	0 %	20 %	20 %	60 %	469816420
84	NC_020541	CCGCG	2	10	84049	84058	0 %	0 %	40 %	60 %	469816420
85	NC_020541	GGCGG	2	10	84746	84755	0 %	0 %	80 %	20 %	469816420
86	NC_020541	CGGCC	2	10	85097	85106	0 %	0 %	40 %	60 %	469816420
87	NC_020541	GCATC	2	10	86797	86806	20 %	20 %	20 %	40 %	469816422
88	NC_020541	ATGAC	2	10	88095	88104	40 %	20 %	20 %	20 %	469816423
89	NC_020541	CGGCA	2	10	88628	88637	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_020541	GGCAG	2	10	89891	89900	20 %	0 %	60 %	20 %	469816424
91	NC_020541	CGTTC	2	10	90379	90388	0 %	40 %	20 %	40 %	469816424
92	NC_020541	AGCAC	2	10	94654	94663	40 %	0 %	20 %	40 %	469816427
93	NC_020541	GTCCA	2	10	95891	95900	20 %	20 %	20 %	40 %	469816429
94	NC_020541	CGGAG	2	10	96370	96379	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020541	CGGGC	2	10	96465	96474	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_020541	GCGCC	2	10	97839	97848	0 %	0 %	40 %	60 %	469816430
97	NC_020541	GCAGA	2	10	103549	103558	40 %	0 %	40 %	20 %	469816437
98	NC_020541	CGGCG	2	10	104947	104956	0 %	0 %	60 %	40 %	469816438
99	NC_020541	GTCGC	2	10	105021	105030	0 %	20 %	40 %	40 %	469816438
100	NC_020541	CGCAG	2	10	105871	105880	20 %	0 %	40 %	40 %	469816438
101	NC_020541	GCGCC	2	10	108989	108998	0 %	0 %	40 %	60 %	469816439
102	NC_020541	GCTCG	2	10	109638	109647	0 %	20 %	40 %	40 %	469816439
103	NC_020541	GCGCC	2	10	111363	111372	0 %	0 %	40 %	60 %	469816440
104	NC_020541	CGGCC	2	10	111940	111949	0 %	0 %	40 %	60 %	469816441
105	NC_020541	GCGCC	2	10	113697	113706	0 %	0 %	40 %	60 %	469816443
106	NC_020541	GCACC	2	10	115058	115067	20 %	0 %	20 %	60 %	469816445
107	NC_020541	AGCGC	2	10	115278	115287	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_020541	GCGCG	2	10	116501	116510	0 %	0 %	60 %	40 %	469816447
109	NC_020541	CATGG	2	10	117812	117821	20 %	20 %	40 %	20 %	469816448
110	NC_020541	CTTTT	2	10	118064	118073	0 %	80 %	0 %	20 %	469816449
111	NC_020541	GCCGA	2	10	118124	118133	20 %	0 %	40 %	40 %	469816449
112	NC_020541	GCCGG	2	10	119342	119351	0 %	0 %	60 %	40 %	469816450
113	NC_020541	CGCGC	2	10	119583	119592	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_020541	GGCCG	2	10	122093	122102	0 %	0 %	60 %	40 %	469816452
115	NC_020541	CAGGC	2	10	122325	122334	20 %	0 %	40 %	40 %	469816452
116	NC_020541	CAGGG	2	10	122361	122370	20 %	0 %	60 %	20 %	469816452
117	NC_020541	GCCGT	2	10	122541	122550	0 %	20 %	40 %	40 %	469816452
118	NC_020541	CCGCG	2	10	123531	123540	0 %	0 %	40 %	60 %	469816453
119	NC_020541	CCGCG	2	10	125123	125132	0 %	0 %	40 %	60 %	469816453
120	NC_020541	CGGCG	2	10	126464	126473	0 %	0 %	60 %	40 %	469816455
121	NC_020541	GCCGC	2	10	126715	126724	0 %	0 %	40 %	60 %	469816456
122	NC_020541	CGCGG	2	10	127811	127820	0 %	0 %	60 %	40 %	469816457
123	NC_020541	GCTGG	2	10	129014	129023	0 %	20 %	60 %	20 %	469816459
124	NC_020541	GCCGC	2	10	129980	129989	0 %	0 %	40 %	60 %	469816460
125	NC_020541	ACCCC	2	10	130337	130346	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_020541	GCCAG	2	10	132709	132718	20 %	0 %	40 %	40 %	469816462
127	NC_020541	CTCGA	2	10	134632	134641	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_020541	GCCGG	2	10	135995	136004	0 %	0 %	60 %	40 %	469816465
129	NC_020541	TGCGC	2	10	136120	136129	0 %	20 %	40 %	40 %	469816465
130	NC_020541	GTGCT	2	10	136334	136343	0 %	40 %	40 %	20 %	469816465
