MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	ACAAG	2	10	499	508	60 %	0 %	20 %	20 %	469816295
2	NC_020535	GTTTT	2	10	2257	2266	0 %	80 %	20 %	0 %	469816296
3	NC_020535	TAATT	2	10	2972	2981	40 %	60 %	0 %	0 %	469816296
4	NC_020535	GTTTG	2	10	3687	3696	0 %	60 %	40 %	0 %	469816296
5	NC_020535	CAATA	2	10	4268	4277	60 %	20 %	0 %	20 %	469816296
6	NC_020535	ACAAT	2	10	6888	6897	60 %	20 %	0 %	20 %	469816298
7	NC_020535	ATAAC	2	10	10036	10045	60 %	20 %	0 %	20 %	469816301
8	NC_020535	AGAAA	2	10	10988	10997	80 %	0 %	20 %	0 %	469816301
9	NC_020535	TTTTC	2	10	12260	12269	0 %	80 %	0 %	20 %	469816303
10	NC_020535	AAACA	2	10	12812	12821	80 %	0 %	0 %	20 %	469816304
11	NC_020535	AAAGC	2	10	14754	14763	60 %	0 %	20 %	20 %	469816305
12	NC_020535	TGAAT	2	10	15082	15091	40 %	40 %	20 %	0 %	469816305
13	NC_020535	AAGTA	2	10	15283	15292	60 %	20 %	20 %	0 %	469816305
14	NC_020535	AATTG	2	10	15412	15421	40 %	40 %	20 %	0 %	469816305
15	NC_020535	AATAA	2	10	15476	15485	80 %	20 %	0 %	0 %	469816305
16	NC_020535	AGAAA	2	10	15529	15538	80 %	0 %	20 %	0 %	469816305
17	NC_020535	GATTT	2	10	16499	16508	20 %	60 %	20 %	0 %	469816306
18	NC_020535	AGAAA	2	10	16597	16606	80 %	0 %	20 %	0 %	469816306
19	NC_020535	TTATT	2	10	16928	16937	20 %	80 %	0 %	0 %	469816307
20	NC_020535	AGGGC	2	10	17903	17912	20 %	0 %	60 %	20 %	469816308
21	NC_020535	AATGA	2	10	19156	19165	60 %	20 %	20 %	0 %	469816308
22	NC_020535	TGGAT	2	10	21705	21714	20 %	40 %	40 %	0 %	469816311
23	NC_020535	ATTAT	2	10	24718	24727	40 %	60 %	0 %	0 %	469816313
24	NC_020535	AAAAG	2	10	24817	24826	80 %	0 %	20 %	0 %	469816313
25	NC_020535	ACAAT	2	10	25191	25200	60 %	20 %	0 %	20 %	469816314
26	NC_020535	ATTCA	2	10	25514	25523	40 %	40 %	0 %	20 %	469816314
27	NC_020535	GTAAA	2	10	27076	27085	60 %	20 %	20 %	0 %	469816316
28	NC_020535	GAACT	2	10	27088	27097	40 %	20 %	20 %	20 %	469816316
29	NC_020535	AAATT	2	10	28343	28352	60 %	40 %	0 %	0 %	469816317
30	NC_020535	TAACT	2	10	28967	28976	40 %	40 %	0 %	20 %	469816318
31	NC_020535	TAACT	2	10	29342	29351	40 %	40 %	0 %	20 %	469816318
32	NC_020535	ATATG	2	10	31164	31173	40 %	40 %	20 %	0 %	469816319

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.