MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI8T7 complete sequence

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020539	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020539	C	6	6	844	849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020539	T	7	7	1253	1259	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
4	NC_020539	T	6	6	1460	1465	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
5	NC_020539	T	6	6	1896	1901	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
6	NC_020539	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
7	NC_020539	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020539	A	6	6	3628	3633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020539	A	6	6	3743	3748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020539	T	6	6	3828	3833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020539	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
12	NC_020539	T	6	6	4337	4342	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
13	NC_020539	T	6	6	4430	4435	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
14	NC_020539	T	6	6	4589	4594	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
15	NC_020539	T	8	8	4745	4752	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
16	NC_020539	T	6	6	5010	5015	0 %	100 %	0 %	0 %	469816327
17	NC_020539	A	7	7	5374	5380	100 %	0 %	0 %	0 %	469816327
18	NC_020539	A	8	8	5415	5422	100 %	0 %	0 %	0 %	469816327
19	NC_020539	T	6	6	5769	5774	0 %	100 %	0 %	0 %	469816327
20	NC_020539	A	6	6	5859	5864	100 %	0 %	0 %	0 %	469816327
21	NC_020539	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	469816327
22	NC_020539	A	6	6	6456	6461	100 %	0 %	0 %	0 %	469816327
23	NC_020539	A	6	6	6667	6672	100 %	0 %	0 %	0 %	469816327
24	NC_020539	A	6	6	6760	6765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020539	A	6	6	6856	6861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020539	A	6	6	8744	8749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020539	T	6	6	8930	8935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020539	A	6	6	8989	8994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020539	A	6	6	9214	9219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020539	A	7	7	9579	9585	100 %	0 %	0 %	0 %	469816330
31	NC_020539	T	6	6	9781	9786	0 %	100 %	0 %	0 %	469816330
32	NC_020539	T	6	6	10074	10079	0 %	100 %	0 %	0 %	469816330
33	NC_020539	A	6	6	10167	10172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020539	T	6	6	10222	10227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020539	A	7	7	10240	10246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020539	T	6	6	10313	10318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020539	A	8	8	10345	10352	100 %	0 %	0 %	0 %	469816331
38	NC_020539	A	7	7	10552	10558	100 %	0 %	0 %	0 %	469816331
39	NC_020539	T	6	6	11942	11947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020539	A	6	6	12252	12257	100 %	0 %	0 %	0 %	469816332
41	NC_020539	A	6	6	12259	12264	100 %	0 %	0 %	0 %	469816332
42	NC_020539	A	6	6	12362	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	469816332
43	NC_020539	A	6	6	12583	12588	100 %	0 %	0 %	0 %	469816332
44	NC_020539	T	7	7	13505	13511	0 %	100 %	0 %	0 %	469816333
45	NC_020539	T	6	6	13607	13612	0 %	100 %	0 %	0 %	469816333
46	NC_020539	T	6	6	13755	13760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020539	T	6	6	14027	14032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020539	A	6	6	14384	14389	100 %	0 %	0 %	0 %	469816334
49	NC_020539	A	6	6	14401	14406	100 %	0 %	0 %	0 %	469816334
50	NC_020539	A	6	6	14729	14734	100 %	0 %	0 %	0 %	469816334
51	NC_020539	A	7	7	15165	15171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020539	A	6	6	15387	15392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020539	T	7	7	15591	15597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020539	T	7	7	15602	15608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020539	A	6	6	15611	15616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020539	A	6	6	15800	15805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020539	A	6	6	15826	15831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020539	A	7	7	15918	15924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020539	T	6	6	16112	16117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020539	T	6	6	16371	16376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020539	A	7	7	16467	16473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020539	T	6	6	16782	16787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020539	A	6	6	16803	16808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020539	A	6	6	16994	16999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020539	T	6	6	17407	17412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020539	A	6	6	17451	17456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020539	A	7	7	17818	17824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020539	A	6	6	18012	18017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020539	T	7	7	18332	18338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020539	A	7	7	18362	18368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020539	A	6	6	18372	18377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020539	A	6	6	18435	18440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020539	A	7	7	18445	18451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020539	A	6	6	18490	18495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020539	A	6	6	18507	18512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020539	T	6	6	18702	18707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020539	T	6	6	18999	19004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020539	A	6	6	19007	19012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020539	A	6	6	19018	19023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020539	T	7	7	19264	19270	0 %	100 %	0 %	0 %	469816335
81	NC_020539	A	6	6	19285	19290	100 %	0 %	0 %	0 %	469816335
82	NC_020539	T	7	7	19458	19464	0 %	100 %	0 %	0 %	469816335
83	NC_020539	T	6	6	19660	19665	0 %	100 %	0 %	0 %	469816335
84	NC_020539	T	6	6	19882	19887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020539	A	6	6	19967	19972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020539	A	8	8	20175	20182	100 %	0 %	0 %	0 %	469816336
87	NC_020539	T	6	6	20698	20703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020539	A	7	7	20823	20829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020539	A	6	6	20950	20955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020539	T	7	7	20983	20989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020539	A	6	6	21153	21158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020539	A	6	6	21166	21171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020539	T	6	6	21199	21204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020539	T	6	6	21272	21277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020539	T	7	7	21362	21368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020539	A	8	8	21427	21434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020539	A	7	7	21461	21467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020539	A	6	6	21574	21579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020539	T	7	7	21590	21596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020539	T	7	7	21743	21749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020539	T	7	7	21751	21757	0 %	100 %	0 %	0 %	469816337
102	NC_020539	T	6	6	21759	21764	0 %	100 %	0 %	0 %	469816337
103	NC_020539	A	6	6	22137	22142	100 %	0 %	0 %	0 %	469816337
104	NC_020539	T	6	6	22236	22241	0 %	100 %	0 %	0 %	469816337
105	NC_020539	A	6	6	22284	22289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020539	T	7	7	22340	22346	0 %	100 %	0 %	0 %	469816338
107	NC_020539	A	7	7	22787	22793	100 %	0 %	0 %	0 %	469816338
108	NC_020539	T	7	7	22978	22984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020539	T	6	6	22986	22991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020539	T	6	6	23210	23215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020539	A	6	6	23279	23284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020539	A	6	6	23523	23528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.