131	NC_020541	ATCCG	2	10	136805	136814	20 %	20 %	20 %	40 %	469816467
132	NC_020541	GCACC	2	10	137178	137187	20 %	0 %	20 %	60 %	469816467
133	NC_020541	GGCGT	2	10	140409	140418	0 %	20 %	60 %	20 %	469816469
134	NC_020541	GATCG	2	10	141762	141771	20 %	20 %	40 %	20 %	469816470
135	NC_020541	GCGGG	2	10	142658	142667	0 %	0 %	80 %	20 %	469816470
136	NC_020541	CCGGC	2	10	144075	144084	0 %	0 %	40 %	60 %	469816471
137	NC_020541	TGCCG	2	10	145965	145974	0 %	20 %	40 %	40 %	469816471
138	NC_020541	CGATT	2	10	146647	146656	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020541	CGGCG	2	10	148163	148172	0 %	0 %	60 %	40 %	469816472
140	NC_020541	ACCTG	2	10	148538	148547	20 %	20 %	20 %	40 %	469816472
141	NC_020541	CACGC	2	10	149031	149040	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_020541	TGCGC	2	10	149678	149687	0 %	20 %	40 %	40 %	469816473
143	NC_020541	ACCGC	2	10	152677	152686	20 %	0 %	20 %	60 %	469816474
144	NC_020541	CGGGC	2	10	154277	154286	0 %	0 %	60 %	40 %	469816474
145	NC_020541	GCGCC	2	10	155597	155606	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146	NC_020541	GCCGC	2	10	155634	155643	0 %	0 %	40 %	60 %	469816475
147	NC_020541	CGAGC	2	10	156301	156310	20 %	0 %	40 %	40 %	469816475
148	NC_020541	GCGCA	2	10	156939	156948	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_020541	GCGCC	2	10	159684	159693	0 %	0 %	40 %	60 %	469816478
150	NC_020541	GCTGG	2	10	161550	161559	0 %	20 %	60 %	20 %	469816479
151	NC_020541	CCAGC	2	10	161811	161820	20 %	0 %	20 %	60 %	469816480
152	NC_020541	CGGCC	2	10	162906	162915	0 %	0 %	40 %	60 %	469816480
153	NC_020541	CACCC	2	10	163345	163354	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
154	NC_020541	CTGGT	2	10	164028	164037	0 %	40 %	40 %	20 %	469816481
155	NC_020541	GCGGG	2	10	166812	166821	0 %	0 %	80 %	20 %	469816484
156	NC_020541	TGGCG	2	10	166919	166928	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_020541	CGCGC	3	15	167133	167147	0 %	0 %	40 %	60 %	469816485
158	NC_020541	CGGCG	2	10	167571	167580	0 %	0 %	60 %	40 %	469816485
159	NC_020541	CCAGC	2	10	170091	170100	20 %	0 %	20 %	60 %	469816486
160	NC_020541	CGGCC	3	15	170340	170354	0 %	0 %	40 %	60 %	469816486
161	NC_020541	GGCAG	2	10	172475	172484	20 %	0 %	60 %	20 %	469816488
162	NC_020541	CTGCG	2	10	173853	173862	0 %	20 %	40 %	40 %	469816490
163	NC_020541	GGTGC	2	10	174393	174402	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_020541	CGCGC	2	10	174996	175005	0 %	0 %	40 %	60 %	469816492
165	NC_020541	GCGTG	2	10	175857	175866	0 %	20 %	60 %	20 %	469816493
166	NC_020541	GGCGC	2	10	175897	175906	0 %	0 %	60 %	40 %	469816493
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168	NC_020541	TGGGG	2	10	176647	176656	0 %	20 %	80 %	0 %	469816493
169	NC_020541	GCGCC	2	10	178405	178414	0 %	0 %	40 %	60 %	469816495
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171	NC_020541	TGGTC	2	10	180004	180013	0 %	40 %	40 %	20 %	469816496
172	NC_020541	ATCGC	2	10	180048	180057	20 %	20 %	20 %	40 %	469816496
173	NC_020541	GGTCG	2	10	180302	180311	0 %	20 %	60 %	20 %	469816496
174	NC_020541	GCACC	2	10	180565	180574	20 %	0 %	20 %	60 %	469816496
175	NC_020541	GTCGG	2	10	181243	181252	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
176	NC_020541	GCCAA	2	10	182405	182414	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_020541	CGGCG	2	10	183331	183340	0 %	0 %	60 %	40 %	469816498
