MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	TCA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020535	AGA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
3	NC_020535	AAT	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
4	NC_020535	TAA	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
5	NC_020535	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
6	NC_020535	TAA	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
7	NC_020535	AGA	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
8	NC_020535	GAA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
9	NC_020535	GAA	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
10	NC_020535	TAT	2	6	1009	1014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816295
11	NC_020535	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
12	NC_020535	TCT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020535	CTA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020535	GTG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020535	TCA	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020535	GAA	2	6	1363	1368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020535	TTA	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020535	TGA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020535	AAT	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020535	CAT	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020535	CTA	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020535	AGT	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020535	TAT	2	6	2029	2034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020535	AGG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020535	AAT	2	6	2595	2600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
26	NC_020535	TAT	2	6	2650	2655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
27	NC_020535	TGT	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
28	NC_020535	ATT	2	6	2866	2871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
29	NC_020535	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
30	NC_020535	TAA	2	6	2929	2934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
31	NC_020535	ATT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
32	NC_020535	TCC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816296
33	NC_020535	GTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
34	NC_020535	TAA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
35	NC_020535	ATT	2	6	3239	3244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
36	NC_020535	TTG	2	6	3299	3304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
37	NC_020535	AAC	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
38	NC_020535	ATT	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
39	NC_020535	AAT	4	12	3387	3398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
40	NC_020535	AGT	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
41	NC_020535	AAT	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
42	NC_020535	TGA	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
43	NC_020535	ATA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
44	NC_020535	AGA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816296
45	NC_020535	CAT	2	6	3723	3728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816296
46	NC_020535	CTA	2	6	3835	3840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816296
47	NC_020535	TCT	2	6	3855	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
48	NC_020535	TTA	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
49	NC_020535	TAG	2	6	4039	4044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
50	NC_020535	ATA	2	6	4078	4083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
51	NC_020535	TAA	2	6	4106	4111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
52	NC_020535	TAA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
53	NC_020535	TAA	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
54	NC_020535	AAT	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
55	NC_020535	AAC	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
56	NC_020535	TTA	2	6	4489	4494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
57	NC_020535	AAT	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
58	NC_020535	ATA	2	6	4699	4704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
59	NC_020535	TCT	2	6	4743	4748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
60	NC_020535	TAA	2	6	4838	4843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
61	NC_020535	TCT	2	6	4857	4862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
62	NC_020535	GAT	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
63	NC_020535	TAT	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
64	NC_020535	CAA	2	6	5019	5024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
65	NC_020535	ATT	2	6	5090	5095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
66	NC_020535	TAA	3	9	5195	5203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
67	NC_020535	TTA	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
68	NC_020535	TAG	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020535	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020535	CAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020535	ATT	2	6	5511	5516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020535	AAT	2	6	5535	5540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020535	TCT	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020535	CTA	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816297
75	NC_020535	GTG	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816297
76	NC_020535	TCA	2	6	5854	5859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816297
77	NC_020535	GAA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816297
78	NC_020535	TTA	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816297
79	NC_020535	TGA	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816297
80	NC_020535	TTA	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816297
81	NC_020535	CAT	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020535	AGA	2	6	6501	6506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020535	GAT	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020535	GAA	2	6	6725	6730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816298
85	NC_020535	TAA	2	6	6810	6815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816298
86	NC_020535	ACA	2	6	6905	6910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816298
87	NC_020535	TAA	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816298
88	NC_020535	AGA	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816298
89	NC_020535	ACT	2	6	7027	7032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816298
90	NC_020535	CGA	2	6	7042	7047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816298
91	NC_020535	ATT	3	9	7128	7136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816298
92	NC_020535	CAT	2	6	7351	7356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020535	AAT	2	6	7741	7746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020535	TCA	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020535	AGG	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020535	TTA	2	6	7892	7897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
97	NC_020535	ATA	2	6	7907	7912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
98	NC_020535	AAT	2	6	7920	7925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
99	NC_020535	ATA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
100	NC_020535	TTG	2	6	8072	8077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816299
101	NC_020535	ATA	2	6	8185	8190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
102	NC_020535	TGA	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816299
103	NC_020535	ATT	2	6	8259	8264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
104	NC_020535	ATT	2	6	8286	8291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
105	NC_020535	ATT	2	6	8432	8437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
106	NC_020535	ATT	2	6	8577	8582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
107	NC_020535	TAA	2	6	8583	8588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
108	NC_020535	CTT	2	6	8677	8682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020535	AGC	2	6	8722	8727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020535	TCT	2	6	8881	8886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020535	CTA	2	6	8945	8950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816300
112	NC_020535	GTG	2	6	9001	9006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816300
113	NC_020535	TCA	2	6	9014	9019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816300
114	NC_020535	GAA	2	6	9074	9079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816300
115	NC_020535	TTA	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816300
116	NC_020535	TGA	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816300
117	NC_020535	TTA	2	6	9235	9240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816300
118	NC_020535	CAT	2	6	9545	9550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816300
119	NC_020535	ATT	2	6	9671	9676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020535	ATT	3	9	9849	9857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020535	CCT	2	6	9871	9876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020535	GAA	2	6	10062	10067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816301
123	NC_020535	GAT	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816301
124	NC_020535	TAT	2	6	10269	10274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816301
125	NC_020535	GAT	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816301
126	NC_020535	ATT	2	6	10355	10360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816301
127	NC_020535	TGA	2	6	10406	10411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816301
128	NC_020535	AGA	2	6	10511	10516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816301
129	NC_020535	GAA	2	6	10728	10733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816301
130	NC_020535	GAG	2	6	10908	10913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	469816301
131	NC_020535	AAC	2	6	11043	11048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020535	ACA	2	6	11133	11138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816302
133	NC_020535	TTG	2	6	11165	11170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816302
134	NC_020535	TGA	2	6	11223	11228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816302
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261	NC_020535	GTA	2	6	19378	19383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816308
262	NC_020535	ACA	2	6	19405	19410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816308
263	NC_020535	AGG	2	6	19511	19516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020535	TAT	2	6	19554	19559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816309
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