MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI8T7 complete sequence

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020539	ACAT	2	8	272	279	50 %	25 %	0 %	25 %	469816324
2	NC_020539	AAGA	2	8	506	513	75 %	0 %	25 %	0 %	469816324
3	NC_020539	CTTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	0 %	25 %	469816325
4	NC_020539	AGTA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	25 %	0 %	469816325
5	NC_020539	TAGA	2	8	1866	1873	50 %	25 %	25 %	0 %	469816325
6	NC_020539	CCAT	2	8	2320	2327	25 %	25 %	0 %	50 %	469816325
7	NC_020539	TTAA	2	8	4206	4213	50 %	50 %	0 %	0 %	469816326
8	NC_020539	TTTA	2	8	4295	4302	25 %	75 %	0 %	0 %	469816326
9	NC_020539	AAGT	2	8	5162	5169	50 %	25 %	25 %	0 %	469816327
10	NC_020539	AAAG	2	8	5650	5657	75 %	0 %	25 %	0 %	469816327
11	NC_020539	CATT	2	8	5793	5800	25 %	50 %	0 %	25 %	469816327
12	NC_020539	TTAA	2	8	5832	5839	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
13	NC_020539	AATT	2	8	5872	5879	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
14	NC_020539	AAAG	2	8	6084	6091	75 %	0 %	25 %	0 %	469816327
15	NC_020539	ATTT	2	8	6126	6133	25 %	75 %	0 %	0 %	469816327
16	NC_020539	TGGA	2	8	6372	6379	25 %	25 %	50 %	0 %	469816327
17	NC_020539	TAGA	2	8	7528	7535	50 %	25 %	25 %	0 %	469816328
18	NC_020539	TAAA	2	8	7774	7781	75 %	25 %	0 %	0 %	469816328
19	NC_020539	ATAA	2	8	7912	7919	75 %	25 %	0 %	0 %	469816328
20	NC_020539	ATGA	2	8	8041	8048	50 %	25 %	25 %	0 %	469816329
21	NC_020539	TTAT	2	8	8532	8539	25 %	75 %	0 %	0 %	469816329
22	NC_020539	ATAA	2	8	10080	10087	75 %	25 %	0 %	0 %	469816330
23	NC_020539	GTTT	2	8	10383	10390	0 %	75 %	25 %	0 %	469816331
24	NC_020539	ATTA	2	8	10414	10421	50 %	50 %	0 %	0 %	469816331
25	NC_020539	AAAG	2	8	10721	10728	75 %	0 %	25 %	0 %	469816331
26	NC_020539	TAAT	2	8	10836	10843	50 %	50 %	0 %	0 %	469816331
27	NC_020539	TATG	2	8	11527	11534	25 %	50 %	25 %	0 %	469816331
28	NC_020539	AATT	2	8	12168	12175	50 %	50 %	0 %	0 %	469816332
29	NC_020539	CAAA	2	8	12937	12944	75 %	0 %	0 %	25 %	469816333
30	NC_020539	TCTT	2	8	13220	13227	0 %	75 %	0 %	25 %	469816333
31	NC_020539	TTTA	2	8	13301	13308	25 %	75 %	0 %	0 %	469816333
32	NC_020539	TCTT	2	8	13499	13506	0 %	75 %	0 %	25 %	469816333
33	NC_020539	CTTT	2	8	13536	13543	0 %	75 %	0 %	25 %	469816333
34	NC_020539	TAAT	2	8	13590	13597	50 %	50 %	0 %	0 %	469816333
35	NC_020539	GTTT	2	8	13650	13657	0 %	75 %	25 %	0 %	469816333
36	NC_020539	TATG	2	8	14259	14266	25 %	50 %	25 %	0 %	469816334
37	NC_020539	ATCC	2	8	14292	14299	25 %	25 %	0 %	50 %	469816334
38	NC_020539	TAGA	2	8	14312	14319	50 %	25 %	25 %	0 %	469816334
39	NC_020539	TATT	2	8	14470	14477	25 %	75 %	0 %	0 %	469816334
40	NC_020539	ATTA	2	8	19137	19144	50 %	50 %	0 %	0 %	469816335
41	NC_020539	TTAG	2	8	19612	19619	25 %	50 %	25 %	0 %	469816335
42	NC_020539	CAAC	2	8	19683	19690	50 %	0 %	0 %	50 %	469816335
43	NC_020539	AAGC	2	8	20184	20191	50 %	0 %	25 %	25 %	469816336
44	NC_020539	GCTA	2	8	20648	20655	25 %	25 %	25 %	25 %	469816336
45	NC_020539	TAAA	2	8	21806	21813	75 %	25 %	0 %	0 %	469816337
46	NC_020539	AAAT	2	8	21998	22005	75 %	25 %	0 %	0 %	469816337
47	NC_020539	AAGA	2	8	22799	22806	75 %	0 %	25 %	0 %	469816338

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.