MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	GATA	2	8	265	272	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
2	NC_020535	AAAC	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	469816295
3	NC_020535	TTTA	2	8	423	430	25 %	75 %	0 %	0 %	469816295
4	NC_020535	ATGA	2	8	659	666	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
5	NC_020535	AATT	2	8	756	763	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
6	NC_020535	AGAA	2	8	2375	2382	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
7	NC_020535	TAAA	2	8	2851	2858	75 %	25 %	0 %	0 %	469816296
8	NC_020535	TAAT	2	8	2917	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
9	NC_020535	GGTT	2	8	3342	3349	0 %	50 %	50 %	0 %	469816296
10	NC_020535	AAGG	2	8	3423	3430	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
11	NC_020535	AATT	2	8	3949	3956	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
12	NC_020535	ATTA	2	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
13	NC_020535	AAAG	2	8	4479	4486	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
14	NC_020535	AATT	2	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
15	NC_020535	AAAC	2	8	5230	5237	75 %	0 %	0 %	25 %	469816296
16	NC_020535	ACAT	2	8	6019	6026	50 %	25 %	0 %	25 %	469816297
17	NC_020535	GAAA	2	8	6676	6683	75 %	0 %	25 %	0 %	469816298
18	NC_020535	AAAC	2	8	6767	6774	75 %	0 %	0 %	25 %	469816298
19	NC_020535	ATTT	2	8	8224	8231	25 %	75 %	0 %	0 %	469816299
20	NC_020535	ACAT	2	8	9179	9186	50 %	25 %	0 %	25 %	469816300
21	NC_020535	AAGA	2	8	9413	9420	75 %	0 %	25 %	0 %	469816300
22	NC_020535	ATCA	2	8	10117	10124	50 %	25 %	0 %	25 %	469816301
23	NC_020535	AAGG	2	8	11005	11012	50 %	0 %	50 %	0 %	469816301
24	NC_020535	TGGT	2	8	11305	11312	0 %	50 %	50 %	0 %	469816302
25	NC_020535	GACG	2	8	11875	11882	25 %	0 %	50 %	25 %	469816303
26	NC_020535	AGAA	2	8	12776	12783	75 %	0 %	25 %	0 %	469816304
27	NC_020535	TCAA	2	8	12804	12811	50 %	25 %	0 %	25 %	469816304
28	NC_020535	TAAA	2	8	13264	13271	75 %	25 %	0 %	0 %	469816304
29	NC_020535	GTTC	2	8	13572	13579	0 %	50 %	25 %	25 %	469816304
30	NC_020535	TGAC	2	8	14014	14021	25 %	25 %	25 %	25 %	469816304
31	NC_020535	TAGA	2	8	14347	14354	50 %	25 %	25 %	0 %	469816304
32	NC_020535	TTCC	2	8	14731	14738	0 %	50 %	0 %	50 %	469816305
33	NC_020535	AATA	2	8	14911	14918	75 %	25 %	0 %	0 %	469816305
34	NC_020535	ACAG	2	8	15097	15104	50 %	0 %	25 %	25 %	469816305
35	NC_020535	TGAA	2	8	15114	15121	50 %	25 %	25 %	0 %	469816305
36	NC_020535	ACAA	2	8	15267	15274	75 %	0 %	0 %	25 %	469816305
37	NC_020535	ATAA	2	8	15695	15702	75 %	25 %	0 %	0 %	469816305
38	NC_020535	CTAT	2	8	16225	16232	25 %	50 %	0 %	25 %	469816306
39	NC_020535	GTAG	2	8	16681	16688	25 %	25 %	50 %	0 %	469816306
40	NC_020535	TAGT	2	8	16799	16806	25 %	50 %	25 %	0 %	469816306
41	NC_020535	ATTT	2	8	16878	16885	25 %	75 %	0 %	0 %	469816306
42	NC_020535	CTGG	2	8	16948	16955	0 %	25 %	50 %	25 %	469816307
43	NC_020535	AGCA	2	8	17129	17136	50 %	0 %	25 %	25 %	469816307
44	NC_020535	ATCA	2	8	17147	17154	50 %	25 %	0 %	25 %	469816307
45	NC_020535	ACAA	2	8	17254	17261	75 %	0 %	0 %	25 %	469816307
46	NC_020535	AGAT	2	8	17333	17340	50 %	25 %	25 %	0 %	469816307
47	NC_020535	AGTA	2	8	17370	17377	50 %	25 %	25 %	0 %	469816307
48	NC_020535	TTTG	2	8	18177	18184	0 %	75 %	25 %	0 %	469816308
49	NC_020535	GTTA	2	8	18216	18223	25 %	50 %	25 %	0 %	469816308
50	NC_020535	ATGA	2	8	18295	18302	50 %	25 %	25 %	0 %	469816308
51	NC_020535	TAAA	2	8	18731	18738	75 %	25 %	0 %	0 %	469816308
52	NC_020535	AAAT	2	8	18978	18985	75 %	25 %	0 %	0 %	469816308
53	NC_020535	AAAG	2	8	19198	19205	75 %	0 %	25 %	0 %	469816308
