MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	ACAT	2	8	273	280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020530	AAGA	2	8	507	514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020530	CTTA	2	8	1096	1103	25 %	50 %	0 %	25 %	472455755
4	NC_020530	AGTA	2	8	1584	1591	50 %	25 %	25 %	0 %	472455755
5	NC_020530	TAGA	2	8	1867	1874	50 %	25 %	25 %	0 %	472455755
6	NC_020530	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	472455755
7	NC_020530	CGTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020530	GTAA	2	8	3290	3297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020530	TCTT	2	8	3423	3430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020530	TTCA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020530	ATTT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020530	GCAA	2	8	3501	3508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020530	TGAA	2	8	3514	3521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020530	AAGT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020530	AACG	2	8	3562	3569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020530	TAAA	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020530	AAAT	2	8	3874	3881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020530	TATT	2	8	3977	3984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020530	TTAA	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	472455756
20	NC_020530	TTTA	2	8	4296	4303	25 %	75 %	0 %	0 %	472455756
21	NC_020530	AAGT	2	8	5163	5170	50 %	25 %	25 %	0 %	472455757
22	NC_020530	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	472455757
23	NC_020530	CATT	2	8	5794	5801	25 %	50 %	0 %	25 %	472455757
24	NC_020530	TTAA	2	8	5833	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
25	NC_020530	AATT	2	8	5873	5880	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
26	NC_020530	AAAG	2	8	6085	6092	75 %	0 %	25 %	0 %	472455757
27	NC_020530	ATTT	2	8	6127	6134	25 %	75 %	0 %	0 %	472455757
28	NC_020530	TGGA	2	8	6373	6380	25 %	25 %	50 %	0 %	472455757
29	NC_020530	ATTT	2	8	6893	6900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020530	TAGA	2	8	7529	7536	50 %	25 %	25 %	0 %	472455758
31	NC_020530	TAAA	2	8	7775	7782	75 %	25 %	0 %	0 %	472455758
32	NC_020530	ATAA	2	8	7913	7920	75 %	25 %	0 %	0 %	472455758
33	NC_020530	AAGA	2	8	7935	7942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020530	TATT	2	8	8023	8030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020530	ATGA	2	8	8042	8049	50 %	25 %	25 %	0 %	472455759
36	NC_020530	TTAT	2	8	8533	8540	25 %	75 %	0 %	0 %	472455759
37	NC_020530	ATTG	2	8	8658	8665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020530	TAAC	2	8	8955	8962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020530	AATA	2	8	9348	9355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020530	CATT	2	8	9430	9437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020530	AACG	2	8	9507	9514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020530	ATAA	2	8	10081	10088	75 %	25 %	0 %	0 %	472455760
43	NC_020530	GTTT	2	8	10384	10391	0 %	75 %	25 %	0 %	472455761
44	NC_020530	ATTA	2	8	10415	10422	50 %	50 %	0 %	0 %	472455761
45	NC_020530	AAAG	2	8	10722	10729	75 %	0 %	25 %	0 %	472455761
46	NC_020530	TAAT	2	8	10837	10844	50 %	50 %	0 %	0 %	472455761
47	NC_020530	TATG	2	8	11528	11535	25 %	50 %	25 %	0 %	472455761
48	NC_020530	AATT	2	8	12169	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	472455762
49	NC_020530	AAAC	2	8	12665	12672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020530	TAAT	2	8	12918	12925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020530	CAAA	2	8	12938	12945	75 %	0 %	0 %	25 %	472455763
52	NC_020530	TCTT	2	8	13221	13228	0 %	75 %	0 %	25 %	472455763
53	NC_020530	TTTA	2	8	13302	13309	25 %	75 %	0 %	0 %	472455763
54	NC_020530	TCTT	2	8	13500	13507	0 %	75 %	0 %	25 %	472455763
55	NC_020530	CTTT	2	8	13537	13544	0 %	75 %	0 %	25 %	472455763
56	NC_020530	TAAT	2	8	13591	13598	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
57	NC_020530	GTTT	2	8	13651	13658	0 %	75 %	25 %	0 %	472455763
58	NC_020530	TATG	2	8	14260	14267	25 %	50 %	25 %	0 %	472455764
