MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI2T2 complete sequence

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020531	TAATT	2	10	4360	4369	40 %	60 %	0 %	0 %	472455778
2	NC_020531	CATAA	2	10	5185	5194	60 %	20 %	0 %	20 %	472455779
3	NC_020531	GATAC	2	10	5389	5398	40 %	20 %	20 %	20 %	472455779
4	NC_020531	ACTCA	2	10	6316	6325	40 %	20 %	0 %	40 %	472455779
5	NC_020531	AATTA	2	10	6329	6338	60 %	40 %	0 %	0 %	472455779
6	NC_020531	AATAT	2	10	6746	6755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020531	CTTTA	2	10	8491	8500	20 %	60 %	0 %	20 %	472455781
8	NC_020531	TACTA	2	10	9200	9209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020531	ATTTG	2	10	9914	9923	20 %	60 %	20 %	0 %	472455782
10	NC_020531	AAAAG	2	10	10907	10916	80 %	0 %	20 %	0 %	472455783
11	NC_020531	TTATT	2	10	12238	12247	20 %	80 %	0 %	0 %	472455784
12	NC_020531	ATTCA	2	10	13665	13674	40 %	40 %	0 %	20 %	472455785
13	NC_020531	TATGA	2	10	14660	14669	40 %	40 %	20 %	0 %	472455786
14	NC_020531	AATAT	2	10	15066	15075	60 %	40 %	0 %	0 %	472455786
15	NC_020531	TATTT	2	10	15522	15531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020531	TGTGA	2	10	17361	17370	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020531	AAAAT	2	10	17802	17811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020531	TCTAA	2	10	17848	17857	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020531	CTTGA	2	10	28485	28494	20 %	40 %	20 %	20 %	472455795
20	NC_020531	ATAAA	2	10	29154	29163	80 %	20 %	0 %	0 %	472455796
21	NC_020531	CTTTT	2	10	29400	29409	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020531	TCACA	2	10	29696	29705	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020531	CTTTA	2	10	30278	30287	20 %	60 %	0 %	20 %	472455797

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.