MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI4T8 complete sequence

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020534	TGA	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816272
2	NC_020534	CAT	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816272
3	NC_020534	TCA	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
4	NC_020534	TAG	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
5	NC_020534	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816273
6	NC_020534	ATC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
7	NC_020534	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816273
8	NC_020534	CAT	2	6	1202	1207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
9	NC_020534	TGA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
10	NC_020534	AAT	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816273
11	NC_020534	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
12	NC_020534	ATT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816273
13	NC_020534	TGT	2	6	1711	1716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816273
14	NC_020534	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
15	NC_020534	TTC	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
16	NC_020534	CCA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816273
17	NC_020534	AAT	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816273
18	NC_020534	AGT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
19	NC_020534	TCA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
20	NC_020534	AGC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816273
21	NC_020534	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816273
22	NC_020534	ATT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816273
23	NC_020534	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
24	NC_020534	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816273
25	NC_020534	ATG	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
26	NC_020534	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816273
27	NC_020534	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
28	NC_020534	TAG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816273
29	NC_020534	TCT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
30	NC_020534	TTC	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
31	NC_020534	TCT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816273
32	NC_020534	CAT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816274
33	NC_020534	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816274
34	NC_020534	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816274
35	NC_020534	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816274
36	NC_020534	TAT	2	6	4474	4479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816274
37	NC_020534	ATC	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816274
38	NC_020534	TTA	2	6	4602	4607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816274
39	NC_020534	AAT	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816274
40	NC_020534	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
41	NC_020534	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
42	NC_020534	TTA	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
43	NC_020534	TTA	2	6	5004	5009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
44	NC_020534	CTT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816275
45	NC_020534	TAA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
46	NC_020534	AAT	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
47	NC_020534	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816275
48	NC_020534	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
49	NC_020534	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
50	NC_020534	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
51	NC_020534	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816275
52	NC_020534	TAT	3	9	5612	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
53	NC_020534	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
54	NC_020534	TAT	2	6	5741	5746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
55	NC_020534	AGA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
56	NC_020534	AAG	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
57	NC_020534	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816275
58	NC_020534	ATG	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816275
59	NC_020534	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
60	NC_020534	ATG	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816275
61	NC_020534	TCT	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816275
62	NC_020534	ATT	2	6	6485	6490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
63	NC_020534	TAA	2	6	6557	6562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816275
64	NC_020534	GGT	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816275
65	NC_020534	TAT	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816275
66	NC_020534	TTG	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816276
67	NC_020534	TAA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816276
68	NC_020534	AGA	2	6	7610	7615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816276
69	NC_020534	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816276
70	NC_020534	TTC	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816276
71	NC_020534	GTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816276
72	NC_020534	AAT	2	6	7893	7898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816276
73	NC_020534	ATC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816277
74	NC_020534	AAG	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816277
75	NC_020534	ATG	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816277
76	NC_020534	ATT	2	6	8264	8269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816277
77	NC_020534	ATT	2	6	8280	8285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816277
78	NC_020534	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816277
79	NC_020534	GTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816277
80	NC_020534	AGA	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816277
81	NC_020534	AAG	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816277
82	NC_020534	ATT	2	6	9559	9564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816278
83	NC_020534	TGC	2	6	9668	9673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816278
84	NC_020534	CAT	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816278
85	NC_020534	CCT	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816278
86	NC_020534	ATT	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816278
87	NC_020534	ATA	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816278
88	NC_020534	GTT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816278
89	NC_020534	TTC	2	6	9953	9958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816278
90	NC_020534	ATA	2	6	10004	10009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816278
91	NC_020534	TAC	2	6	10021	10026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816278
92	NC_020534	AGT	3	9	10052	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816278
93	NC_020534	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816278
94	NC_020534	ATG	2	6	10334	10339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816279
95	NC_020534	TAG	2	6	10365	10370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816279
96	NC_020534	GTT	2	6	10391	10396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816279
97	NC_020534	GAA	2	6	10548	10553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816279
98	NC_020534	ATT	2	6	10561	10566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816279
99	NC_020534	TAA	2	6	10671	10676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816279
100	NC_020534	ACT	2	6	10682	10687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816279
101	NC_020534	GGA	2	6	10793	10798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	469816279
102	NC_020534	ATA	2	6	10856	10861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816279
103	NC_020534	AAG	2	6	10998	11003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816279
104	NC_020534	ATT	2	6	11015	11020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816279
105	NC_020534	TGC	2	6	11146	11151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816279
106	NC_020534	TTA	2	6	11186	11191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816279
107	NC_020534	GAA	2	6	11216	11221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816279
108	NC_020534	GCG	2	6	11303	11308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	469816279
109	NC_020534	TAT	2	6	11368	11373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816279
110	NC_020534	TAA	2	6	11469	11474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816279
111	NC_020534	GCT	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816279
112	NC_020534	TCT	2	6	11576	11581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816279
113	NC_020534	TCA	2	6	11618	11623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816279
114	NC_020534	GAA	2	6	11657	11662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816279
115	NC_020534	CAT	2	6	11730	11735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816279
116	NC_020534	ATG	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816279
117	NC_020534	TAG	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816279
118	NC_020534	TGA	2	6	12051	12056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816280
119	NC_020534	TAG	2	6	12120	12125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816280
120	NC_020534	TTA	2	6	12209	12214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816280
121	NC_020534	TTA	2	6	12357	12362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816280
122	NC_020534	TAT	3	9	12400	12408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816280
123	NC_020534	TAC	2	6	12414	12419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816280
124	NC_020534	ATG	2	6	12597	12602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816280
125	NC_020534	ATT	2	6	12613	12618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816280
126	NC_020534	TTC	2	6	13004	13009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816281
127	NC_020534	ATC	2	6	13019	13024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816281
128	NC_020534	TGT	2	6	13119	13124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816281
129	NC_020534	TTC	2	6	13142	13147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816281
130	NC_020534	CTT	2	6	13159	13164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816281
131	NC_020534	TTA	2	6	13260	13265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816281
132	NC_020534	TTG	2	6	13283	13288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816281
133	NC_020534	TTG	2	6	13328	13333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816281
134	NC_020534	GTT	2	6	13339	13344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816281
135	NC_020534	ATT	2	6	13454	13459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816281
136	NC_020534	ATT	2	6	13637	13642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816281
137	NC_020534	ACC	2	6	13740	13745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816281
138	NC_020534	TAT	2	6	14139	14144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816282
139	NC_020534	CAG	2	6	14243	14248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816282
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145	NC_020534	ATA	2	6	14621	14626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816282
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151	NC_020534	GAA	2	6	14773	14778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816282
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153	NC_020534	ATT	2	6	14833	14838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816282
154	NC_020534	TTA	2	6	14889	14894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816282
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253	NC_020534	GCA	2	6	30221	30226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816293
254	NC_020534	TCC	2	6	30311	30316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816293
255	NC_020534	CAG	2	6	30357	30362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816293
256	NC_020534	TGC	2	6	30469	30474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816293

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.