MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI2T2 complete sequence

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020531	TTAAAC	2	12	428	439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020531	TTGAAG	2	12	4649	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455778
3	NC_020531	CAATTA	2	12	4814	4825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472455778
4	NC_020531	ATTATA	2	12	5957	5968	50 %	50 %	0 %	0 %	472455779
5	NC_020531	ACAGGT	2	12	6529	6540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472455779
6	NC_020531	AAATTT	2	12	7380	7391	50 %	50 %	0 %	0 %	472455780
7	NC_020531	AAAAGA	2	12	8288	8299	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	472455781
8	NC_020531	TTTATT	2	12	10877	10888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472455783
9	NC_020531	GGAATT	2	12	11340	11351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455783
10	NC_020531	AAAATC	2	12	12270	12281	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	472455784
11	NC_020531	TAATGA	2	12	12526	12537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472455784
12	NC_020531	ATCATT	2	12	13575	13586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472455785
13	NC_020531	TAATTT	2	12	17149	17160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020531	TAAAAT	2	12	21173	21184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020531	TTAAAC	2	12	24187	24198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472455791

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.