MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190317
2	NC_020529	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020529	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020529	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190320
5	NC_020529	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190320
6	NC_020529	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190320
7	NC_020529	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
8	NC_020529	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470190320
9	NC_020529	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190322
10	NC_020529	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190322
11	NC_020529	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020529	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190326
13	NC_020529	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190326
14	NC_020529	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470190327
15	NC_020529	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020529	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020529	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190328
18	NC_020529	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190328
19	NC_020529	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190329
20	NC_020529	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190330
21	NC_020529	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190332
22	NC_020529	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190335
23	NC_020529	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190336
24	NC_020529	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190338
25	NC_020529	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020529	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020529	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470190340
28	NC_020529	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020529	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020529	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190346
31	NC_020529	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470190346
32	NC_020529	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190349
33	NC_020529	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470190350
34	NC_020529	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470190350
35	NC_020529	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190351
36	NC_020529	TTGTGA	2	12	59572	59583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190353
37	NC_020529	TTTATA	2	12	59912	59923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190353
38	NC_020529	TTTATC	2	12	60216	60227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190354
39	NC_020529	ACAAAT	2	12	63549	63560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470190356
40	NC_020529	AATTAA	2	12	63640	63651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190356
41	NC_020529	ATTTAT	2	12	66059	66070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020529	TTAATG	2	12	66583	66594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190357
43	NC_020529	AAGTCA	2	12	67788	67799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190358
44	NC_020529	AAAAAG	2	12	67902	67913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190358
45	NC_020529	GAAAAA	2	12	68215	68226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190358
46	NC_020529	AATTAT	2	12	70454	70465	50 %	50 %	0 %	0 %	470190360
47	NC_020529	ACCCTT	2	12	72293	72304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470190361
48	NC_020529	TTTAGC	2	12	74202	74213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190362
49	NC_020529	AAATAA	2	12	74253	74264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190362
50	NC_020529	GTTAGA	2	12	76376	76387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190363
51	NC_020529	AAAAGA	2	12	76430	76441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190363
52	NC_020529	GCTAAA	2	12	79218	79229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190365
53	NC_020529	AACAAA	2	12	79639	79650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020529	TAAAGA	2	12	83366	83377	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190370
55	NC_020529	AACCAC	2	12	87238	87249	50 %	0 %	0 %	50 %	470190372
56	NC_020529	AATATA	2	12	88940	88951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020529	AACCGA	2	12	90549	90560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470190374
58	NC_020529	ATAGAT	2	12	95449	95460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190377
59	NC_020529	TATCAT	2	12	96216	96227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190378
60	NC_020529	TTTATT	2	12	96624	96635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470190379
61	NC_020529	TATTTG	2	12	96710	96721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190379
62	NC_020529	TAAATA	2	12	98143	98154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190379
63	NC_020529	TTTTTC	2	12	99837	99848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470190380
64	NC_020529	TTAAAT	2	12	99932	99943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020529	TAACAA	2	12	101289	101300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020529	TAAGCC	2	12	101698	101709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190382
67	NC_020529	ATCGCA	2	12	102913	102924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190383
68	NC_020529	TTTGAA	2	12	103944	103955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190384
69	NC_020529	CAATGG	2	12	112902	112913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470190390
70	NC_020529	TGAAGA	2	12	113736	113747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470190391
71	NC_020529	TTTCAT	2	12	114417	114428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190392
72	NC_020529	TGTATA	2	12	118637	118648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190396
73	NC_020529	TCGAAA	2	12	120138	120149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190398
74	NC_020529	CTATTG	2	12	122724	122735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190400
75	NC_020529	CATATG	2	12	123927	123938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190401
76	NC_020529	AATGTA	2	12	124828	124839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020529	CTGTAA	2	12	126649	126660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020529	GGTATG	2	12	126970	126981	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470190404
79	NC_020529	CAGATT	2	12	129568	129579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190406
80	NC_020529	AGATAT	2	12	136946	136957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190413
81	NC_020529	GTTTTT	2	12	137855	137866	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020529	ATGCCT	2	12	138085	138096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470190414
83	NC_020529	TGAAAG	2	12	138725	138736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470190414
84	NC_020529	GATATG	2	12	146225	146236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190420
85	NC_020529	ATTTGA	2	12	150131	150142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190423
86	NC_020529	GATTTT	2	12	154642	154653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190428
87	NC_020529	ACAAAG	2	12	159162	159173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470190432
88	NC_020529	TGTAAT	2	12	160186	160197	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020529	AAAGAT	2	12	161175	161186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190433
