MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020533	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
2	NC_020533	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020533	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020533	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194250
5	NC_020533	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194250
6	NC_020533	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194250
7	NC_020533	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
8	NC_020533	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194250
9	NC_020533	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194252
10	NC_020533	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194252
11	NC_020533	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020533	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194256
13	NC_020533	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194256
14	NC_020533	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470194257
15	NC_020533	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020533	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020533	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194258
18	NC_020533	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194258
19	NC_020533	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194259
20	NC_020533	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194260
21	NC_020533	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194262
22	NC_020533	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194265
23	NC_020533	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194266
24	NC_020533	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194268
25	NC_020533	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020533	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020533	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470194270
28	NC_020533	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020533	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020533	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194276
31	NC_020533	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470194276
32	NC_020533	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194279
33	NC_020533	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470194280
34	NC_020533	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470194280
35	NC_020533	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470194281
36	NC_020533	TTGTGA	2	12	59572	59583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194283
37	NC_020533	TTTATA	2	12	59912	59923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194283
38	NC_020533	TTTATC	2	12	60216	60227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194284
39	NC_020533	ACAAAT	2	12	63549	63560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470194286
40	NC_020533	AATTAA	2	12	63640	63651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194286
41	NC_020533	ATTTAT	2	12	66060	66071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020533	TTAATG	2	12	66584	66595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194287
43	NC_020533	AAGTCA	2	12	67789	67800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194288
44	NC_020533	AAAAAG	2	12	67903	67914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194288
45	NC_020533	GAAAAA	2	12	68216	68227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194288
46	NC_020533	AATTAT	2	12	70455	70466	50 %	50 %	0 %	0 %	470194290
47	NC_020533	ACCCTT	2	12	72294	72305	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470194291
48	NC_020533	TTTAGC	2	12	74203	74214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194292
49	NC_020533	AAATAA	2	12	74254	74265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470194292
50	NC_020533	GTTAGA	2	12	76377	76388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194293
51	NC_020533	AAAAGA	2	12	76431	76442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194293
52	NC_020533	GCTAAA	2	12	79219	79230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194295
53	NC_020533	AACAAA	2	12	79640	79651	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020533	TAAAGA	2	12	83367	83378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194300
55	NC_020533	AACCAC	2	12	87238	87249	50 %	0 %	0 %	50 %	470194302
56	NC_020533	AATATA	2	12	88940	88951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020533	AACCGA	2	12	90549	90560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470194304
58	NC_020533	ATAGAT	2	12	95449	95460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194307
59	NC_020533	TATCAT	2	12	96216	96227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194308
60	NC_020533	TTTATT	2	12	96624	96635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470194309
61	NC_020533	TATTTG	2	12	96710	96721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194309
62	NC_020533	TAAATA	2	12	98143	98154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194309
63	NC_020533	TTTTTC	2	12	99837	99848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470194310
64	NC_020533	TTAAAT	2	12	99932	99943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020533	TAACAA	2	12	101289	101300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020533	TAAGCC	2	12	101698	101709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194312
67	NC_020533	ATCGCA	2	12	102913	102924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194313
68	NC_020533	TTTGAA	2	12	103944	103955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194314
69	NC_020533	CAATGG	2	12	112902	112913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470194320
70	NC_020533	TGAAGA	2	12	113736	113747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194321
71	NC_020533	TTTCAT	2	12	114417	114428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194322
72	NC_020533	TGTATA	2	12	118637	118648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194326
73	NC_020533	TCGAAA	2	12	120138	120149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194328
74	NC_020533	CTATTG	2	12	122724	122735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194330
75	NC_020533	CATATG	2	12	123927	123938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194331
76	NC_020533	AATGTA	2	12	124828	124839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020533	CTGTAA	2	12	126649	126660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020533	GGTATG	2	12	126970	126981	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470194334
79	NC_020533	CAGATT	2	12	129568	129579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194336
80	NC_020533	AGATAT	2	12	136946	136957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194343
81	NC_020533	GTTTTT	2	12	137855	137866	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020533	ATGCCT	2	12	138085	138096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470194344
83	NC_020533	TGAAAG	2	12	138725	138736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194344
84	NC_020533	GATATG	2	12	146225	146236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194350
85	NC_020533	ATTTGA	2	12	150131	150142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194353
86	NC_020533	GATTTT	2	12	154642	154653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194358
87	NC_020533	ACAAAG	2	12	159162	159173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470194362
