MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	T	7	7	1254	1260	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
2	NC_020530	T	6	6	1461	1466	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
3	NC_020530	T	6	6	1897	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
4	NC_020530	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
5	NC_020530	T	6	6	4257	4262	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
6	NC_020530	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
7	NC_020530	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
8	NC_020530	T	6	6	4590	4595	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
9	NC_020530	T	8	8	4746	4753	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
10	NC_020530	T	6	6	5011	5016	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
11	NC_020530	A	7	7	5375	5381	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
12	NC_020530	A	8	8	5416	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
13	NC_020530	T	6	6	5770	5775	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
14	NC_020530	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
15	NC_020530	T	6	6	5904	5909	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
16	NC_020530	A	6	6	6457	6462	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
17	NC_020530	A	6	6	6668	6673	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
18	NC_020530	A	7	7	9580	9586	100 %	0 %	0 %	0 %	472455760
19	NC_020530	T	6	6	9782	9787	0 %	100 %	0 %	0 %	472455760
20	NC_020530	T	6	6	10075	10080	0 %	100 %	0 %	0 %	472455760
21	NC_020530	A	8	8	10346	10353	100 %	0 %	0 %	0 %	472455761
22	NC_020530	A	7	7	10553	10559	100 %	0 %	0 %	0 %	472455761
23	NC_020530	A	6	6	12253	12258	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
24	NC_020530	A	6	6	12260	12265	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
25	NC_020530	A	6	6	12363	12368	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
26	NC_020530	A	6	6	12584	12589	100 %	0 %	0 %	0 %	472455762
27	NC_020530	T	7	7	13506	13512	0 %	100 %	0 %	0 %	472455763
28	NC_020530	T	6	6	13608	13613	0 %	100 %	0 %	0 %	472455763
29	NC_020530	A	6	6	14385	14390	100 %	0 %	0 %	0 %	472455764
30	NC_020530	A	6	6	14402	14407	100 %	0 %	0 %	0 %	472455764
31	NC_020530	A	6	6	14730	14735	100 %	0 %	0 %	0 %	472455764
32	NC_020530	T	7	7	19265	19271	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
33	NC_020530	A	6	6	19286	19291	100 %	0 %	0 %	0 %	472455765
34	NC_020530	T	7	7	19459	19465	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
35	NC_020530	T	6	6	19661	19666	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
36	NC_020530	A	8	8	20176	20183	100 %	0 %	0 %	0 %	472455766
37	NC_020530	T	7	7	21752	21758	0 %	100 %	0 %	0 %	472455767
38	NC_020530	T	6	6	21760	21765	0 %	100 %	0 %	0 %	472455767
39	NC_020530	A	6	6	22138	22143	100 %	0 %	0 %	0 %	472455767
40	NC_020530	T	6	6	22237	22242	0 %	100 %	0 %	0 %	472455767
41	NC_020530	T	7	7	22341	22347	0 %	100 %	0 %	0 %	472455768
42	NC_020530	A	7	7	22788	22794	100 %	0 %	0 %	0 %	472455768
43	NC_020530	A	6	6	23940	23945	100 %	0 %	0 %	0 %	472455769
44	NC_020530	T	6	6	24864	24869	0 %	100 %	0 %	0 %	472455770
45	NC_020530	G	6	6	25640	25645	0 %	0 %	100 %	0 %	472455771
46	NC_020530	T	6	6	26520	26525	0 %	100 %	0 %	0 %	472455772
47	NC_020530	C	6	6	27258	27263	0 %	0 %	0 %	100 %	472455772
48	NC_020530	T	6	6	28235	28240	0 %	100 %	0 %	0 %	472455773
49	NC_020530	T	6	6	29306	29311	0 %	100 %	0 %	0 %	472455774
50	NC_020530	T	7	7	30385	30391	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775
51	NC_020530	T	6	6	30545	30550	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775
52	NC_020530	T	7	7	30647	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.