59	NC_020530	ATCC	2	8	14293	14300	25 %	25 %	0 %	50 %	472455764
60	NC_020530	TAGA	2	8	14313	14320	50 %	25 %	25 %	0 %	472455764
61	NC_020530	TATT	2	8	14471	14478	25 %	75 %	0 %	0 %	472455764
62	NC_020530	TTTA	2	8	15937	15944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020530	TAGA	2	8	16015	16022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020530	TATT	2	8	16279	16286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020530	GTAT	2	8	16702	16709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020530	TTAG	2	8	16861	16868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020530	TGAA	2	8	17005	17012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020530	TTAC	2	8	17127	17134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020530	TTTA	2	8	17267	17274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020530	CTAG	2	8	18060	18067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020530	TAAA	2	8	18431	18438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020530	ATAA	2	8	18473	18480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020530	AAAT	2	8	18649	18656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020530	CAAA	2	8	18671	18678	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020530	TACA	2	8	18965	18972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020530	ATTA	2	8	19138	19145	50 %	50 %	0 %	0 %	472455765
77	NC_020530	TTAG	2	8	19613	19620	25 %	50 %	25 %	0 %	472455765
78	NC_020530	CAAC	2	8	19684	19691	50 %	0 %	0 %	50 %	472455765
79	NC_020530	TCGG	2	8	19832	19839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020530	AAGC	2	8	20185	20192	50 %	0 %	25 %	25 %	472455766
81	NC_020530	GCTA	2	8	20649	20656	25 %	25 %	25 %	25 %	472455766
82	NC_020530	GTGG	2	8	20882	20889	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020530	ATTT	2	8	20902	20909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020530	ATTT	2	8	20917	20924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020530	AGGT	2	8	21208	21215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020530	TGTA	2	8	21534	21541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020530	TAAA	2	8	21807	21814	75 %	25 %	0 %	0 %	472455767
88	NC_020530	AAAT	2	8	21999	22006	75 %	25 %	0 %	0 %	472455767
89	NC_020530	AAGA	2	8	22800	22807	75 %	0 %	25 %	0 %	472455768
90	NC_020530	TATT	2	8	23197	23204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020530	ACAT	2	8	24032	24039	50 %	25 %	0 %	25 %	472455769
92	NC_020530	AAGA	2	8	24266	24273	75 %	0 %	25 %	0 %	472455769
93	NC_020530	AGTA	2	8	24607	24614	50 %	25 %	25 %	0 %	472455770
94	NC_020530	TATT	2	8	25145	25152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020530	TAGA	2	8	25178	25185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020530	CCGA	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	472455771
97	NC_020530	CGGA	2	8	25513	25520	25 %	0 %	50 %	25 %	472455771
98	NC_020530	ACGG	2	8	25808	25815	25 %	0 %	50 %	25 %	472455771
99	NC_020530	TCAC	2	8	26146	26153	25 %	25 %	0 %	50 %	472455772
100	NC_020530	CGAT	2	8	26321	26328	25 %	25 %	25 %	25 %	472455772
101	NC_020530	CGCT	2	8	26770	26777	0 %	25 %	25 %	50 %	472455772
102	NC_020530	TCAT	2	8	26920	26927	25 %	50 %	0 %	25 %	472455772
103	NC_020530	TGAC	2	8	27100	27107	25 %	25 %	25 %	25 %	472455772
104	NC_020530	GGCT	2	8	27403	27410	0 %	25 %	50 %	25 %	472455772
105	NC_020530	CATC	2	8	28007	28014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020530	TACA	2	8	28060	28067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020530	ATAG	2	8	28464	28471	50 %	25 %	25 %	0 %	472455773
108	NC_020530	CTTT	2	8	29031	29038	0 %	75 %	0 %	25 %	472455774
109	NC_020530	AACT	2	8	29059	29066	50 %	25 %	0 %	25 %	472455774
110	NC_020530	TAGG	2	8	29182	29189	25 %	25 %	50 %	0 %	472455774
111	NC_020530	ATTC	2	8	29224	29231	25 %	50 %	0 %	25 %	472455774
112	NC_020530	ATTT	2	8	29329	29336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020530	TTAT	2	8	29848	29855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020530	TACC	2	8	30325	30332	25 %	25 %	0 %	50 %	472455775
115	NC_020530	TTAC	2	8	30504	30511	25 %	50 %	0 %	25 %	472455775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.