MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI2T2 complete sequence

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020531	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020531	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020531	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020531	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020531	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020531	TGA	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020531	CAT	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020531	GCT	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020531	TTC	2	6	828	833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020531	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
11	NC_020531	TAG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
12	NC_020531	ATT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455777
13	NC_020531	ATC	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
14	NC_020531	GCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455777
15	NC_020531	CAT	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
16	NC_020531	TGA	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
17	NC_020531	AAT	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455777
18	NC_020531	TTC	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
19	NC_020531	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455777
20	NC_020531	TGT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455777
21	NC_020531	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
22	NC_020531	TTC	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
23	NC_020531	CCA	2	6	2015	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455777
24	NC_020531	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455777
25	NC_020531	AGT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
26	NC_020531	TCA	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
27	NC_020531	AGC	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455777
28	NC_020531	ATA	2	6	2357	2362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455777
29	NC_020531	ATT	2	6	2393	2398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455777
30	NC_020531	CTT	2	6	2424	2429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
31	NC_020531	ACA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455777
32	NC_020531	ATG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
33	NC_020531	TCA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
34	NC_020531	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
35	NC_020531	TAG	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
36	NC_020531	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
37	NC_020531	TTC	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
38	NC_020531	TCT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
39	NC_020531	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020531	ATC	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020531	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020531	CTT	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020531	ACC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020531	ATG	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020531	TTC	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020531	ATC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020531	TAT	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020531	TCA	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020531	ATA	2	6	3597	3602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020531	AAT	2	6	3618	3623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020531	ATT	2	6	3722	3727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020531	TGA	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020531	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020531	ATA	2	6	3889	3894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020531	ATA	2	6	3938	3943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020531	ATA	2	6	3950	3955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020531	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455778
58	NC_020531	TAT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455778
59	NC_020531	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455778
60	NC_020531	GTT	2	6	4421	4426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455778
61	NC_020531	TAT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455778
62	NC_020531	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455778
63	NC_020531	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455778
64	NC_020531	AAT	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455778
65	NC_020531	TAT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
66	NC_020531	AAG	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
67	NC_020531	TTA	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
68	NC_020531	TTA	2	6	5005	5010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
69	NC_020531	CTT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455779
70	NC_020531	TAA	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
71	NC_020531	AAT	2	6	5140	5145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
72	NC_020531	ACC	2	6	5197	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455779
73	NC_020531	ATA	2	6	5258	5263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
74	NC_020531	TTA	2	6	5291	5296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
75	NC_020531	TTA	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
76	NC_020531	TCT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455779
77	NC_020531	TAT	3	9	5613	5621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
78	NC_020531	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
79	NC_020531	TAT	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
80	NC_020531	AGA	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
81	NC_020531	AAG	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
82	NC_020531	GAA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
83	NC_020531	ATG	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455779
84	NC_020531	TAA	2	6	6342	6347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
85	NC_020531	ATG	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455779
86	NC_020531	TCT	2	6	6478	6483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455779
87	NC_020531	ATT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
88	NC_020531	TAA	2	6	6558	6563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
89	NC_020531	GGT	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472455779
90	NC_020531	TAT	2	6	6604	6609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
91	NC_020531	AAG	2	6	6810	6815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020531	TCA	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020531	AGA	2	6	6919	6924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020531	TAA	2	6	6958	6963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020531	GAA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020531	GAA	2	6	7037	7042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020531	ATA	2	6	7098	7103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020531	TTA	2	6	7127	7132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020531	TAA	2	6	7145	7150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020531	TTG	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455780
101	NC_020531	TAA	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455780
102	NC_020531	AGA	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455780
103	NC_020531	GCA	2	6	7672	7677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455780
104	NC_020531	TTC	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455780
105	NC_020531	GTC	2	6	7760	7765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455780
106	NC_020531	AAT	2	6	7894	7899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455780
107	NC_020531	TTG	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020531	ATC	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455781
109	NC_020531	AAG	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455781
110	NC_020531	ATG	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455781
111	NC_020531	ATT	2	6	8265	8270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455781
112	NC_020531	ATT	2	6	8281	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455781
113	NC_020531	ATG	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455781
114	NC_020531	GTG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472455781
115	NC_020531	AGA	2	6	8561	8566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455781
116	NC_020531	AAG	2	6	8593	8598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455781
117	NC_020531	ATT	2	6	8712	8717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020531	TAA	2	6	8730	8735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020531	TAA	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020531	TAT	3	9	8917	8925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020531	ACA	2	6	8998	9003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020531	ATT	2	6	9416	9421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020531	GTA	3	9	9478	9486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020531	ATA	2	6	9525	9530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020531	ATT	2	6	9560	9565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455782
126	NC_020531	TGC	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455782
127	NC_020531	CAT	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455782
128	NC_020531	CCT	2	6	9728	9733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472455782
129	NC_020531	ATT	2	6	9829	9834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455782
130	NC_020531	ATA	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455782
131	NC_020531	GTT	2	6	9862	9867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455782
132	NC_020531	TTC	2	6	9954	9959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455782
133	NC_020531	ATA	2	6	10005	10010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455782
134	NC_020531	TAC	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455782
135	NC_020531	AGT	3	9	10053	10061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455782
136	NC_020531	TCA	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455782
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268	NC_020531	TCA	2	6	19033	19038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_020531	ATA	2	6	19051	19056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455787
270	NC_020531	CTT	2	6	19104	19109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455787
271	NC_020531	TCA	2	6	19127	19132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455787
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279	NC_020531	ATT	2	6	19991	19996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455788
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292	NC_020531	TAT	2	6	20757	20762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020531	GAA	3	9	20811	20819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_020531	CTT	2	6	28858	28863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455796
398	NC_020531	ATC	2	6	28868	28873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455796
399	NC_020531	AAC	2	6	29271	29276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455796
400	NC_020531	AAT	2	6	29361	29366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_020531	TAA	2	6	29418	29423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_020531	ACA	2	6	29534	29539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_020531	TAA	2	6	29582	29587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_020531	CTG	2	6	29600	29605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_020531	ATT	2	6	29796	29801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_020531	AAT	2	6	29815	29820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_020531	AAG	2	6	29915	29920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.