MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020533	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
2	NC_020533	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194250
3	NC_020533	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194250
4	NC_020533	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194250
5	NC_020533	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
6	NC_020533	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194250
7	NC_020533	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194252
8	NC_020533	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194252
9	NC_020533	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194256
10	NC_020533	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194256
11	NC_020533	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470194257
12	NC_020533	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194258
13	NC_020533	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194258
14	NC_020533	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194259
15	NC_020533	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194260
16	NC_020533	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194262
17	NC_020533	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194265
18	NC_020533	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194266
19	NC_020533	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194268
20	NC_020533	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470194270
21	NC_020533	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194276
22	NC_020533	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470194276
23	NC_020533	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194279
24	NC_020533	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470194280
25	NC_020533	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470194280
26	NC_020533	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470194281
27	NC_020533	TTGTGA	2	12	59572	59583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194283
28	NC_020533	TTTATA	2	12	59912	59923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194283
29	NC_020533	TTTATC	2	12	60216	60227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194284
30	NC_020533	ACAAAT	2	12	63549	63560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470194286
31	NC_020533	AATTAA	2	12	63640	63651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194286
32	NC_020533	TTAATG	2	12	66584	66595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194287
33	NC_020533	AAGTCA	2	12	67789	67800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194288
34	NC_020533	AAAAAG	2	12	67903	67914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194288
35	NC_020533	GAAAAA	2	12	68216	68227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194288
36	NC_020533	AATTAT	2	12	70455	70466	50 %	50 %	0 %	0 %	470194290
37	NC_020533	ACCCTT	2	12	72294	72305	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470194291
38	NC_020533	TTTAGC	2	12	74203	74214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194292
39	NC_020533	AAATAA	2	12	74254	74265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470194292
40	NC_020533	GTTAGA	2	12	76377	76388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194293
41	NC_020533	AAAAGA	2	12	76431	76442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194293
42	NC_020533	GCTAAA	2	12	79219	79230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194295
43	NC_020533	TAAAGA	2	12	83367	83378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194300
44	NC_020533	AACCAC	2	12	87238	87249	50 %	0 %	0 %	50 %	470194302
45	NC_020533	AACCGA	2	12	90549	90560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470194304
46	NC_020533	ATAGAT	2	12	95449	95460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194307
47	NC_020533	TATCAT	2	12	96216	96227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194308
48	NC_020533	TTTATT	2	12	96624	96635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470194309
49	NC_020533	TATTTG	2	12	96710	96721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194309
50	NC_020533	TAAATA	2	12	98143	98154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194309
51	NC_020533	TTTTTC	2	12	99837	99848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470194310
52	NC_020533	TAAGCC	2	12	101698	101709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194312
53	NC_020533	ATCGCA	2	12	102913	102924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194313
54	NC_020533	TTTGAA	2	12	103944	103955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194314
55	NC_020533	CAATGG	2	12	112902	112913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470194320
56	NC_020533	TGAAGA	2	12	113736	113747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194321
57	NC_020533	TTTCAT	2	12	114417	114428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194322
58	NC_020533	TGTATA	2	12	118637	118648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194326
59	NC_020533	TCGAAA	2	12	120138	120149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194328
60	NC_020533	CTATTG	2	12	122724	122735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194330
61	NC_020533	CATATG	2	12	123927	123938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194331
62	NC_020533	GGTATG	2	12	126970	126981	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470194334
63	NC_020533	CAGATT	2	12	129568	129579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194336
64	NC_020533	AGATAT	2	12	136946	136957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194343
65	NC_020533	ATGCCT	2	12	138085	138096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470194344
66	NC_020533	TGAAAG	2	12	138725	138736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194344
67	NC_020533	GATATG	2	12	146225	146236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194350
68	NC_020533	ATTTGA	2	12	150131	150142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194353
69	NC_020533	GATTTT	2	12	154642	154653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470194358
70	NC_020533	ACAAAG	2	12	159162	159173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470194362
71	NC_020533	AAAGAT	2	12	161175	161186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194363
72	NC_020533	ATTAAT	2	12	163081	163092	50 %	50 %	0 %	0 %	470194364
73	NC_020533	CAATAT	2	12	163647	163658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194364
74	NC_020533	TTGGTA	2	12	167732	167743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194368
75	NC_020533	GCGATT	2	12	167752	167763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470194368
76	NC_020533	AAATTT	2	12	167850	167861	50 %	50 %	0 %	0 %	470194368
77	NC_020533	ACCTGC	2	12	170753	170764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470194370
78	NC_020533	AAGATA	2	12	170899	170910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194370
79	NC_020533	CGTTAA	2	12	173833	173844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194372
80	NC_020533	CTATTA	2	12	175684	175695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194372
81	NC_020533	TATGAT	2	12	177218	177229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194372
82	NC_020533	TTGAAA	2	12	177670	177681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194372
83	NC_020533	AACATT	2	12	180110	180121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194372
84	NC_020533	AGCAAC	2	12	183599	183610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470194376
85	NC_020533	TGTTTG	2	12	183647	183658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194376
86	NC_020533	CACCTT	2	12	185651	185662	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470194378
87	NC_020533	ACCTTT	2	12	186156	186167	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470194378
88	NC_020533	GTAAAT	2	12	189895	189906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194381
89	NC_020533	ATTTTA	2	12	191490	191501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194382
90	NC_020533	TATCTT	2	12	196104	196115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194385