88	NC_020533	TGTAAT	2	12	160186	160197	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020533	AAAGAT	2	12	161175	161186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194363
90	NC_020533	ATTAAT	2	12	163081	163092	50 %	50 %	0 %	0 %	470194364
91	NC_020533	CAATAT	2	12	163647	163658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194364
92	NC_020533	TCCCAC	2	12	164398	164409	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020533	TTGGTA	2	12	167732	167743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194368
94	NC_020533	GCGATT	2	12	167752	167763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470194368
95	NC_020533	AAATTT	2	12	167850	167861	50 %	50 %	0 %	0 %	470194368
96	NC_020533	ACCTGC	2	12	170753	170764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470194370
97	NC_020533	AAGATA	2	12	170899	170910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194370
98	NC_020533	CGTTAA	2	12	173833	173844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194372
99	NC_020533	CTATTA	2	12	175684	175695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194372
100	NC_020533	TATGAT	2	12	177218	177229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194372
101	NC_020533	TTGAAA	2	12	177670	177681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194372
102	NC_020533	AACATT	2	12	180110	180121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194372
103	NC_020533	AGCAAC	2	12	183599	183610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470194376
104	NC_020533	TGTTTG	2	12	183647	183658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194376
105	NC_020533	CACCTT	2	12	185651	185662	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470194378
106	NC_020533	ACCTTT	2	12	186156	186167	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470194378
107	NC_020533	TTTATA	2	12	186252	186263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020533	ATTAAT	2	12	186275	186286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020533	GTAAAT	2	12	189895	189906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194381
110	NC_020533	ATTTTA	2	12	191490	191501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194382
111	NC_020533	TATCTT	2	12	196104	196115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194385
112	NC_020533	ATTTGG	2	12	197117	197128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194386
113	NC_020533	GAGTTT	2	12	200460	200471	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194387
114	NC_020533	TATACA	2	12	204461	204472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194391
115	NC_020533	TTATTT	2	12	206493	206504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470194392
116	NC_020533	ATTTAT	2	12	207072	207083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194392
117	NC_020533	TTTTTA	2	12	207103	207114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020533	CCCTGA	2	12	209830	209841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470194395
119	NC_020533	TCCTGA	2	12	210649	210660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470194395
120	NC_020533	TCAATT	2	12	212800	212811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194397
121	NC_020533	AATATG	2	12	214100	214111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194398
122	NC_020533	GATTTT	2	12	217256	217267	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020533	AAAAAT	2	12	217607	217618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470194400
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129	NC_020533	GGAATA	2	12	252832	252843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020533	TGGTAT	2	12	264412	264423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020533	TATAGA	2	12	267766	267777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194434
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240	NC_020533	AGTTGA	2	12	490551	490562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_020533	TAAAAA	2	12	491499	491510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470194598
242	NC_020533	TTATAA	2	12	492946	492957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_020533	TTTATA	2	12	493863	493874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194600
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275	NC_020533	GTTATA	2	12	555502	555513	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_020533	CCAAAC	2	12	596079	596090	50 %	0 %	0 %	50 %	470194663
342	NC_020533	TTTTGA	2	12	601866	601877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194669
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345	NC_020533	TATTTA	2	12	605980	605991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194671
346	NC_020533	AATGAT	2	12	608657	608668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_020533	TAGATG	2	12	608730	608741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
348	NC_020533	CATGAC	2	12	610680	610691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
349	NC_020533	GCAATT	2	12	612519	612530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194676
350	NC_020533	GAAAAA	2	12	613080	613091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194676
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352	NC_020533	TTGATA	2	12	617328	617339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194680
353	NC_020533	TAAAAT	2	12	624050	624061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_020533	GATTCA	2	12	829149	829160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
470	NC_020533	GATTCA	2	12	829185	829196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
471	NC_020533	GATTCA	2	12	829203	829214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
472	NC_020533	GATTCA	2	12	829221	829232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
473	NC_020533	ATTCAG	2	12	829258	829269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
474	NC_020533	GATTCA	2	12	829563	829574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
475	NC_020533	TCAGAC	2	12	829584	829595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194844
476	NC_020533	TCAGAT	2	12	829602	829613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
477	NC_020533	GATTCA	2	12	829617	829628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
478	NC_020533	GACTCA	2	12	829671	829682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194844
479	NC_020533	GATTCA	2	12	829761	829772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
480	NC_020533	GACTCA	2	12	829797	829808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194844
481	NC_020533	GATTCA	2	12	829815	829826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194844
482	NC_020533	GACTCA	2	12	829833	829844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194844
483	NC_020533	TATCAA	2	12	832167	832178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
484	NC_020533	AGTACT	2	12	833705	833716	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194847
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487	NC_020533	CTGTTT	2	12	836765	836776	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
488	NC_020533	GCTCAA	2	12	839281	839292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194850
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491	NC_020533	TAAAAA	2	12	845067	845078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_020533	AAATTA	2	12	858702	858713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_020533	TGAAGG	2	12	862455	862466	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470194868

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