MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	TTAAAC	2	12	428	439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020530	TTGAAG	2	12	4649	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455756
3	NC_020530	CAATTA	2	12	4814	4825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472455756
4	NC_020530	ATTATA	2	12	5957	5968	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
5	NC_020530	ACAGGT	2	12	6529	6540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472455757
6	NC_020530	AAATTT	2	12	7380	7391	50 %	50 %	0 %	0 %	472455758
7	NC_020530	AAAAGA	2	12	8288	8299	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	472455759
8	NC_020530	TTTATT	2	12	10877	10888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472455761
9	NC_020530	GGAATT	2	12	11340	11351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455761
10	NC_020530	AAAATC	2	12	12270	12281	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	472455762
11	NC_020530	TAATGA	2	12	12526	12537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472455762
12	NC_020530	ATCATT	2	12	13575	13586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472455763
13	NC_020530	TAATTT	2	12	17149	17160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020530	TAAAAT	2	12	21173	21184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020530	TTAAAC	2	12	24187	24198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472455769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.