MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	AC	3	6	1890	1895	50 %	0 %	0 %	50 %	472455755
2	NC_020530	GC	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	472455755
3	NC_020530	AC	3	6	2301	2306	50 %	0 %	0 %	50 %	472455755
4	NC_020530	TC	3	6	5114	5119	0 %	50 %	0 %	50 %	472455757
5	NC_020530	AT	3	6	5481	5486	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
6	NC_020530	AT	3	6	5538	5543	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
7	NC_020530	AT	3	6	5783	5788	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
8	NC_020530	AG	3	6	8414	8419	50 %	0 %	50 %	0 %	472455759
9	NC_020530	TA	3	6	8476	8481	50 %	50 %	0 %	0 %	472455759
10	NC_020530	GA	3	6	9590	9595	50 %	0 %	50 %	0 %	472455760
11	NC_020530	TA	3	6	9756	9761	50 %	50 %	0 %	0 %	472455760
12	NC_020530	TA	3	6	9881	9886	50 %	50 %	0 %	0 %	472455760
13	NC_020530	AG	3	6	10443	10448	50 %	0 %	50 %	0 %	472455761
14	NC_020530	AT	3	6	10486	10491	50 %	50 %	0 %	0 %	472455761
15	NC_020530	CT	3	6	10493	10498	0 %	50 %	0 %	50 %	472455761
16	NC_020530	GA	3	6	12304	12309	50 %	0 %	50 %	0 %	472455762
17	NC_020530	CT	3	6	12997	13002	0 %	50 %	0 %	50 %	472455763
18	NC_020530	TC	3	6	13024	13029	0 %	50 %	0 %	50 %	472455763
19	NC_020530	AT	3	6	13360	13365	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
20	NC_020530	TA	3	6	13462	13467	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
21	NC_020530	AT	3	6	13619	13624	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
22	NC_020530	TA	3	6	14633	14638	50 %	50 %	0 %	0 %	472455764
23	NC_020530	TA	3	6	19447	19452	50 %	50 %	0 %	0 %	472455765
24	NC_020530	AT	3	6	20075	20080	50 %	50 %	0 %	0 %	472455766
25	NC_020530	GA	3	6	20091	20096	50 %	0 %	50 %	0 %	472455766
26	NC_020530	TA	3	6	20582	20587	50 %	50 %	0 %	0 %	472455766
27	NC_020530	AT	3	6	22491	22496	50 %	50 %	0 %	0 %	472455768
28	NC_020530	AT	3	6	23830	23835	50 %	50 %	0 %	0 %	472455769
29	NC_020530	TA	3	6	24337	24342	50 %	50 %	0 %	0 %	472455769
30	NC_020530	TA	3	6	24686	24691	50 %	50 %	0 %	0 %	472455770
31	NC_020530	GT	3	6	25586	25591	0 %	50 %	50 %	0 %	472455771
32	NC_020530	AT	3	6	26469	26474	50 %	50 %	0 %	0 %	472455772
33	NC_020530	TA	3	6	27078	27083	50 %	50 %	0 %	0 %	472455772
34	NC_020530	TA	3	6	29127	29132	50 %	50 %	0 %	0 %	472455774
35	NC_020530	TG	3	6	30046	30051	0 %	50 %	50 %	0 %	472455775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.