MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	TCA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020535	TCT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020535	CTA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020535	GTG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020535	TCA	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020535	GAA	2	6	1363	1368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020535	TTA	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020535	TGA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020535	AAT	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020535	CAT	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020535	CTA	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020535	AGT	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020535	TAT	2	6	2029	2034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020535	AGG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020535	TAG	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020535	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020535	CAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020535	ATT	2	6	5511	5516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020535	AAT	2	6	5535	5540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020535	TCT	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020535	CAT	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020535	AGA	2	6	6501	6506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020535	GAT	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020535	CAT	2	6	7351	7356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020535	AAT	2	6	7741	7746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020535	TCA	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020535	AGG	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020535	CTT	2	6	8677	8682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020535	AGC	2	6	8722	8727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020535	TCT	2	6	8881	8886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020535	ATT	2	6	9671	9676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020535	ATT	3	9	9849	9857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020535	CCT	2	6	9871	9876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020535	AAC	2	6	11043	11048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020535	GAA	2	6	11448	11453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020535	ATA	2	6	11472	11477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020535	TAA	2	6	11611	11616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020535	TAG	2	6	11635	11640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020535	AAG	2	6	11779	11784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020535	AGG	2	6	19511	19516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020535	GGT	2	6	21695	21700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020535	TTA	2	6	22768	22773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020535	TGT	2	6	22778	22783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020535	ATT	3	9	22836	22844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020535	AGA	2	6	22955	22960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020535	CAG	2	6	22975	22980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020535	TGA	3	9	23009	23017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020535	GAA	3	9	23114	23122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020535	GTA	2	6	23144	23149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020535	AGA	2	6	23158	23163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020535	AAT	2	6	23228	23233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020535	TCT	2	6	23284	23289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020535	CAT	2	6	23944	23949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020535	AAT	2	6	24025	24030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020535	AAT	2	6	24037	24042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020535	ATG	2	6	24047	24052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020535	AGA	2	6	24150	24155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020535	AAC	2	6	24221	24226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020535	AAT	2	6	24234	24239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020535	AGG	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020535	AAT	2	6	26209	26214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020535	TAT	2	6	26731	26736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020535	TAT	2	6	26815	26820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020535	ATA	2	6	26856	26861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020535	TAC	2	6	27603	27608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020535	AGG	2	6	27749	27754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020535	AGA	2	6	30423	30428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020535	GTA	2	6	30525	30530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020535	AAG	2	6	32258	32263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020535	CTT	2	6	32274	32279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020535	ATT	2	6	33182	33187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020535	CAT	2	6	33241	33246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020535	TCA	3	9	33378	33386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020535	AGA	2	6	34553	34558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020535	TTC	2	6	34593	34598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020535	CAG	2	6	34621	34626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020535	AGA	2	6	34706	34711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020535	GAA	2	6	34728	34733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020535	AAT	2	6	34809	34814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020535	AGT	2	6	34839	34844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020535	AGG	2	6	34860	34865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020535	TAT	2	6	34869	34874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020535	TAT	2	6	34880	34885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020535	TAT	2	6	34944	34949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020535	TTC	2	6	35009	35014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020535	TAT	2	6	35052	35057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020535	TAA	2	6	35142	35147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020535	AAG	2	6	35170	35175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020535	GTT	2	6	35200	35205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020535	TTA	2	6	35318	35323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020535	ATA	2	6	35348	35353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020535	TCT	2	6	36435	36440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020535	GAA	2	6	36544	36549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020535	TAA	2	6	36624	36629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020535	AGA	2	6	36693	36698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020535	GAA	2	6	36706	36711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020535	TGA	2	6	36729	36734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020535	CAG	2	6	36888	36893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020535	CTT	3	9	36915	36923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020535	CAA	2	6	37099	37104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020535	GTT	2	6	37171	37176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020535	ATA	2	6	37196	37201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020535	TAT	2	6	37236	37241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020535	CAA	2	6	37274	37279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.