90	NC_020529	ATTAAT	2	12	163081	163092	50 %	50 %	0 %	0 %	470190434
91	NC_020529	CAATAT	2	12	163647	163658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190434
92	NC_020529	TCCCAC	2	12	164398	164409	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020529	TTGGTA	2	12	167732	167743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190438
94	NC_020529	GCGATT	2	12	167752	167763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470190438
95	NC_020529	AAATTT	2	12	167850	167861	50 %	50 %	0 %	0 %	470190438
96	NC_020529	ACCTGC	2	12	170753	170764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470190440
97	NC_020529	AAGATA	2	12	170899	170910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190440
98	NC_020529	CGTTAA	2	12	173833	173844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190442
99	NC_020529	CTATTA	2	12	175684	175695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190442
100	NC_020529	TATGAT	2	12	177218	177229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190442
101	NC_020529	TTGAAA	2	12	177670	177681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190442
102	NC_020529	AACATT	2	12	180110	180121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190442
103	NC_020529	AGCAAC	2	12	183599	183610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470190446
104	NC_020529	TGTTTG	2	12	183647	183658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190446
105	NC_020529	CACCTT	2	12	185651	185662	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470190448
106	NC_020529	ACCTTT	2	12	186156	186167	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470190448
107	NC_020529	TTTATA	2	12	186252	186263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020529	ATTAAT	2	12	186275	186286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020529	GTAAAT	2	12	189895	189906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190451
110	NC_020529	ATTTTA	2	12	191490	191501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190452
111	NC_020529	TATCTT	2	12	196104	196115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190455
112	NC_020529	ATTTGG	2	12	197117	197128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190456
113	NC_020529	GAGTTT	2	12	200460	200471	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190457
114	NC_020529	TATACA	2	12	204461	204472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190461
115	NC_020529	TTATTT	2	12	206493	206504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470190462
116	NC_020529	ATTTAT	2	12	207072	207083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190462
117	NC_020529	TTTTTA	2	12	207103	207114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020529	CCCTGA	2	12	209830	209841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470190465
119	NC_020529	TCCTGA	2	12	210649	210660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470190465
120	NC_020529	TCAATT	2	12	212800	212811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190467
121	NC_020529	AATATG	2	12	214100	214111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190468
122	NC_020529	GATTTT	2	12	217256	217267	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020529	AAAAAT	2	12	217607	217618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190470
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126	NC_020529	TTCTTG	2	12	224732	224743	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470190476
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129	NC_020529	GGAATA	2	12	252832	252843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020529	TGGTAT	2	12	264412	264423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020529	TATAGA	2	12	267766	267777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190504
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152	NC_020529	ACAAGA	2	12	307633	307644	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470190534
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240	NC_020529	AGTTGA	2	12	490551	490562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_020529	TAAAAA	2	12	491499	491510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190668
242	NC_020529	TTATAA	2	12	492946	492957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_020529	TTTATA	2	12	493863	493874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190670
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341	NC_020529	CCAAAC	2	12	596079	596090	50 %	0 %	0 %	50 %	470190733
342	NC_020529	TTTTGA	2	12	601866	601877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190739
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345	NC_020529	TATTTA	2	12	605980	605991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190741
346	NC_020529	AATGAT	2	12	608657	608668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_020529	TAGATG	2	12	608730	608741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
348	NC_020529	CATGAC	2	12	610680	610691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
349	NC_020529	GCAATT	2	12	612519	612530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190746
350	NC_020529	GAAAAA	2	12	613080	613091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190746
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352	NC_020529	TTGATA	2	12	617328	617339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190750
353	NC_020529	TAAAAT	2	12	624050	624061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_020529	AAAATA	2	12	626078	626089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190756
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357	NC_020529	TTTAAT	2	12	632169	632180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190763
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359	NC_020529	TTTGAT	2	12	636100	636111	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190765
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469	NC_020529	GATTCA	2	12	829149	829160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
470	NC_020529	GATTCA	2	12	829185	829196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
471	NC_020529	GATTCA	2	12	829203	829214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
472	NC_020529	GATTCA	2	12	829221	829232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
473	NC_020529	ATTCAG	2	12	829258	829269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
474	NC_020529	GATTCA	2	12	829563	829574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
475	NC_020529	TCAGAC	2	12	829584	829595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190914
476	NC_020529	TCAGAT	2	12	829602	829613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
477	NC_020529	GATTCA	2	12	829617	829628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
478	NC_020529	GACTCA	2	12	829671	829682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190914
479	NC_020529	GATTCA	2	12	829761	829772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
480	NC_020529	GACTCA	2	12	829797	829808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190914
481	NC_020529	GATTCA	2	12	829815	829826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190914
482	NC_020529	GACTCA	2	12	829833	829844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190914
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491	NC_020529	TAAAAA	2	12	845067	845078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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