MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI4T8 complete sequence

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020534	TAATT	2	10	4359	4368	40 %	60 %	0 %	0 %	469816274
2	NC_020534	CATAA	2	10	5184	5193	60 %	20 %	0 %	20 %	469816275
3	NC_020534	GATAC	2	10	5388	5397	40 %	20 %	20 %	20 %	469816275
4	NC_020534	ACTCA	2	10	6315	6324	40 %	20 %	0 %	40 %	469816275
5	NC_020534	AATTA	2	10	6328	6337	60 %	40 %	0 %	0 %	469816275
6	NC_020534	AATAT	2	10	6745	6754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020534	CTTTA	2	10	8490	8499	20 %	60 %	0 %	20 %	469816277
8	NC_020534	TACTA	2	10	9199	9208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020534	ATTTG	2	10	9913	9922	20 %	60 %	20 %	0 %	469816278
10	NC_020534	AAAAG	2	10	10906	10915	80 %	0 %	20 %	0 %	469816279
11	NC_020534	TTATT	2	10	12237	12246	20 %	80 %	0 %	0 %	469816280
12	NC_020534	ATTCA	2	10	13664	13673	40 %	40 %	0 %	20 %	469816281
13	NC_020534	TATGA	2	10	14659	14668	40 %	40 %	20 %	0 %	469816282
14	NC_020534	AATAT	2	10	15065	15074	60 %	40 %	0 %	0 %	469816282
15	NC_020534	TATTT	2	10	15521	15530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020534	TGTGA	2	10	17360	17369	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020534	AAAAT	2	10	17801	17810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020534	TCTAA	2	10	17847	17856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020534	CTTGA	2	10	28484	28493	20 %	40 %	20 %	20 %	469816291
20	NC_020534	ATAAA	2	10	29153	29162	80 %	20 %	0 %	0 %	469816292
21	NC_020534	CTTTT	2	10	29399	29408	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020534	TCACA	2	10	29695	29704	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020534	CTTTA	2	10	30277	30286	20 %	60 %	0 %	20 %	469816293

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.