MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI2T2 complete sequence

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020531	ACAT	2	8	273	280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020531	AAGA	2	8	507	514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020531	CGTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020531	GTAA	2	8	3290	3297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020531	TCTT	2	8	3423	3430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020531	TTCA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020531	ATTT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020531	GCAA	2	8	3501	3508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020531	TGAA	2	8	3514	3521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020531	AAGT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020531	AACG	2	8	3562	3569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020531	TAAA	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020531	AAAT	2	8	3874	3881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020531	TATT	2	8	3977	3984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020531	ATTT	2	8	6893	6900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020531	AAGA	2	8	7935	7942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020531	TATT	2	8	8023	8030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020531	ATTG	2	8	8658	8665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020531	TAAC	2	8	8955	8962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020531	AATA	2	8	9348	9355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020531	CATT	2	8	9430	9437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020531	AACG	2	8	9507	9514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020531	AAAC	2	8	12665	12672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020531	TAAT	2	8	12918	12925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020531	TTTA	2	8	15937	15944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020531	TAGA	2	8	16015	16022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020531	TATT	2	8	16279	16286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020531	GTAT	2	8	16702	16709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020531	TTAG	2	8	16861	16868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020531	TGAA	2	8	17005	17012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020531	TTAC	2	8	17127	17134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020531	TTTA	2	8	17267	17274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020531	CTAG	2	8	18060	18067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020531	TAAA	2	8	18431	18438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020531	ATAA	2	8	18473	18480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020531	AAAT	2	8	18649	18656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020531	CAAA	2	8	18671	18678	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020531	TACA	2	8	18965	18972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020531	TCGG	2	8	19832	19839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020531	GTGG	2	8	20882	20889	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020531	ATTT	2	8	20902	20909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020531	ATTT	2	8	20917	20924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020531	AGGT	2	8	21208	21215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020531	TGTA	2	8	21534	21541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020531	TATT	2	8	23197	23204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020531	TATT	2	8	25145	25152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020531	TAGA	2	8	25178	25185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020531	CATC	2	8	28007	28014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020531	TACA	2	8	28060	28067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020531	ATTT	2	8	29329	29336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020531	TTAT	2	8	29848	29855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.