91	NC_020533	ATTTGG	2	12	197117	197128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194386
92	NC_020533	GAGTTT	2	12	200460	200471	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470194387
93	NC_020533	TATACA	2	12	204461	204472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194391
94	NC_020533	TTATTT	2	12	206493	206504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470194392
95	NC_020533	ATTTAT	2	12	207072	207083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194392
96	NC_020533	CCCTGA	2	12	209830	209841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470194395
97	NC_020533	TCCTGA	2	12	210649	210660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470194395
98	NC_020533	TCAATT	2	12	212800	212811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194397
99	NC_020533	AATATG	2	12	214100	214111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194398
100	NC_020533	AAAAAT	2	12	217607	217618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470194400
101	NC_020533	AGGACA	2	12	219467	219478	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470194402
102	NC_020533	ACATTT	2	12	219803	219814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194402
103	NC_020533	TTCTTG	2	12	224732	224743	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470194406
104	NC_020533	GGACGT	2	12	235234	235245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470194415
105	NC_020533	TATAGA	2	12	267766	267777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194434
106	NC_020533	ACGATG	2	12	274395	274406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470194439
107	NC_020533	AGAATC	2	12	281953	281964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194444
108	NC_020533	AAGTAA	2	12	285376	285387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194448
109	NC_020533	ATAAAG	2	12	286357	286368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194449
110	NC_020533	GACATT	2	12	288048	288059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194450
111	NC_020533	GATTTC	2	12	289867	289878	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194452
112	NC_020533	TTCATA	2	12	290437	290448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470194453
113	NC_020533	GATTAT	2	12	294844	294855	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194456
114	NC_020533	ATGGTG	2	12	294977	294988	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470194456
115	NC_020533	CAGCAA	2	12	295364	295375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470194456
116	NC_020533	TCTTCA	2	12	300943	300954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470194461
117	NC_020533	TTATCT	2	12	301039	301050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194461
118	NC_020533	GAAAAA	2	12	303301	303312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194463
119	NC_020533	GATACA	2	12	304466	304477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194463
120	NC_020533	ACAAGA	2	12	307633	307644	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470194464
121	NC_020533	AGGACA	2	12	308011	308022	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470194464
122	NC_020533	TAAATT	2	12	310861	310872	50 %	50 %	0 %	0 %	470194465
123	NC_020533	TGAAGA	2	12	311122	311133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470194465
124	NC_020533	TAAAAC	2	12	317571	317582	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470194469
125	NC_020533	CTGAAT	2	12	324056	324067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194475
126	NC_020533	GAAAAA	2	12	328251	328262	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194478
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131	NC_020533	AATGCA	2	12	343858	343869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194490
132	NC_020533	AATGAC	2	12	346912	346923	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470194493
133	NC_020533	AAAATG	2	12	348393	348404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194494
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137	NC_020533	GATGCT	2	12	367078	367089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470194509
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140	NC_020533	ATTAAA	2	12	370861	370872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194511
141	NC_020533	AGGACA	2	12	374601	374612	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470194515
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219	NC_020533	CTGGTA	2	12	562916	562927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470194643
220	NC_020533	ACGACT	2	12	564640	564651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194645
221	NC_020533	AACGTG	2	12	565613	565624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470194645
222	NC_020533	TTCGAA	2	12	566134	566145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194645
223	NC_020533	TACAGC	2	12	568380	568391	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194647
224	NC_020533	TTGCTA	2	12	568661	568672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194647
225	NC_020533	AAATCA	2	12	569784	569795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470194648
226	NC_020533	TTATGA	2	12	575428	575439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470194652
227	NC_020533	TTTCTT	2	12	578622	578633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470194655
228	NC_020533	AAGCAC	2	12	579550	579561	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470194656
229	NC_020533	ACTGCA	2	12	581556	581567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194658
230	NC_020533	TTAAAA	2	12	581952	581963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194658
231	NC_020533	TCAGAT	2	12	583494	583505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194658
232	NC_020533	GACTCA	2	12	583509	583520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194658
233	NC_020533	GACTCA	2	12	583527	583538	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194658
234	NC_020533	GACTCA	2	12	583557	583568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194658
235	NC_020533	GACTCA	2	12	583629	583640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194658
236	NC_020533	GACTCA	2	12	583677	583688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194658
237	NC_020533	TCAGAT	2	12	583734	583745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194658
238	NC_020533	GATTCA	2	12	583839	583850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194658
239	NC_020533	GATTCA	2	12	583857	583868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194658
240	NC_020533	TCAGAT	2	12	583878	583889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194658
241	NC_020533	GACTCA	2	12	583893	583904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194658
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250	NC_020533	GATTCA	2	12	587991	588002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194659
251	NC_020533	GACTCA	2	12	588009	588020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194659
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253	NC_020533	GATTCA	2	12	588045	588056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194659
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258	NC_020533	GACTCA	2	12	588189	588200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470194659
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338	NC_020533	TCAATA	2	12	755469	755480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194790
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341	NC_020533	CTGGTG	2	12	761737	761748	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470194794
342	NC_020533	GAAAAA	2	12	762005	762016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194794
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344	NC_020533	ATTCTT	2	12	763712	763723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470194795
345	NC_020533	AATGAT	2	12	764530	764541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194796
346	NC_020533	CAACTA	2	12	768340	768351	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470194799
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