MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020532	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192282
2	NC_020532	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020532	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020532	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470192285
5	NC_020532	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470192285
6	NC_020532	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192285
7	NC_020532	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192285
8	NC_020532	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470192285
9	NC_020532	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470192287
10	NC_020532	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192287
11	NC_020532	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020532	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470192291
13	NC_020532	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192291
14	NC_020532	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470192292
15	NC_020532	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020532	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020532	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470192293
18	NC_020532	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192293
19	NC_020532	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192294
20	NC_020532	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192295
21	NC_020532	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470192297
22	NC_020532	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192300
23	NC_020532	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470192301
24	NC_020532	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192303
25	NC_020532	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020532	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020532	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470192305
28	NC_020532	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020532	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020532	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470192311
31	NC_020532	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470192311
32	NC_020532	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470192314
33	NC_020532	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470192315
34	NC_020532	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470192315
35	NC_020532	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470192316
36	NC_020532	TTGTGA	2	12	59572	59583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470192318
37	NC_020532	TTTATA	2	12	59912	59923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192318
38	NC_020532	TTTATC	2	12	60214	60225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470192319
39	NC_020532	ACAAAT	2	12	63547	63558	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470192321
40	NC_020532	AATTAA	2	12	63638	63649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
41	NC_020532	ATTTAT	2	12	66057	66068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020532	TTAATG	2	12	66581	66592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192322
43	NC_020532	AAGTCA	2	12	67786	67797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470192323
44	NC_020532	AAAAAG	2	12	67900	67911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470192323
45	NC_020532	GAAAAA	2	12	68213	68224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470192323
46	NC_020532	AATTAT	2	12	70452	70463	50 %	50 %	0 %	0 %	470192325
47	NC_020532	ACCCTT	2	12	72291	72302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470192326
48	NC_020532	TTTAGC	2	12	74200	74211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470192327
49	NC_020532	AAATAA	2	12	74251	74262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470192327
50	NC_020532	GTTAGA	2	12	76374	76385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192328
51	NC_020532	AAAAGA	2	12	76428	76439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470192328
52	NC_020532	GCTAAA	2	12	79216	79227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470192330
53	NC_020532	AACAAA	2	12	79637	79648	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020532	TAAAGA	2	12	83364	83375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470192335
55	NC_020532	AACCAC	2	12	87236	87247	50 %	0 %	0 %	50 %	470192337
56	NC_020532	AATATA	2	12	88938	88949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020532	AACCGA	2	12	90547	90558	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470192339
58	NC_020532	ATAGAT	2	12	95447	95458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192342
59	NC_020532	TATCAT	2	12	96214	96225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470192343
60	NC_020532	TTTATT	2	12	96622	96633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470192344
61	NC_020532	TATTTG	2	12	96708	96719	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470192344
62	NC_020532	TAAATA	2	12	98141	98152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192344
63	NC_020532	TTTTTC	2	12	99835	99846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470192345
64	NC_020532	TTAAAT	2	12	99930	99941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020532	TAACAA	2	12	101287	101298	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020532	TAAGCC	2	12	101696	101707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192347
67	NC_020532	ATCGCA	2	12	102911	102922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192348
68	NC_020532	TTTGAA	2	12	103942	103953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192349
69	NC_020532	CAATGG	2	12	112900	112911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470192355
70	NC_020532	TGAAGA	2	12	113734	113745	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470192356
71	NC_020532	TTTCAT	2	12	114415	114426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470192357
72	NC_020532	TGTATA	2	12	118635	118646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192361
73	NC_020532	TCGAAA	2	12	120136	120147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470192363
