MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020530	TA	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020530	AC	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020530	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020530	TA	3	6	3836	3841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020530	TA	3	6	6852	6857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020530	AT	3	6	7159	7164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020530	CT	3	6	7208	7213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020530	TA	5	10	7223	7232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020530	TA	3	6	7323	7328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020530	AC	3	6	7957	7962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020530	TC	3	6	8682	8687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020530	TA	3	6	8772	8777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020530	AT	3	6	8808	8813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020530	AG	3	6	9448	9453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020530	CT	3	6	9466	9471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020530	AT	5	10	9549	9558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020530	AT	3	6	11858	11863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020530	TA	3	6	12625	12630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020530	TA	3	6	12880	12885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020530	TA	3	6	13914	13919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020530	TA	3	6	14021	14026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020530	AT	4	8	14046	14053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020530	AT	3	6	15646	15651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020530	AT	3	6	15967	15972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020530	TA	4	8	16236	16243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020530	AG	3	6	16987	16992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020530	TA	3	6	17253	17258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020530	TG	3	6	17512	17517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020530	TA	3	6	17581	17586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020530	AG	3	6	17655	17660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020530	TA	3	6	17725	17730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020530	GA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020530	TA	3	6	18130	18135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020530	AT	3	6	18655	18660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020530	TA	3	6	21436	21441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020530	TA	3	6	21504	21509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020530	GA	3	6	21734	21739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020530	TA	3	6	22267	22272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020530	GA	3	6	23077	23082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020530	AT	3	6	23117	23122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020530	TA	3	6	23292	23297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020530	TC	3	6	23367	23372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020530	AG	3	6	23392	23397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020530	CT	3	6	27706	27711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020530	TC	3	6	29505	29510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020530	AT	3	6	29616	29621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.