MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 2460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470190316
2	NC_020529	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470190317
3	NC_020529	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470190317
4	NC_020529	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470190317
5	NC_020529	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470190319
6	NC_020529	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020529	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470190320
8	NC_020529	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470190321
9	NC_020529	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470190322
10	NC_020529	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020529	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020529	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470190325
13	NC_020529	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470190325
14	NC_020529	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470190327
15	NC_020529	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470190328
16	NC_020529	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470190329
17	NC_020529	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020529	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020529	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470190331
20	NC_020529	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470190331
21	NC_020529	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470190332
22	NC_020529	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470190332
23	NC_020529	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470190333
24	NC_020529	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470190333
25	NC_020529	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470190335
26	NC_020529	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470190335
27	NC_020529	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470190335
28	NC_020529	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470190336
29	NC_020529	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020529	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470190338
31	NC_020529	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470190338
32	NC_020529	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020529	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020529	ATGAG	2	10	37186	37195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020529	TGAAT	2	10	37533	37542	40 %	40 %	20 %	0 %	470190339
36	NC_020529	TTGGT	2	10	37575	37584	0 %	60 %	40 %	0 %	470190339
37	NC_020529	AATAT	2	10	37643	37652	60 %	40 %	0 %	0 %	470190339
38	NC_020529	TTCGT	2	10	37854	37863	0 %	60 %	20 %	20 %	470190339
39	NC_020529	CAAAA	2	10	38214	38223	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020529	AAATT	2	10	40313	40322	60 %	40 %	0 %	0 %	470190340
41	NC_020529	TTGAA	2	10	42342	42351	40 %	40 %	20 %	0 %	470190342
42	NC_020529	TTGAA	2	10	42688	42697	40 %	40 %	20 %	0 %	470190342
43	NC_020529	TTTGT	2	10	43592	43601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020529	TTTTG	2	10	45238	45247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020529	ATATT	2	10	45359	45368	40 %	60 %	0 %	0 %	470190344
46	NC_020529	GAATT	2	10	46276	46285	40 %	40 %	20 %	0 %	470190345
47	NC_020529	TCAGT	2	10	48177	48186	20 %	40 %	20 %	20 %	470190346