74	NC_020532	CTATTG	2	12	122722	122733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470192365
75	NC_020532	CATATG	2	12	123925	123936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192366
76	NC_020532	AATGTA	2	12	124826	124837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020532	CTGTAA	2	12	126647	126658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020532	GGTATG	2	12	126968	126979	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470192369
79	NC_020532	CAGATT	2	12	129566	129577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192371
80	NC_020532	AGATAT	2	12	136944	136955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192378
81	NC_020532	GTTTTT	2	12	137853	137864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020532	ATGCCT	2	12	138083	138094	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470192379
83	NC_020532	TGAAAG	2	12	138723	138734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470192379
84	NC_020532	GATATG	2	12	146223	146234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192385
85	NC_020532	ATTTGA	2	12	150129	150140	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192388
86	NC_020532	GATTTT	2	12	154640	154651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470192393
87	NC_020532	ACAAAG	2	12	159160	159171	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470192397
88	NC_020532	TGTAAT	2	12	160184	160195	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020532	AAAGAT	2	12	161173	161184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470192398
90	NC_020532	ATTAAT	2	12	163079	163090	50 %	50 %	0 %	0 %	470192399
91	NC_020532	CAATAT	2	12	163645	163656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470192399
92	NC_020532	TCCCAC	2	12	164396	164407	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020532	TTGGTA	2	12	167730	167741	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470192403
94	NC_020532	GCGATT	2	12	167750	167761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470192403
95	NC_020532	AAATTT	2	12	167848	167859	50 %	50 %	0 %	0 %	470192403
96	NC_020532	ACCTGC	2	12	170751	170762	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470192405
97	NC_020532	AAGATA	2	12	170897	170908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470192405
98	NC_020532	CGTTAA	2	12	173831	173842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192407
99	NC_020532	CTATTA	2	12	175682	175693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470192407
100	NC_020532	TATGAT	2	12	177216	177227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192407
101	NC_020532	TTGAAA	2	12	177668	177679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192407
102	NC_020532	AACATT	2	12	180108	180119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470192407
103	NC_020532	AGCAAC	2	12	183597	183608	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470192411
104	NC_020532	TGTTTG	2	12	183645	183656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192411
105	NC_020532	CACCTT	2	12	185649	185660	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470192413
106	NC_020532	ACCTTT	2	12	186154	186165	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470192413
107	NC_020532	TTTATA	2	12	186250	186261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020532	ATTAAT	2	12	186273	186284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020532	GTAAAT	2	12	189893	189904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192416
110	NC_020532	ATTTTA	2	12	191488	191499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192417
111	NC_020532	TATCTT	2	12	196102	196113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470192420
112	NC_020532	ATTTGG	2	12	197115	197126	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470192421
113	NC_020532	GAGTTT	2	12	200458	200469	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470192422
114	NC_020532	TATACA	2	12	204459	204470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470192426
115	NC_020532	TTATTT	2	12	206491	206502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470192427
116	NC_020532	ATTTAT	2	12	207070	207081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
117	NC_020532	TTTTTA	2	12	207101	207112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020532	CCCTGA	2	12	209828	209839	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470192430
119	NC_020532	TCCTGA	2	12	210647	210658	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470192430
120	NC_020532	TCAATT	2	12	212798	212809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470192432
121	NC_020532	AATATG	2	12	214098	214109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192433
122	NC_020532	GATTTT	2	12	217254	217265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020532	AAAAAT	2	12	217605	217616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470192435
124	NC_020532	AGGACA	2	12	219465	219476	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470192437
125	NC_020532	ACATTT	2	12	219801	219812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470192437
126	NC_020532	TTCTTG	2	12	224730	224741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470192441
127	NC_020532	GGACGT	2	12	235232	235243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470192450
128	NC_020532	ATATGA	2	12	237969	237980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020532	GGAATA	2	12	252830	252841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020532	TGGTAT	2	12	264410	264421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020532	TATAGA	2	12	267764	267775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192469
132	NC_020532	ATATAG	2	12	274057	274068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020532	ACGATG	2	12	274393	274404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470192474
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135	NC_020532	ATAATT	2	12	280323	280334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020532	AGAATC	2	12	281951	281962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470192479
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140	NC_020532	GACATT	2	12	288046	288057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192485
