MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020536	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196213
2	NC_020536	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020536	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020536	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196216
5	NC_020536	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196216
6	NC_020536	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196216
7	NC_020536	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196216
8	NC_020536	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470196216
9	NC_020536	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196218
10	NC_020536	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196218
11	NC_020536	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020536	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196222
13	NC_020536	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196222
14	NC_020536	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470196223
15	NC_020536	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020536	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020536	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196224
18	NC_020536	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196224
19	NC_020536	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196225
20	NC_020536	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196226
21	NC_020536	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196228
22	NC_020536	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196231
23	NC_020536	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196232
24	NC_020536	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196234
25	NC_020536	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020536	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020536	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470196236
28	NC_020536	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020536	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020536	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196242
31	NC_020536	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470196242
32	NC_020536	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196245
33	NC_020536	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470196246
34	NC_020536	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470196246
35	NC_020536	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196247
36	NC_020536	TTGTGA	2	12	59572	59583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196249
37	NC_020536	TTTATA	2	12	59912	59923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196249
38	NC_020536	TTTATC	2	12	60216	60227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470196250
39	NC_020536	ACAAAT	2	12	63549	63560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470196252
40	NC_020536	AATTAA	2	12	63640	63651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196252
41	NC_020536	ATTTAT	2	12	66059	66070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020536	TTAATG	2	12	66583	66594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196253
43	NC_020536	AAGTCA	2	12	67788	67799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196254
44	NC_020536	AAAAAG	2	12	67902	67913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196254
45	NC_020536	GAAAAA	2	12	68215	68226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196254
46	NC_020536	AATTAT	2	12	70454	70465	50 %	50 %	0 %	0 %	470196256
47	NC_020536	ACCCTT	2	12	72293	72304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470196257
48	NC_020536	TTTAGC	2	12	74202	74213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196258
49	NC_020536	AAATAA	2	12	74253	74264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196258
50	NC_020536	GTTAGA	2	12	76376	76387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196259
51	NC_020536	AAAAGA	2	12	76430	76441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196259
52	NC_020536	GCTAAA	2	12	79218	79229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196261
53	NC_020536	AACAAA	2	12	79639	79650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020536	TAAAGA	2	12	83365	83376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196266
55	NC_020536	AACCAC	2	12	87237	87248	50 %	0 %	0 %	50 %	470196268
56	NC_020536	AATATA	2	12	88939	88950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020536	AACCGA	2	12	90548	90559	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470196270
58	NC_020536	ATAGAT	2	12	95448	95459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196273
59	NC_020536	TATCAT	2	12	96215	96226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196274
60	NC_020536	TTTATT	2	12	96623	96634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470196275
61	NC_020536	TATTTG	2	12	96709	96720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196275
62	NC_020536	TAAATA	2	12	98142	98153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196275
63	NC_020536	TTTTTC	2	12	99836	99847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470196276
64	NC_020536	TTAAAT	2	12	99931	99942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020536	TAACAA	2	12	101288	101299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020536	TAAGCC	2	12	101697	101708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196278
67	NC_020536	ATCGCA	2	12	102912	102923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196279
68	NC_020536	TTTGAA	2	12	103943	103954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196280
69	NC_020536	CAATGG	2	12	112901	112912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470196286
70	NC_020536	TGAAGA	2	12	113735	113746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470196287
71	NC_020536	TTTCAT	2	12	114416	114427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470196288
72	NC_020536	TGTATA	2	12	118636	118647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196292
73	NC_020536	TCGAAA	2	12	120137	120148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196294
74	NC_020536	CTATTG	2	12	122723	122734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196296
75	NC_020536	CATATG	2	12	123926	123937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196297
76	NC_020536	AATGTA	2	12	124827	124838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020536	CTGTAA	2	12	126648	126659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020536	GGTATG	2	12	126969	126980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470196300
79	NC_020536	CAGATT	2	12	129567	129578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196302
80	NC_020536	AGATAT	2	12	136943	136954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196309
81	NC_020536	GTTTTT	2	12	137852	137863	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020536	ATGCCT	2	12	138082	138093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470196310
83	NC_020536	TGAAAG	2	12	138722	138733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470196310
84	NC_020536	GATATG	2	12	146222	146233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196316
85	NC_020536	ATTTGA	2	12	150128	150139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196319
86	NC_020536	GATTTT	2	12	154639	154650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196324
87	NC_020536	ACAAAG	2	12	159159	159170	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470196328
88	NC_020536	TGTAAT	2	12	160183	160194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020536	AAAGAT	2	12	161172	161183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196329
90	NC_020536	ATTAAT	2	12	163078	163089	50 %	50 %	0 %	0 %	470196330
91	NC_020536	CAATAT	2	12	163644	163655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196330
92	NC_020536	TCCCAC	2	12	164395	164406	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020536	TTGGTA	2	12	167729	167740	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196334
94	NC_020536	GCGATT	2	12	167749	167760	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470196334
95	NC_020536	AAATTT	2	12	167847	167858	50 %	50 %	0 %	0 %	470196334
96	NC_020536	ACCTGC	2	12	170750	170761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470196336
97	NC_020536	AAGATA	2	12	170896	170907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196336