54	NC_020535	ATAG	2	8	19282	19289	50 %	25 %	25 %	0 %	469816308
55	NC_020535	AAAC	2	8	19482	19489	75 %	0 %	0 %	25 %	469816308
56	NC_020535	GAAA	2	8	19911	19918	75 %	0 %	25 %	0 %	469816309
57	NC_020535	AATT	2	8	20332	20339	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
58	NC_020535	ATAA	2	8	20364	20371	75 %	25 %	0 %	0 %	469816310
59	NC_020535	GAAG	2	8	20598	20605	50 %	0 %	50 %	0 %	469816310
60	NC_020535	TGAT	2	8	21364	21371	25 %	50 %	25 %	0 %	469816310
61	NC_020535	AGAA	2	8	21472	21479	75 %	0 %	25 %	0 %	469816310
62	NC_020535	AAAG	2	8	21516	21523	75 %	0 %	25 %	0 %	469816310
63	NC_020535	AAGA	2	8	21549	21556	75 %	0 %	25 %	0 %	469816310
64	NC_020535	TAAA	2	8	21620	21627	75 %	25 %	0 %	0 %	469816310
65	NC_020535	TATT	2	8	22224	22231	25 %	75 %	0 %	0 %	469816311
66	NC_020535	CTTT	2	8	22419	22426	0 %	75 %	0 %	25 %	469816311
67	NC_020535	CCTT	2	8	22514	22521	0 %	50 %	0 %	50 %	469816311
68	NC_020535	TAAA	2	8	22615	22622	75 %	25 %	0 %	0 %	469816311
69	NC_020535	ACAT	2	8	23582	23589	50 %	25 %	0 %	25 %	469816312
70	NC_020535	AAGA	2	8	23816	23823	75 %	0 %	25 %	0 %	469816312
71	NC_020535	CATT	2	8	24611	24618	25 %	50 %	0 %	25 %	469816313
72	NC_020535	CTTT	2	8	25319	25326	0 %	75 %	0 %	25 %	469816314
73	NC_020535	AATA	2	8	25794	25801	75 %	25 %	0 %	0 %	469816314
74	NC_020535	AAAG	2	8	25953	25960	75 %	0 %	25 %	0 %	469816314
75	NC_020535	ATTT	2	8	26478	26485	25 %	75 %	0 %	0 %	469816315
76	NC_020535	AATT	2	8	26891	26898	50 %	50 %	0 %	0 %	469816316
77	NC_020535	TAGA	2	8	27151	27158	50 %	25 %	25 %	0 %	469816316
78	NC_020535	TAAG	2	8	28176	28183	50 %	25 %	25 %	0 %	469816317
79	NC_020535	AAAT	2	8	28303	28310	75 %	25 %	0 %	0 %	469816317
80	NC_020535	AAAT	2	8	28410	28417	75 %	25 %	0 %	0 %	469816317
81	NC_020535	AACA	2	8	28460	28467	75 %	0 %	0 %	25 %	469816317
82	NC_020535	ACTA	2	8	28483	28490	50 %	25 %	0 %	25 %	469816317
83	NC_020535	ATGA	2	8	28800	28807	50 %	25 %	25 %	0 %	469816318
84	NC_020535	AGAT	2	8	29522	29529	50 %	25 %	25 %	0 %	469816318
85	NC_020535	ATTT	2	8	29545	29552	25 %	75 %	0 %	0 %	469816318
86	NC_020535	ACGA	2	8	29554	29561	50 %	0 %	25 %	25 %	469816318
87	NC_020535	AAAG	2	8	30018	30025	75 %	0 %	25 %	0 %	469816318
88	NC_020535	AAAG	2	8	30093	30100	75 %	0 %	25 %	0 %	469816318
89	NC_020535	AACT	2	8	30215	30222	50 %	25 %	0 %	25 %	469816318
90	NC_020535	AAGA	2	8	30304	30311	75 %	0 %	25 %	0 %	469816318
91	NC_020535	AAAT	2	8	30747	30754	75 %	25 %	0 %	0 %	469816319
92	NC_020535	TTCG	2	8	31410	31417	0 %	50 %	25 %	25 %	469816319
93	NC_020535	GATA	2	8	31527	31534	50 %	25 %	25 %	0 %	469816319
94	NC_020535	TTAA	2	8	31705	31712	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
95	NC_020535	TAAT	2	8	31772	31779	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
96	NC_020535	TAAA	2	8	31925	31932	75 %	25 %	0 %	0 %	469816319
97	NC_020535	GTAA	2	8	31975	31982	50 %	25 %	25 %	0 %	469816319
98	NC_020535	ACTT	2	8	32038	32045	25 %	50 %	0 %	25 %	469816319
99	NC_020535	ACAA	2	8	32228	32235	75 %	0 %	0 %	25 %	469816319
100	NC_020535	AATT	2	8	32816	32823	50 %	50 %	0 %	0 %	469816320
101	NC_020535	CATT	2	8	33788	33795	25 %	50 %	0 %	25 %	469816321
102	NC_020535	ATTT	2	8	33916	33923	25 %	75 %	0 %	0 %	469816321
103	NC_020535	ATTC	2	8	34011	34018	25 %	50 %	0 %	25 %	469816321
104	NC_020535	CAAT	2	8	35482	35489	50 %	25 %	0 %	25 %	469816322
105	NC_020535	GATA	2	8	35621	35628	50 %	25 %	25 %	0 %	469816322
106	NC_020535	TAAA	2	8	35778	35785	75 %	25 %	0 %	0 %	469816322
107	NC_020535	CATT	2	8	36274	36281	25 %	50 %	0 %	25 %	469816322

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.