MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 42591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020533	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020533	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020533	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020533	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020533	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020533	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
7	NC_020533	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194246
8	NC_020533	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194246
9	NC_020533	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194246
10	NC_020533	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
11	NC_020533	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194246
12	NC_020533	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194246
13	NC_020533	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194246
14	NC_020533	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194246
15	NC_020533	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
16	NC_020533	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194246
17	NC_020533	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194246
18	NC_020533	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
19	NC_020533	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
20	NC_020533	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194246
21	NC_020533	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
22	NC_020533	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194246
23	NC_020533	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
24	NC_020533	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194246
25	NC_020533	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194246
26	NC_020533	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
27	NC_020533	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
28	NC_020533	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194246
29	NC_020533	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194246
30	NC_020533	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194246
31	NC_020533	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
32	NC_020533	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194246
33	NC_020533	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
34	NC_020533	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194246
35	NC_020533	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020533	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020533	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020533	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
39	NC_020533	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
40	NC_020533	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194247
41	NC_020533	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
42	NC_020533	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194247
43	NC_020533	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
44	NC_020533	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194247
45	NC_020533	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194247
46	NC_020533	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194247
47	NC_020533	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194247
48	NC_020533	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
49	NC_020533	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194247
50	NC_020533	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
51	NC_020533	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194247
52	NC_020533	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194247
53	NC_020533	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
54	NC_020533	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194247
55	NC_020533	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194247
56	NC_020533	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194247
57	NC_020533	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194247
58	NC_020533	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194247
59	NC_020533	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194247
60	NC_020533	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194247
61	NC_020533	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020533	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020533	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020533	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020533	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020533	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020533	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020533	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194248
69	NC_020533	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194248
70	NC_020533	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194248
71	NC_020533	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470194248
72	NC_020533	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194248
73	NC_020533	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194248
74	NC_020533	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194248
75	NC_020533	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194248
76	NC_020533	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194248
77	NC_020533	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194248
78	NC_020533	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194248
79	NC_020533	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194248
80	NC_020533	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194248
81	NC_020533	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194248
82	NC_020533	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194248
83	NC_020533	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194248
84	NC_020533	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194249
85	NC_020533	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194249
86	NC_020533	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194249
87	NC_020533	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194249
88	NC_020533	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194249
89	NC_020533	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194249
90	NC_020533	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194249
91	NC_020533	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194249
92	NC_020533	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
93	NC_020533	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194249
94	NC_020533	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194249
95	NC_020533	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
96	NC_020533	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194249
97	NC_020533	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194249
98	NC_020533	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194249
99	NC_020533	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194249
100	NC_020533	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
101	NC_020533	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194249
102	NC_020533	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194249
103	NC_020533	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194249
104	NC_020533	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194249
105	NC_020533	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194249
106	NC_020533	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
107	NC_020533	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194249
108	NC_020533	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194249
109	NC_020533	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194249
110	NC_020533	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194249
111	NC_020533	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194249
112	NC_020533	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020533	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194250
114	NC_020533	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194250
115	NC_020533	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194250
116	NC_020533	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194250
117	NC_020533	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
118	NC_020533	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194250
119	NC_020533	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470194250
120	NC_020533	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194250
121	NC_020533	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194250
122	NC_020533	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194250
123	NC_020533	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
124	NC_020533	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194250
125	NC_020533	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194250
126	NC_020533	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194250
127	NC_020533	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194250
128	NC_020533	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194250
129	NC_020533	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194250
130	NC_020533	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194250
131	NC_020533	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194250
132	NC_020533	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194250
133	NC_020533	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
134	NC_020533	TAC	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194250
135	NC_020533	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194250
136	NC_020533	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194250
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138	NC_020533	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194250
139	NC_020533	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194250
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254	NC_020533	TAT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_020533	ATT	2	6	14780	14785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194254
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261	NC_020533	ATG	2	6	15330	15335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194254
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265	NC_020533	TGT	2	6	15529	15534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020533	ATT	2	6	15593	15598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_020533	ATT	2	6	15704	15709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_020533	AAT	2	6	17211	17216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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