MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	GA	3	6	229	234	50 %	0 %	50 %	0 %	469816295
2	NC_020535	AT	3	6	284	289	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
3	NC_020535	AC	3	6	592	597	50 %	0 %	0 %	50 %	469816295
4	NC_020535	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
5	NC_020535	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
6	NC_020535	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
7	NC_020535	TA	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
8	NC_020535	TA	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
9	NC_020535	AT	3	6	3324	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
10	NC_020535	AG	3	6	4998	5003	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
11	NC_020535	AT	3	6	5817	5822	50 %	50 %	0 %	0 %	469816297
12	NC_020535	AT	3	6	6796	6801	50 %	50 %	0 %	0 %	469816298
13	NC_020535	AT	3	6	8108	8113	50 %	50 %	0 %	0 %	469816299
14	NC_020535	CA	3	6	8408	8413	50 %	0 %	0 %	50 %	469816299
15	NC_020535	AT	3	6	8977	8982	50 %	50 %	0 %	0 %	469816300
16	NC_020535	TA	3	6	9484	9489	50 %	50 %	0 %	0 %	469816300
17	NC_020535	AG	3	6	10218	10223	50 %	0 %	50 %	0 %	469816301
18	NC_020535	AT	3	6	11862	11867	50 %	50 %	0 %	0 %	469816303
19	NC_020535	TA	3	6	12112	12117	50 %	50 %	0 %	0 %	469816303
20	NC_020535	TA	3	6	12396	12401	50 %	50 %	0 %	0 %	469816303
21	NC_020535	AT	3	6	13391	13396	50 %	50 %	0 %	0 %	469816304
22	NC_020535	TA	3	6	13750	13755	50 %	50 %	0 %	0 %	469816304
23	NC_020535	AT	3	6	13954	13959	50 %	50 %	0 %	0 %	469816304
24	NC_020535	AT	3	6	14578	14583	50 %	50 %	0 %	0 %	469816305
25	NC_020535	AT	3	6	14604	14609	50 %	50 %	0 %	0 %	469816305
26	NC_020535	AC	3	6	15432	15437	50 %	0 %	0 %	50 %	469816305
27	NC_020535	TA	3	6	15456	15461	50 %	50 %	0 %	0 %	469816305
28	NC_020535	AT	3	6	17105	17110	50 %	50 %	0 %	0 %	469816307
29	NC_020535	AT	3	6	17490	17495	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
30	NC_020535	AT	3	6	17864	17869	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
31	NC_020535	GA	3	6	18047	18052	50 %	0 %	50 %	0 %	469816308
32	NC_020535	AT	3	6	18393	18398	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
33	NC_020535	AT	3	6	18984	18989	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
34	NC_020535	AT	3	6	19573	19578	50 %	50 %	0 %	0 %	469816309
35	NC_020535	AT	3	6	19649	19654	50 %	50 %	0 %	0 %	469816309
36	NC_020535	TA	4	8	19764	19771	50 %	50 %	0 %	0 %	469816309
37	NC_020535	AT	3	6	20730	20735	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
38	NC_020535	TC	3	6	20788	20793	0 %	50 %	0 %	50 %	469816310
39	NC_020535	TA	3	6	20809	20814	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
40	NC_020535	AT	3	6	21068	21073	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
41	NC_020535	TA	3	6	21318	21323	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
42	NC_020535	TG	3	6	21923	21928	0 %	50 %	50 %	0 %	469816311
43	NC_020535	TA	3	6	22355	22360	50 %	50 %	0 %	0 %	469816311
44	NC_020535	AT	3	6	23380	23385	50 %	50 %	0 %	0 %	469816312
45	NC_020535	TA	3	6	24685	24690	50 %	50 %	0 %	0 %	469816313
46	NC_020535	TA	3	6	24786	24791	50 %	50 %	0 %	0 %	469816313
47	NC_020535	AT	3	6	24933	24938	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
48	NC_020535	AT	3	6	25585	25590	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
49	NC_020535	AT	4	8	25968	25975	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
50	NC_020535	AT	4	8	26095	26102	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
51	NC_020535	AT	5	10	26367	26376	50 %	50 %	0 %	0 %	469816315
52	NC_020535	AT	3	6	26405	26410	50 %	50 %	0 %	0 %	469816315
53	NC_020535	TA	3	6	29278	29283	50 %	50 %	0 %	0 %	469816318
54	NC_020535	TA	3	6	31016	31021	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
55	NC_020535	AT	3	6	31464	31469	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
56	NC_020535	TA	3	6	31505	31510	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
57	NC_020535	AT	3	6	31862	31867	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
58	NC_020535	TA	3	6	32125	32130	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
59	NC_020535	AT	3	6	32249	32254	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
60	NC_020535	TA	3	6	32372	32377	50 %	50 %	0 %	0 %	469816320
61	NC_020535	TA	3	6	32720	32725	50 %	50 %	0 %	0 %	469816320

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.