MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI4T8 complete sequence

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020534	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020534	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020534	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020534	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020534	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020534	TGA	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816272
7	NC_020534	CAT	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816272
8	NC_020534	GCT	2	6	761	766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020534	TTC	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020534	TCA	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
11	NC_020534	TAG	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
12	NC_020534	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816273
13	NC_020534	ATC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
14	NC_020534	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816273
15	NC_020534	CAT	2	6	1202	1207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
16	NC_020534	TGA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
17	NC_020534	AAT	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816273
18	NC_020534	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
19	NC_020534	ATT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816273
20	NC_020534	TGT	2	6	1711	1716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816273
21	NC_020534	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
22	NC_020534	TTC	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
23	NC_020534	CCA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816273
24	NC_020534	AAT	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816273
25	NC_020534	AGT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
26	NC_020534	TCA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
27	NC_020534	AGC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816273
28	NC_020534	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816273
29	NC_020534	ATT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816273
30	NC_020534	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
31	NC_020534	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816273
32	NC_020534	ATG	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
33	NC_020534	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
34	NC_020534	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
35	NC_020534	TAG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
36	NC_020534	TCT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
37	NC_020534	TTC	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
38	NC_020534	TCT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
39	NC_020534	CTT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020534	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020534	TCA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020534	CTT	2	6	3162	3167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020534	ACC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020534	ATG	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020534	TTC	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020534	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020534	TAT	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020534	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020534	ATA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020534	AAT	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020534	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020534	TGA	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020534	TAT	2	6	3816	3821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020534	ATA	2	6	3888	3893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020534	ATA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020534	ATA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020534	CAT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816274
58	NC_020534	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816274
59	NC_020534	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816274
60	NC_020534	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816274
61	NC_020534	TAT	2	6	4474	4479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816274
62	NC_020534	ATC	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816274
63	NC_020534	TTA	2	6	4602	4607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816274
64	NC_020534	AAT	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816274
65	NC_020534	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
66	NC_020534	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
67	NC_020534	TTA	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
68	NC_020534	TTA	2	6	5004	5009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
69	NC_020534	CTT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816275
70	NC_020534	TAA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
71	NC_020534	AAT	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
72	NC_020534	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816275
73	NC_020534	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
74	NC_020534	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
75	NC_020534	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
76	NC_020534	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816275
77	NC_020534	TAT	3	9	5612	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
78	NC_020534	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
79	NC_020534	TAT	2	6	5741	5746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
80	NC_020534	AGA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
81	NC_020534	AAG	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
82	NC_020534	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
83	NC_020534	ATG	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816275
84	NC_020534	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
85	NC_020534	ATG	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816275
86	NC_020534	TCT	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816275
87	NC_020534	ATT	2	6	6485	6490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
88	NC_020534	TAA	2	6	6557	6562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
89	NC_020534	GGT	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816275
90	NC_020534	TAT	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
91	NC_020534	AAG	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020534	TCA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020534	AGA	2	6	6918	6923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020534	TAA	2	6	6957	6962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020534	GAA	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020534	GAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020534	ATA	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020534	TTA	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020534	TAA	2	6	7144	7149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020534	TTG	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816276
101	NC_020534	TAA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816276
102	NC_020534	AGA	2	6	7610	7615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816276
103	NC_020534	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816276
104	NC_020534	TTC	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816276
105	NC_020534	GTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816276
106	NC_020534	AAT	2	6	7893	7898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816276
107	NC_020534	TTG	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020534	ATC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816277
109	NC_020534	AAG	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816277
110	NC_020534	ATG	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816277
111	NC_020534	ATT	2	6	8264	8269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816277
112	NC_020534	ATT	2	6	8280	8285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816277
113	NC_020534	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816277
114	NC_020534	GTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816277
115	NC_020534	AGA	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816277
116	NC_020534	AAG	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816277
117	NC_020534	ATT	2	6	8711	8716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020534	TAA	2	6	8729	8734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020534	TAA	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020534	TAT	3	9	8916	8924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020534	ACA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020534	ATT	2	6	9415	9420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020534	GTA	3	9	9477	9485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020534	ATA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020534	ATT	2	6	9559	9564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816278
126	NC_020534	TGC	2	6	9668	9673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816278
127	NC_020534	CAT	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816278
128	NC_020534	CCT	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816278
129	NC_020534	ATT	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816278
130	NC_020534	ATA	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816278
131	NC_020534	GTT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816278
132	NC_020534	TTC	2	6	9953	9958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816278
133	NC_020534	ATA	2	6	10004	10009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816278
134	NC_020534	TAC	2	6	10021	10026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816278
135	NC_020534	AGT	3	9	10052	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816278
136	NC_020534	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816278
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268	NC_020534	TCA	2	6	19032	19037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_020534	ATA	2	6	19050	19055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816283
270	NC_020534	CTT	2	6	19103	19108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816283
271	NC_020534	TCA	2	6	19126	19131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816283
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275	NC_020534	TTA	2	6	19528	19533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816283
276	NC_020534	CAA	2	6	19562	19567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816283
277	NC_020534	CTT	2	6	19715	19720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816283
278	NC_020534	CAA	2	6	19963	19968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_020534	ATT	2	6	19990	19995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816284
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287	NC_020534	AAT	2	6	20472	20477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816284
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290	NC_020534	CAT	2	6	20642	20647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816284
291	NC_020534	TAT	2	6	20668	20673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020534	TAT	2	6	20756	20761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020534	GAA	3	9	20810	20818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_020534	ACC	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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300	NC_020534	CAC	2	6	21627	21632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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396	NC_020534	AAG	2	6	28750	28755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816291
397	NC_020534	CTT	2	6	28857	28862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816292
398	NC_020534	ATC	2	6	28867	28872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816292
399	NC_020534	AAC	2	6	29270	29275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816292
400	NC_020534	AAT	2	6	29360	29365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_020534	TAA	2	6	29417	29422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_020534	ACA	2	6	29533	29538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_020534	TAA	2	6	29581	29586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_020534	CTG	2	6	29599	29604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_020534	ATT	2	6	29795	29800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_020534	AAT	2	6	29814	29819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_020534	AAG	2	6	29914	29919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_020534	TTC	2	6	29925	29930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_020534	ACA	2	6	30039	30044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816293
410	NC_020534	CAA	2	6	30180	30185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816293
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415	NC_020534	TCT	2	6	30828	30833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.