48	NC_020529	GGCCA	2	10	53184	53193	20 %	0 %	40 %	40 %	470190349
49	NC_020529	AAGTA	2	10	56410	56419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020529	TTTTA	2	10	56774	56783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020529	TAAAT	2	10	58894	58903	60 %	40 %	0 %	0 %	470190353
52	NC_020529	ATATT	2	10	60766	60775	40 %	60 %	0 %	0 %	470190354
53	NC_020529	AATGT	2	10	61491	61500	40 %	40 %	20 %	0 %	470190355
54	NC_020529	CATTT	2	10	62395	62404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020529	TAGTA	2	10	65039	65048	40 %	40 %	20 %	0 %	470190356
56	NC_020529	TTTTA	2	10	65255	65264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020529	TACTA	2	10	66398	66407	40 %	40 %	0 %	20 %	470190357
58	NC_020529	ATCAA	2	10	69148	69157	60 %	20 %	0 %	20 %	470190359
59	NC_020529	TAATA	2	10	70980	70989	60 %	40 %	0 %	0 %	470190360
60	NC_020529	GTGTT	2	10	71063	71072	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020529	ATTCA	2	10	73655	73664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020529	TATAT	2	10	73916	73925	40 %	60 %	0 %	0 %	470190362
63	NC_020529	CTAAA	2	10	75556	75565	60 %	20 %	0 %	20 %	470190363
64	NC_020529	CAAAA	2	10	75587	75596	80 %	0 %	0 %	20 %	470190363
65	NC_020529	GATAT	2	10	80279	80288	40 %	40 %	20 %	0 %	470190366
66	NC_020529	ATATA	2	10	81102	81111	60 %	40 %	0 %	0 %	470190367
67	NC_020529	GATAT	2	10	81936	81945	40 %	40 %	20 %	0 %	470190368
68	NC_020529	AATAA	2	10	82566	82575	80 %	20 %	0 %	0 %	470190369
69	NC_020529	ATTGC	2	10	84546	84555	20 %	40 %	20 %	20 %	470190371
70	NC_020529	TCATT	2	10	84734	84743	20 %	60 %	0 %	20 %	470190371
71	NC_020529	CATGG	2	10	85950	85959	20 %	20 %	40 %	20 %	470190371
72	NC_020529	TGAAA	2	10	86618	86627	60 %	20 %	20 %	0 %	470190372
73	NC_020529	TCAAT	2	10	86990	86999	40 %	40 %	0 %	20 %	470190372
74	NC_020529	GTATT	2	10	87479	87488	20 %	60 %	20 %	0 %	470190373
75	NC_020529	ATTAA	2	10	90221	90230	60 %	40 %	0 %	0 %	470190374
76	NC_020529	AGATA	2	10	93340	93349	60 %	20 %	20 %	0 %	470190376
77	NC_020529	TAAAA	2	10	93900	93909	80 %	20 %	0 %	0 %	470190376
78	NC_020529	ATACA	2	10	94330	94339	60 %	20 %	0 %	20 %	470190377
79	NC_020529	AAAGA	2	10	95533	95542	80 %	0 %	20 %	0 %	470190377
80	NC_020529	GTAAT	2	10	95752	95761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020529	ATGTT	2	10	97018	97027	20 %	60 %	20 %	0 %	470190379
82	NC_020529	TTGCG	2	10	97589	97598	0 %	40 %	40 %	20 %	470190379
83	NC_020529	AGTTA	2	10	99149	99158	40 %	40 %	20 %	0 %	470190380
84	NC_020529	AGATG	2	10	102348	102357	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020529	GGTGA	2	10	102944	102953	20 %	20 %	60 %	0 %	470190383
86	NC_020529	GAAAA	2	10	106381	106390	80 %	0 %	20 %	0 %	470190386
87	NC_020529	TTATT	2	10	106548	106557	20 %	80 %	0 %	0 %	470190386
88	NC_020529	AATCA	2	10	109570	109579	60 %	20 %	0 %	20 %	470190388
89	NC_020529	ATTTT	2	10	110268	110277	20 %	80 %	0 %	0 %	470190389
90	NC_020529	ATCAA	2	10	110295	110304	60 %	20 %	0 %	20 %	470190389
91	NC_020529	ATCAC	2	10	111528	111537	40 %	20 %	0 %	40 %	470190390
92	NC_020529	AACGA	2	10	112205	112214	60 %	0 %	20 %	20 %	470190390
93	NC_020529	ACACA	2	10	114261	114270	60 %	0 %	0 %	40 %	470190392
94	NC_020529	GACAA	2	10	115412	115421	60 %	0 %	20 %	20 %	470190393
95	NC_020529	ATTAC	2	10	117596	117605	40 %	40 %	0 %	20 %	470190395
96	NC_020529	ATTTT	2	10	117900	117909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020529	TATCT	2	10	118256	118265	20 %	60 %	0 %	20 %	470190396