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147	NC_020532	TCTTCA	2	12	300941	300952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470192496
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151	NC_020532	TAATTA	2	12	306791	306802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020532	ACAAGA	2	12	307631	307642	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470192499
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165	NC_020532	AATGAC	2	12	346910	346921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470192528
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227	NC_020532	AAGTGA	2	12	463108	463119	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470192619
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232	NC_020532	AAAATA	2	12	473490	473501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_020532	GTTGGT	2	12	474844	474855	0 %	50 %	50 %	0 %	470192625
234	NC_020532	GCTATT	2	12	474916	474927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470192625
235	NC_020532	GATCAT	2	12	476512	476523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192626
236	NC_020532	AATTTA	2	12	477419	477430	50 %	50 %	0 %	0 %	470192627
237	NC_020532	CAAGAA	2	12	480548	480559	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
238	NC_020532	AAAATG	2	12	490281	490292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
239	NC_020532	CAAGAT	2	12	490308	490319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_020532	AGTTGA	2	12	490547	490558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_020532	TAAAAA	2	12	491495	491506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470192633
242	NC_020532	TTATAA	2	12	492942	492953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_020532	TTTATA	2	12	493859	493870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192635
244	NC_020532	AACCTA	2	12	496827	496838	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470192637
245	NC_020532	ATTGGT	2	12	497552	497563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470192638
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247	NC_020532	AAATTT	2	12	499701	499712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_020532	GCAAGA	2	12	504477	504488	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470192643
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270	NC_020532	CATTTA	2	12	552412	552423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
271	NC_020532	GCTGAA	2	12	553101	553112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470192674
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274	NC_020532	TTATAA	2	12	554827	554838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020532	GTTATA	2	12	555498	555509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_020532	ACGACT	2	12	564636	564647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192680
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338	NC_020532	CCAAAC	2	12	596034	596045	50 %	0 %	0 %	50 %	470192699
339	NC_020532	TTTTGA	2	12	601821	601832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470192705
340	NC_020532	TATATT	2	12	603978	603989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192706
341	NC_020532	ATTGCG	2	12	604694	604705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
342	NC_020532	TATTTA	2	12	605935	605946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192707
343	NC_020532	AATGAT	2	12	608612	608623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
344	NC_020532	TAGATG	2	12	608685	608696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
345	NC_020532	CATGAC	2	12	610635	610646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
346	NC_020532	GCAATT	2	12	612474	612485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192712
347	NC_020532	GAAAAA	2	12	613035	613046	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470192712
348	NC_020532	CTTGAT	2	12	616071	616082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470192715
349	NC_020532	TTGATA	2	12	617283	617294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192716
350	NC_020532	TAAAAT	2	12	624005	624016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
351	NC_020532	AAAATA	2	12	626033	626044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470192722
352	NC_020532	ATATTT	2	12	627539	627550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192724
353	NC_020532	TTATTT	2	12	630123	630134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_020532	TTTAAT	2	12	632124	632135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192729
355	NC_020532	GAAAAA	2	12	634448	634459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_020532	GATTCA	2	12	829518	829529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192880
472	NC_020532	TCAGAC	2	12	829539	829550	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192880
473	NC_020532	TCAGAT	2	12	829557	829568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192880
474	NC_020532	GATTCA	2	12	829572	829583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192880
475	NC_020532	GACTCA	2	12	829626	829637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192880
476	NC_020532	GATTCA	2	12	829716	829727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192880
477	NC_020532	GACTCA	2	12	829752	829763	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192880
478	NC_020532	GATTCA	2	12	829770	829781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192880
479	NC_020532	GACTCA	2	12	829788	829799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192880
480	NC_020532	TATCAA	2	12	832122	832133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
481	NC_020532	AGTACT	2	12	833660	833671	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192883
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485	NC_020532	GCTCAA	2	12	839236	839247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192886
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488	NC_020532	TAAAAA	2	12	845022	845033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_020532	ATGTTA	2	12	846438	846449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192892
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