MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	TTAAAC	2	12	6174	6185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816297
2	NC_020535	CAAAAA	2	12	7049	7060	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	469816298
3	NC_020535	CCTAAA	2	12	8350	8361	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	469816299
4	NC_020535	TTAAAC	2	12	9334	9345	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816300
5	NC_020535	ACAGCA	2	12	10539	10550	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	469816301
6	NC_020535	CTGTTT	2	12	10849	10860	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	469816301
7	NC_020535	AAAATA	2	12	11822	11833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	469816303
8	NC_020535	AGCAAG	2	12	12520	12531	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	469816304
9	NC_020535	ATGTAT	2	12	12936	12947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	469816304
10	NC_020535	ACAGCA	2	12	13128	13139	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	469816304
11	NC_020535	ACCTAA	2	12	14899	14910	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	469816305
12	NC_020535	AAAAGA	2	12	15007	15018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	469816305
13	NC_020535	CAACAG	2	12	16010	16021	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	469816306
14	NC_020535	AAGGTA	2	12	16097	16108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	469816306
15	NC_020535	GCTGGC	2	12	16699	16710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	469816306
16	NC_020535	TGATTT	2	12	20690	20701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	469816310
17	NC_020535	AAAACA	2	12	21605	21616	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	469816310
18	NC_020535	TTAAAC	2	12	23737	23748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816312
19	NC_020535	ATAGAT	2	12	25546	25557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	469816314
20	NC_020535	AGTAAA	2	12	25876	25887	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	469816314
21	NC_020535	AAAAGC	2	12	28159	28170	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	469816317
22	NC_020535	GATTTA	2	12	28565	28576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	469816317
23	NC_020535	TTATAT	2	12	29429	29440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816318
24	NC_020535	TTAAAA	2	12	32135	32146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816319
25	NC_020535	ATTAAA	2	12	32405	32416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816320
26	NC_020535	AATTGA	2	12	35794	35805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	469816322

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.