98	NC_020529	ATACG	2	10	120689	120698	40 %	20 %	20 %	20 %	470190398
99	NC_020529	TTATA	2	10	121347	121356	40 %	60 %	0 %	0 %	470190399
100	NC_020529	TTTTA	2	10	122145	122154	20 %	80 %	0 %	0 %	470190399
101	NC_020529	GTATT	2	10	122658	122667	20 %	60 %	20 %	0 %	470190400
102	NC_020529	AATAA	2	10	123251	123260	80 %	20 %	0 %	0 %	470190400
103	NC_020529	TACGC	2	10	123518	123527	20 %	20 %	20 %	40 %	470190400
104	NC_020529	TCCCT	2	10	126324	126333	0 %	40 %	0 %	60 %	470190403
105	NC_020529	GCTTT	2	10	128558	128567	0 %	60 %	20 %	20 %	470190405
106	NC_020529	TAATT	2	10	128643	128652	40 %	60 %	0 %	0 %	470190405
107	NC_020529	ATACT	2	10	129824	129833	40 %	40 %	0 %	20 %	470190407
108	NC_020529	TAATA	2	10	130988	130997	60 %	40 %	0 %	0 %	470190408
109	NC_020529	ATTTT	2	10	131979	131988	20 %	80 %	0 %	0 %	470190409
110	NC_020529	TTGTA	2	10	134184	134193	20 %	60 %	20 %	0 %	470190411
111	NC_020529	TGCAA	2	10	135189	135198	40 %	20 %	20 %	20 %	470190412
112	NC_020529	ATATG	2	10	137207	137216	40 %	40 %	20 %	0 %	470190413
113	NC_020529	TATGA	2	10	138887	138896	40 %	40 %	20 %	0 %	470190415
114	NC_020529	AATAT	2	10	139893	139902	60 %	40 %	0 %	0 %	470190415
115	NC_020529	TGGTA	2	10	141790	141799	20 %	40 %	40 %	0 %	470190416
116	NC_020529	CGAAC	2	10	141880	141889	40 %	0 %	20 %	40 %	470190416
117	NC_020529	TTCAA	2	10	143905	143914	40 %	40 %	0 %	20 %	470190417
118	NC_020529	ACATC	2	10	144748	144757	40 %	20 %	0 %	40 %	470190419
119	NC_020529	TAATT	2	10	146971	146980	40 %	60 %	0 %	0 %	470190420
120	NC_020529	AGAGA	2	10	149997	150006	60 %	0 %	40 %	0 %	470190423
121	NC_020529	AATCC	2	10	150353	150362	40 %	20 %	0 %	40 %	470190423
122	NC_020529	TGAAT	2	10	159109	159118	40 %	40 %	20 %	0 %	470190432
123	NC_020529	TGATT	2	10	160240	160249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020529	CAAAA	2	10	160493	160502	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020529	CAAAA	2	10	162604	162613	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020529	TAAAG	2	10	162953	162962	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020529	TTCAT	2	10	163347	163356	20 %	60 %	0 %	20 %	470190434
128	NC_020529	TTTAC	2	10	163730	163739	20 %	60 %	0 %	20 %	470190434
129	NC_020529	TTATT	2	10	164944	164953	20 %	80 %	0 %	0 %	470190435
130	NC_020529	GGATT	2	10	165932	165941	20 %	40 %	40 %	0 %	470190436
131	NC_020529	TAACT	2	10	168969	168978	40 %	40 %	0 %	20 %	470190439
132	NC_020529	TTTAT	2	10	171877	171886	20 %	80 %	0 %	0 %	470190441
133	NC_020529	TATCA	2	10	172981	172990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020529	ATGCA	2	10	173480	173489	40 %	20 %	20 %	20 %	470190442
135	NC_020529	TATGA	2	10	180726	180735	40 %	40 %	20 %	0 %	470190443
136	NC_020529	GTGAA	2	10	180760	180769	40 %	20 %	40 %	0 %	470190443
137	NC_020529	ATCAT	2	10	181113	181122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020529	TTAAT	2	10	181203	181212	40 %	60 %	0 %	0 %	470190444
139	NC_020529	ATATA	2	10	184033	184042	60 %	40 %	0 %	0 %	470190447
140	NC_020529	AAGAT	2	10	187762	187771	60 %	20 %	20 %	0 %	470190449
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155	NC_020529	AAAAT	2	10	198030	198039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_020529	GCAAT	2	10	303644	303653	40 %	20 %	20 %	20 %	470190533
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267	NC_020529	TTTTA	2	10	328188	328197	20 %	80 %	0 %	0 %	470190548
268	NC_020529	TCATA	2	10	328555	328564	40 %	40 %	0 %	20 %	470190548
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