MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI4T8 complete sequence

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020534	CGTA	2	8	3199	3206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020534	GTAA	2	8	3289	3296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020534	TCTT	2	8	3422	3429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020534	TTCA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020534	ATTT	2	8	3461	3468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020534	GCAA	2	8	3500	3507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020534	TGAA	2	8	3513	3520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020534	AAGT	2	8	3529	3536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020534	AACG	2	8	3561	3568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020534	TAAA	2	8	3680	3687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020534	AAAT	2	8	3873	3880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020534	TATT	2	8	3976	3983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020534	ATTT	2	8	6892	6899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020534	AAGA	2	8	7934	7941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020534	TATT	2	8	8022	8029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020534	ATTG	2	8	8657	8664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020534	TAAC	2	8	8954	8961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020534	AATA	2	8	9347	9354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020534	CATT	2	8	9429	9436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020534	AACG	2	8	9506	9513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020534	AAAC	2	8	12664	12671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020534	TAAT	2	8	12917	12924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020534	TTTA	2	8	15936	15943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020534	TAGA	2	8	16014	16021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020534	TATT	2	8	16278	16285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020534	GTAT	2	8	16701	16708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020534	TTAG	2	8	16860	16867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020534	TGAA	2	8	17004	17011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020534	TTAC	2	8	17126	17133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020534	TTTA	2	8	17266	17273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020534	CTAG	2	8	18059	18066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020534	TAAA	2	8	18430	18437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020534	ATAA	2	8	18472	18479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020534	AAAT	2	8	18648	18655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020534	CAAA	2	8	18670	18677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020534	TACA	2	8	18964	18971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020534	TCGG	2	8	19831	19838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020534	GTGG	2	8	20881	20888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020534	ATTT	2	8	20901	20908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020534	ATTT	2	8	20916	20923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020534	AGGT	2	8	21207	21214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020534	TGTA	2	8	21533	21540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020534	TATT	2	8	23196	23203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020534	TATT	2	8	25144	25151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020534	TAGA	2	8	25177	25184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020534	CATC	2	8	28006	28013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020534	TACA	2	8	28059	28066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020534	ATTT	2	8	29328	29335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020534	TTAT	2	8	29847	29854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.