98	NC_020536	CGTTAA	2	12	173830	173841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196338
99	NC_020536	CTATTA	2	12	175681	175692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196338
100	NC_020536	TATGAT	2	12	177215	177226	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196338
101	NC_020536	TTGAAA	2	12	177667	177678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196338
102	NC_020536	AACATT	2	12	180107	180118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196338
103	NC_020536	AGCAAC	2	12	183596	183607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470196342
104	NC_020536	TGTTTG	2	12	183644	183655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196342
105	NC_020536	CACCTT	2	12	185648	185659	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470196344
106	NC_020536	ACCTTT	2	12	186153	186164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470196344
107	NC_020536	TTTATA	2	12	186249	186260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020536	ATTAAT	2	12	186272	186283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020536	GTAAAT	2	12	189892	189903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196347
110	NC_020536	ATTTTA	2	12	191487	191498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196348
111	NC_020536	TATCTT	2	12	196101	196112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470196351
112	NC_020536	ATTTGG	2	12	197114	197125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196352
113	NC_020536	GAGTTT	2	12	200457	200468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196353
114	NC_020536	TATACA	2	12	204458	204469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196357
115	NC_020536	TTATTT	2	12	206490	206501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470196358
116	NC_020536	ATTTAT	2	12	207069	207080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196358
117	NC_020536	TTTTTA	2	12	207100	207111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020536	CCCTGA	2	12	209827	209838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470196361
119	NC_020536	TCCTGA	2	12	210646	210657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470196361
120	NC_020536	TCAATT	2	12	212797	212808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196363
121	NC_020536	AATATG	2	12	214097	214108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196364
122	NC_020536	GATTTT	2	12	217253	217264	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020536	AAAAAT	2	12	217604	217615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196366
124	NC_020536	AGGACA	2	12	219464	219475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470196368
125	NC_020536	ACATTT	2	12	219800	219811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196368
126	NC_020536	TTCTTG	2	12	224729	224740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470196372
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129	NC_020536	GGAATA	2	12	252829	252840	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020536	TGGTAT	2	12	264409	264420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020536	TATAGA	2	12	267763	267774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196400
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151	NC_020536	TAATTA	2	12	306790	306801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020536	ACAAGA	2	12	307630	307641	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470196430
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237	NC_020536	CAAGAA	2	12	480534	480545	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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240	NC_020536	AGTTGA	2	12	490533	490544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_020536	TAAAAA	2	12	491481	491492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196564
242	NC_020536	TTATAA	2	12	492928	492939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_020536	TTTATA	2	12	493845	493856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196566
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245	NC_020536	ATTGGT	2	12	497538	497549	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196569
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247	NC_020536	AAATTT	2	12	499687	499698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_020536	GCTGAA	2	12	553087	553098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470196605
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275	NC_020536	GTTATA	2	12	555484	555495	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_020536	CCAAAC	2	12	596061	596072	50 %	0 %	0 %	50 %	470196629
342	NC_020536	TTTTGA	2	12	601848	601859	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196635
343	NC_020536	TATATT	2	12	604005	604016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196636
344	NC_020536	ATTGCG	2	12	604721	604732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
345	NC_020536	TATTTA	2	12	605962	605973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196637
346	NC_020536	AATGAT	2	12	608639	608650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_020536	TAGATG	2	12	608712	608723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
348	NC_020536	CATGAC	2	12	610662	610673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
349	NC_020536	GCAATT	2	12	612501	612512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196642
350	NC_020536	GAAAAA	2	12	613062	613073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196642
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352	NC_020536	TTGATA	2	12	617310	617321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196646
353	NC_020536	TAAAAT	2	12	624032	624043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_020536	AAAATA	2	12	626060	626071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196652
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357	NC_020536	TTTAAT	2	12	632151	632162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196659
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359	NC_020536	TTTGAT	2	12	636082	636093	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196661
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469	NC_020536	GATTCA	2	12	829131	829142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
470	NC_020536	GATTCA	2	12	829167	829178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
471	NC_020536	GATTCA	2	12	829185	829196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
472	NC_020536	GATTCA	2	12	829203	829214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
473	NC_020536	ATTCAG	2	12	829240	829251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
474	NC_020536	GATTCA	2	12	829545	829556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
475	NC_020536	TCAGAC	2	12	829566	829577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196810
476	NC_020536	TCAGAT	2	12	829584	829595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
477	NC_020536	GATTCA	2	12	829599	829610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
478	NC_020536	GACTCA	2	12	829653	829664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196810
479	NC_020536	GATTCA	2	12	829743	829754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
480	NC_020536	GACTCA	2	12	829779	829790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196810
481	NC_020536	GATTCA	2	12	829797	829808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196810
482	NC_020536	GACTCA	2	12	829815	829826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196810
483	NC_020536	TATCAA	2	12	832149	832160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
484	NC_020536	AGTACT	2	12	833687	833698	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196813
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486	NC_020536	TTTTGA	2	12	835969	835980	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
487	NC_020536	CTGTTT	2	12	836747	836758	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
488	NC_020536	GCTCAA	2	12	839263	839274	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196816
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491	NC_020536	TAAAAA	2	12	845049	845060	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_020536	AAATTA	2	12	858684	858695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_020536	TGAAGG	2	12	862437	862448	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470196834

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