MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020530	C	6	6	845	850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020530	T	7	7	1254	1260	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
4	NC_020530	T	6	6	1461	1466	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
5	NC_020530	T	6	6	1897	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
6	NC_020530	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
7	NC_020530	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020530	A	6	6	3629	3634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020530	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020530	T	6	6	3829	3834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020530	T	6	6	4257	4262	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
12	NC_020530	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
13	NC_020530	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
14	NC_020530	T	6	6	4590	4595	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
15	NC_020530	T	8	8	4746	4753	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
16	NC_020530	T	6	6	5011	5016	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
17	NC_020530	A	7	7	5375	5381	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
18	NC_020530	A	8	8	5416	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
19	NC_020530	T	6	6	5770	5775	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
20	NC_020530	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
21	NC_020530	T	6	6	5904	5909	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
22	NC_020530	A	6	6	6457	6462	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
23	NC_020530	A	6	6	6668	6673	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
24	NC_020530	A	6	6	6761	6766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020530	A	6	6	6857	6862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020530	A	6	6	8745	8750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020530	T	6	6	8931	8936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020530	A	6	6	8990	8995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020530	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020530	A	7	7	9580	9586	100 %	0 %	0 %	0 %	472455760
31	NC_020530	T	6	6	9782	9787	0 %	100 %	0 %	0 %	472455760
32	NC_020530	T	6	6	10075	10080	0 %	100 %	0 %	0 %	472455760
33	NC_020530	A	6	6	10168	10173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020530	T	6	6	10223	10228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020530	A	7	7	10241	10247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020530	T	6	6	10314	10319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020530	A	8	8	10346	10353	100 %	0 %	0 %	0 %	472455761
38	NC_020530	A	7	7	10553	10559	100 %	0 %	0 %	0 %	472455761
39	NC_020530	T	6	6	11943	11948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020530	A	6	6	12253	12258	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
41	NC_020530	A	6	6	12260	12265	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
42	NC_020530	A	6	6	12363	12368	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
43	NC_020530	A	6	6	12584	12589	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
44	NC_020530	T	7	7	13506	13512	0 %	100 %	0 %	0 %	472455763
45	NC_020530	T	6	6	13608	13613	0 %	100 %	0 %	0 %	472455763
46	NC_020530	T	6	6	13756	13761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020530	T	6	6	14028	14033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020530	A	6	6	14385	14390	100 %	0 %	0 %	0 %	472455764
49	NC_020530	A	6	6	14402	14407	100 %	0 %	0 %	0 %	472455764
50	NC_020530	A	6	6	14730	14735	100 %	0 %	0 %	0 %	472455764
51	NC_020530	A	7	7	15166	15172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020530	A	6	6	15388	15393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020530	T	7	7	15592	15598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020530	T	7	7	15603	15609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020530	A	6	6	15612	15617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020530	A	6	6	15801	15806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020530	A	6	6	15827	15832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020530	A	7	7	15919	15925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020530	T	6	6	16113	16118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020530	T	6	6	16372	16377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020530	A	7	7	16468	16474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020530	T	6	6	16783	16788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020530	A	6	6	16804	16809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020530	A	6	6	16995	17000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020530	T	6	6	17408	17413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020530	A	6	6	17452	17457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020530	A	7	7	17819	17825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020530	A	6	6	18013	18018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020530	T	7	7	18333	18339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020530	A	7	7	18363	18369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020530	A	6	6	18373	18378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020530	A	6	6	18436	18441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020530	A	7	7	18446	18452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020530	A	6	6	18491	18496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020530	A	6	6	18508	18513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020530	T	6	6	18703	18708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020530	T	6	6	19000	19005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020530	A	6	6	19008	19013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020530	A	6	6	19019	19024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020530	T	7	7	19265	19271	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
81	NC_020530	A	6	6	19286	19291	100 %	0 %	0 %	0 %	472455765
82	NC_020530	T	7	7	19459	19465	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
83	NC_020530	T	6	6	19661	19666	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
84	NC_020530	T	6	6	19883	19888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020530	A	6	6	19968	19973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_020530	A	7	7	20824	20830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020530	A	6	6	20951	20956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020530	T	7	7	20984	20990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020530	A	6	6	21154	21159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020530	A	6	6	21167	21172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020530	T	6	6	21200	21205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95	NC_020530	T	7	7	21363	21369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020530	A	8	8	21428	21435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020530	A	7	7	21462	21468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020530	A	6	6	21575	21580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_020530	T	7	7	21744	21750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_020530	T	6	6	21760	21765	0 %	100 %	0 %	0 %	472455767
103	NC_020530	A	6	6	22138	22143	100 %	0 %	0 %	0 %	472455767
104	NC_020530	T	6	6	22237	22242	0 %	100 %	0 %	0 %	472455767
105	NC_020530	A	6	6	22285	22290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_020530	A	7	7	22788	22794	100 %	0 %	0 %	0 %	472455768
108	NC_020530	T	7	7	22979	22985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020530	T	6	6	22987	22992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020530	T	6	6	23211	23216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020530	A	6	6	23280	23285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020530	A	6	6	23524	23529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020530	A	6	6	23940	23945	100 %	0 %	0 %	0 %	472455769
114	NC_020530	T	7	7	24453	24459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020530	T	6	6	24864	24869	0 %	100 %	0 %	0 %	472455770
116	NC_020530	G	6	6	25640	25645	0 %	0 %	100 %	0 %	472455771
117	NC_020530	T	6	6	26520	26525	0 %	100 %	0 %	0 %	472455772
118	NC_020530	C	6	6	27258	27263	0 %	0 %	0 %	100 %	472455772
119	NC_020530	T	6	6	27736	27741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020530	A	8	8	28033	28040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020530	T	6	6	28104	28109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020530	T	6	6	28124	28129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020530	T	6	6	28235	28240	0 %	100 %	0 %	0 %	472455773
124	NC_020530	T	6	6	29306	29311	0 %	100 %	0 %	0 %	472455774
125	NC_020530	T	6	6	29471	29476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020530	T	6	6	29800	29805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020530	A	6	6	29840	29845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020530	T	6	6	29873	29878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020530	A	6	6	29952	29957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020530	T	7	7	30385	30391	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775
131	NC_020530	T	6	6	30545	30550	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775
132	NC_020530	T	7	7	30647	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.