MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020529	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020529	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020529	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020529	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020529	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020529	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020529	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020529	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020529	ATTTAT	2	12	66059	66070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020529	AACAAA	2	12	79639	79650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020529	AATATA	2	12	88940	88951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020529	TTAAAT	2	12	99932	99943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020529	TAACAA	2	12	101289	101300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020529	AATGTA	2	12	124828	124839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020529	CTGTAA	2	12	126649	126660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020529	GTTTTT	2	12	137855	137866	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020529	TGTAAT	2	12	160186	160197	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020529	TCCCAC	2	12	164398	164409	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020529	TTTATA	2	12	186252	186263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020529	ATTAAT	2	12	186275	186286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020529	TTTTTA	2	12	207103	207114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020529	GATTTT	2	12	217256	217267	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020529	ATATGA	2	12	237971	237982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020529	GGAATA	2	12	252832	252843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020529	TGGTAT	2	12	264412	264423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020529	ATATAG	2	12	274059	274070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020529	ATTTTC	2	12	279376	279387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020529	ATAATT	2	12	280325	280336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020529	AACGAT	2	12	287695	287706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020529	TAACTT	2	12	296070	296081	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020529	TAATTA	2	12	306793	306804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020529	ATATGA	2	12	345324	345335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020529	TTCATT	2	12	349779	349790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020529	TGCAAT	2	12	352911	352922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020529	TTGTAA	2	12	355082	355093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020529	AAGTAC	2	12	369373	369384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020529	GAAGAC	2	12	387463	387474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020529	AATGTA	2	12	393083	393094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020529	AATTTG	2	12	393190	393201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020529	TAAAGA	2	12	395178	395189	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020529	ATGAAA	2	12	417377	417388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020529	TGAAAT	2	12	418099	418110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020529	TTTAAT	2	12	423103	423114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020529	TGTATA	2	12	432335	432346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020529	TTTTTA	2	12	446975	446986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020529	TTAACA	2	12	462809	462820	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020529	ACGTTG	2	12	472772	472783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020529	AAAATA	2	12	473494	473505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020529	CAAGAA	2	12	480552	480563	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020529	AAAATG	2	12	490285	490296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020529	CAAGAT	2	12	490312	490323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020529	AGTTGA	2	12	490551	490562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020529	TTATAA	2	12	492946	492957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020529	AAATTT	2	12	499705	499716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020529	TGAAAG	2	12	523086	523097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020529	CATTTA	2	12	552416	552427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020529	CAGTAG	2	12	554469	554480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020529	TTATAA	2	12	554831	554842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020529	GTTATA	2	12	555502	555513	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020529	TTGTAC	2	12	563773	563784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020529	CTTAAA	2	12	563934	563945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020529	ACATGT	2	12	573908	573919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020529	ATTGCG	2	12	604739	604750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020529	AATGAT	2	12	608657	608668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020529	TAGATG	2	12	608730	608741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020529	CATGAC	2	12	610680	610691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020529	TAAAAT	2	12	624050	624061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020529	TTATTT	2	12	630168	630179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020529	GAAAAA	2	12	634493	634504	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020529	CATTAT	2	12	646246	646257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020529	TACTTG	2	12	650647	650658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020529	CATCAA	2	12	658297	658308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020529	TAATTT	2	12	662537	662548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020529	ATAAAA	2	12	663444	663455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020529	TGAATA	2	12	679013	679024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020529	ATTTAT	2	12	698362	698373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020529	AATTGA	2	12	698441	698452	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020529	TTAAAA	2	12	705022	705033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020529	GAAAAA	2	12	705212	705223	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020529	AAAGAT	2	12	705326	705337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020529	TAGTTA	2	12	709457	709468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020529	TTTTTA	2	12	727664	727675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020529	ATATCA	2	12	734415	734426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020529	GAATTA	2	12	735709	735720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020529	TGAAAA	2	12	735907	735918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020529	TTAATT	2	12	790065	790076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020529	ACAAAA	2	12	804823	804834	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020529	AAACAA	2	12	817330	817341	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020529	TTTATT	2	12	822497	822508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020529	TAAAAA	2	12	824189	824200	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020529	TATCAA	2	12	832167	832178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020529	TTTTGA	2	12	835987	835998	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020529	CTGTTT	2	12	836765	836776	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020529	TCATTT	2	12	841979	841990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020529	TAAAAA	2	12	845067	845078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020529	AGAAAA	2	12	849105	849116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020529	AGTGAA	2	12	853545	853556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020529	ATAAAG	2	12	853928	853939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020529	AAATTA	2	12	858702	858713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020529	AAGCAC	2	12	867435	867446	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020529	TAAAAT	2	12	876803	876814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020529	TGTAAT	2	12	881564	881575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020529	TTACAT	2	12	919557	919568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020529	ATTTAG	2	12	932845	932856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020529	ATTCAA	2	12	933010	933021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020529	TTTAAT	2	12	949330	949341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020529	TTGTTT	2	12	955419	955430	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020529	AAATTA	2	12	956464	956475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020529	ACAATA	2	12	966731	966742	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020529	AACGGA	2	12	981254	981265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020529	AAAAGC	2	12	985852	985863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020529	CACTTG	2	12	995236	995247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020529	CTAAAT	2	12	1000249	1000260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020529	CATTTA	2	12	1009402	1009413	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020529	ATCATA	2	12	1011297	1011308	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020529	TCAAAA	2	12	1017805	1017816	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020529	ATTGCA	2	12	1018934	1018945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020529	TTTTCT	2	12	1031664	1031675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020529	TAGTAT	2	12	1060672	1060683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020529	TTTATA	2	12	1067822	1067833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020529	ATTTTA	2	12	1074718	1074729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020529	TGGATA	2	12	1079663	1079674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020529	ATTTTT	2	12	1091772	1091783	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020529	ATAATT	2	12	1092569	1092580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020529	TCATTA	2	12	1097782	1097793	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020529	TAATGA	2	12	1105868	1105879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020529	GATTGC	2	12	1117067	1117078	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_020529	ATTTAT	2	12	1126435	1126446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020529	AAATTT	2	12	1131154	1131165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020529	GATTTT	2	12	1135243	1135254	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020529	AAGTAA	2	12	1152859	1152870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020529	TCGTTT	2	12	1155986	1155997	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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254	NC_020529	TTTAAT	2	12	2159983	2159994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_020529	CAAATA	2	12	2162203	2162214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_020529	TAAATG	2	12	2166257	2166268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_020529	AATTAA	2	12	2175634	2175645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020529	ATCATT	2	12	2203392	2203403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_020529	AGTTAA	2	12	2206976	2206987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_020529	TTTATT	2	12	2221422	2221433	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020529	AAATTT	2	12	2223279	2223290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020529	AATATT	2	12	2227103	2227114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_020529	TTTACG	2	12	2331654	2331665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
284	NC_020529	AATATA	2	12	2345589	2345600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.