MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 33620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020532	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192281
2	NC_020532	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192281
3	NC_020532	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192281
4	NC_020532	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192281
5	NC_020532	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
6	NC_020532	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192281
7	NC_020532	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192281
8	NC_020532	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192281
9	NC_020532	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192281
10	NC_020532	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192281
11	NC_020532	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192281
12	NC_020532	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192281
13	NC_020532	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192281
14	NC_020532	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192281
15	NC_020532	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192281
16	NC_020532	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
17	NC_020532	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192281
18	NC_020532	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
19	NC_020532	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192281
20	NC_020532	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192281
21	NC_020532	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
22	NC_020532	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
23	NC_020532	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192281
24	NC_020532	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192281
25	NC_020532	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192281
26	NC_020532	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
27	NC_020532	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192281
28	NC_020532	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
29	NC_020532	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192281
30	NC_020532	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192282
31	NC_020532	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192282
32	NC_020532	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192282
33	NC_020532	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192282
34	NC_020532	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192282
35	NC_020532	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192282
36	NC_020532	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192282
37	NC_020532	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192282
38	NC_020532	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192282
39	NC_020532	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192282
40	NC_020532	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192282
41	NC_020532	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192282
42	NC_020532	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192282
43	NC_020532	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192282
44	NC_020532	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192282
45	NC_020532	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192282
46	NC_020532	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192282
47	NC_020532	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192282
48	NC_020532	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192282
49	NC_020532	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192282
50	NC_020532	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192282
51	NC_020532	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192282
52	NC_020532	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192282
53	NC_020532	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192283
54	NC_020532	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192283
55	NC_020532	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192283
56	NC_020532	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470192283
57	NC_020532	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192283
58	NC_020532	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192283
59	NC_020532	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192283
60	NC_020532	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192283
61	NC_020532	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192283
62	NC_020532	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192283
63	NC_020532	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192283
64	NC_020532	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192283
65	NC_020532	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192283
66	NC_020532	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192283
67	NC_020532	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192283
68	NC_020532	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192283
69	NC_020532	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192284
70	NC_020532	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192284
71	NC_020532	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192284
72	NC_020532	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192284
73	NC_020532	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192284
74	NC_020532	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192284
75	NC_020532	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192284
76	NC_020532	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192284
77	NC_020532	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192284
78	NC_020532	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192284
79	NC_020532	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192284
80	NC_020532	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192284
81	NC_020532	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192284
82	NC_020532	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192284
83	NC_020532	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192284
84	NC_020532	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192284
85	NC_020532	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192284
86	NC_020532	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192284
87	NC_020532	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192284
88	NC_020532	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192284
89	NC_020532	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192284
90	NC_020532	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192284
91	NC_020532	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192284
92	NC_020532	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192284
93	NC_020532	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192284
94	NC_020532	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192284
95	NC_020532	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192284
96	NC_020532	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192284
97	NC_020532	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192285
98	NC_020532	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192285
99	NC_020532	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192285
100	NC_020532	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192285
101	NC_020532	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192285
102	NC_020532	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192285
103	NC_020532	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192285
104	NC_020532	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192285
105	NC_020532	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192285
106	NC_020532	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192285
107	NC_020532	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192285
108	NC_020532	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192285
109	NC_020532	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192285
110	NC_020532	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192285
111	NC_020532	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192285
112	NC_020532	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192285
113	NC_020532	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192285
114	NC_020532	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192285
115	NC_020532	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192285
116	NC_020532	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192285
117	NC_020532	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192285
118	NC_020532	TAC	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192285
119	NC_020532	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192285
120	NC_020532	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192285
121	NC_020532	AGA	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192285
122	NC_020532	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192285
123	NC_020532	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192285
124	NC_020532	GTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192285
125	NC_020532	GTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192285
126	NC_020532	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192285
127	NC_020532	ATG	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192285
128	NC_020532	CTT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192285
129	NC_020532	GTG	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192285
130	NC_020532	AGA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192285
131	NC_020532	TGA	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192285
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255	NC_020532	AGA	2	6	17854	17859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192291
256	NC_020532	TCA	2	6	17895	17900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192291
257	NC_020532	TAT	2	6	18021	18026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192291
258	NC_020532	ATT	2	6	18035	18040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192291
259	NC_020532	TAT	2	6	18054	18059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192291
260	NC_020532	ACT	2	6	18247	18252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192291
261	NC_020532	AAT	2	6	18296	18301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192291
262	NC_020532	AAT	2	6	18324	18329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192292
263	NC_020532	TCA	2	6	18371	18376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192292
264	NC_020532	ATC	2	6	18379	18384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192292
265	NC_020532	TGA	2	6	18461	18466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192292
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268	NC_020532	ATA	2	6	18554	18559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192292
269	NC_020532	ATT	2	6	18858	18863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192292
270	NC_020532	TTA	2	6	18941	18946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192292
271	NC_020532	AGA	2	6	19038	19043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192292
272	NC_020532	GCA	2	6	19384	19389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192292
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274	NC_020532	AAT	2	6	19417	19422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192292
275	NC_020532	ACG	2	6	19470	19475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192292
276	NC_020532	TGA	2	6	19478	19483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192292
277	NC_020532	GAT	2	6	19531	19536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192292
278	NC_020532	ATG	2	6	19546	19551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192292
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280	NC_020532	GTT	2	6	19639	19644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192292
281	NC_020532	ATC	2	6	19649	19654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192292
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284	NC_020532	AAC	2	6	19763	19768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192292
285	NC_020532	TAT	2	6	19806	19811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192292
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287	NC_020532	ATC	2	6	20021	20026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192292
288	NC_020532	AGC	2	6	20043	20048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192292
289	NC_020532	CAT	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192292
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292	NC_020532	TGC	2	6	20199	20204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192292
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295	NC_020532	TAC	2	6	20865	20870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192293
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498	NC_020532	AGA	2	6	37806	37811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192304
499	NC_020532	AAG	2	6	37955	37960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192304
500	NC_020532	TCA	2	6	38696	38701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192305

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