178	NC_020541	CGCGG	2	10	185607	185616	0 %	0 %	60 %	40 %	469816499
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181	NC_020541	GCTGG	2	10	188721	188730	0 %	20 %	60 %	20 %	469816500
182	NC_020541	CGGCG	2	10	188857	188866	0 %	0 %	60 %	40 %	469816500
183	NC_020541	TCTCG	2	10	189627	189636	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_020541	GAGAT	2	10	189902	189911	40 %	20 %	40 %	0 %	469816501
185	NC_020541	CTTTG	2	10	190302	190311	0 %	60 %	20 %	20 %	469816501
186	NC_020541	TGCTC	2	10	190727	190736	0 %	40 %	20 %	40 %	469816502
187	NC_020541	CGGCG	2	10	192868	192877	0 %	0 %	60 %	40 %	469816504
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189	NC_020541	CGGCG	2	10	195391	195400	0 %	0 %	60 %	40 %	469816504
190	NC_020541	ACGTT	2	10	195607	195616	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_020541	GCCGC	2	10	196596	196605	0 %	0 %	40 %	60 %	469816505
192	NC_020541	TGGGC	2	10	197522	197531	0 %	20 %	60 %	20 %	469816505
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195	NC_020541	TCGGC	2	10	199291	199300	0 %	20 %	40 %	40 %	469816506
196	NC_020541	CAAGC	2	10	199566	199575	40 %	0 %	20 %	40 %	469816506
197	NC_020541	CGGCT	2	10	200094	200103	0 %	20 %	40 %	40 %	469816506
198	NC_020541	CGGCG	2	10	200280	200289	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
199	NC_020541	CGCCT	2	10	201178	201187	0 %	20 %	20 %	60 %	469816507
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202	NC_020541	CCCGG	2	10	202433	202442	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
203	NC_020541	CGGCG	2	10	202731	202740	0 %	0 %	60 %	40 %	469816508
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221	NC_020541	CGGCG	2	10	222742	222751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
222	NC_020541	TCGCC	2	10	222769	222778	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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231	NC_020541	GGCCA	2	10	231662	231671	20 %	0 %	40 %	40 %	469816528
232	NC_020541	GCCGT	2	10	231807	231816	0 %	20 %	40 %	40 %	469816528
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236	NC_020541	TGCGA	2	10	235972	235981	20 %	20 %	40 %	20 %	469816532
237	NC_020541	CTGGG	2	10	236887	236896	0 %	20 %	60 %	20 %	469816533
238	NC_020541	CCAGC	2	10	237479	237488	20 %	0 %	20 %	60 %	469816534
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241	NC_020541	GCGGT	2	10	244092	244101	0 %	20 %	60 %	20 %	469816539
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249	NC_020541	ACGCC	2	10	251082	251091	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
250	NC_020541	GCCGC	2	10	251526	251535	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
251	NC_020541	CGGAC	2	10	253869	253878	20 %	0 %	40 %	40 %	469816550
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259	NC_020541	TGGCC	2	10	257183	257192	0 %	20 %	40 %	40 %	469816550
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265	NC_020541	TCGCG	2	10	260309	260318	0 %	20 %	40 %	40 %	469816550
266	NC_020541	TTGCC	2	10	260783	260792	0 %	40 %	20 %	40 %	469816551
267	NC_020541	GCCGG	2	10	263108	263117	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_020541	GCGCC	2	10	387537	387546	0 %	0 %	40 %	60 %	469816671
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