MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470190316
2	NC_020529	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470190317
3	NC_020529	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470190317
4	NC_020529	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470190317
5	NC_020529	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470190319
6	NC_020529	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470190320
7	NC_020529	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470190321
8	NC_020529	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470190322
9	NC_020529	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470190325
10	NC_020529	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470190325
11	NC_020529	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470190327
12	NC_020529	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470190328
13	NC_020529	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470190329
14	NC_020529	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470190331
15	NC_020529	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470190331
16	NC_020529	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470190332
17	NC_020529	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470190332
18	NC_020529	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470190333
19	NC_020529	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470190333
20	NC_020529	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470190335
21	NC_020529	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470190335
22	NC_020529	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470190335
23	NC_020529	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470190336
24	NC_020529	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470190338
25	NC_020529	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470190338
26	NC_020529	TGAAT	2	10	37533	37542	40 %	40 %	20 %	0 %	470190339
27	NC_020529	TTGGT	2	10	37575	37584	0 %	60 %	40 %	0 %	470190339
28	NC_020529	AATAT	2	10	37643	37652	60 %	40 %	0 %	0 %	470190339
29	NC_020529	TTCGT	2	10	37854	37863	0 %	60 %	20 %	20 %	470190339
30	NC_020529	AAATT	2	10	40313	40322	60 %	40 %	0 %	0 %	470190340
31	NC_020529	TTGAA	2	10	42342	42351	40 %	40 %	20 %	0 %	470190342
32	NC_020529	TTGAA	2	10	42688	42697	40 %	40 %	20 %	0 %	470190342
33	NC_020529	ATATT	2	10	45359	45368	40 %	60 %	0 %	0 %	470190344
34	NC_020529	GAATT	2	10	46276	46285	40 %	40 %	20 %	0 %	470190345
35	NC_020529	TCAGT	2	10	48177	48186	20 %	40 %	20 %	20 %	470190346
36	NC_020529	GGCCA	2	10	53184	53193	20 %	0 %	40 %	40 %	470190349
37	NC_020529	TAAAT	2	10	58894	58903	60 %	40 %	0 %	0 %	470190353
38	NC_020529	ATATT	2	10	60766	60775	40 %	60 %	0 %	0 %	470190354
39	NC_020529	AATGT	2	10	61491	61500	40 %	40 %	20 %	0 %	470190355
40	NC_020529	TAGTA	2	10	65039	65048	40 %	40 %	20 %	0 %	470190356
41	NC_020529	TACTA	2	10	66398	66407	40 %	40 %	0 %	20 %	470190357
42	NC_020529	ATCAA	2	10	69148	69157	60 %	20 %	0 %	20 %	470190359
43	NC_020529	TAATA	2	10	70980	70989	60 %	40 %	0 %	0 %	470190360
44	NC_020529	TATAT	2	10	73916	73925	40 %	60 %	0 %	0 %	470190362
45	NC_020529	CTAAA	2	10	75556	75565	60 %	20 %	0 %	20 %	470190363
46	NC_020529	CAAAA	2	10	75587	75596	80 %	0 %	0 %	20 %	470190363
47	NC_020529	GATAT	2	10	80279	80288	40 %	40 %	20 %	0 %	470190366
48	NC_020529	ATATA	2	10	81102	81111	60 %	40 %	0 %	0 %	470190367
49	NC_020529	GATAT	2	10	81936	81945	40 %	40 %	20 %	0 %	470190368
50	NC_020529	AATAA	2	10	82566	82575	80 %	20 %	0 %	0 %	470190369
51	NC_020529	ATTGC	2	10	84546	84555	20 %	40 %	20 %	20 %	470190371
52	NC_020529	TCATT	2	10	84734	84743	20 %	60 %	0 %	20 %	470190371
53	NC_020529	CATGG	2	10	85950	85959	20 %	20 %	40 %	20 %	470190371
54	NC_020529	TGAAA	2	10	86618	86627	60 %	20 %	20 %	0 %	470190372
55	NC_020529	TCAAT	2	10	86990	86999	40 %	40 %	0 %	20 %	470190372
56	NC_020529	GTATT	2	10	87479	87488	20 %	60 %	20 %	0 %	470190373
57	NC_020529	ATTAA	2	10	90221	90230	60 %	40 %	0 %	0 %	470190374
58	NC_020529	AGATA	2	10	93340	93349	60 %	20 %	20 %	0 %	470190376
59	NC_020529	TAAAA	2	10	93900	93909	80 %	20 %	0 %	0 %	470190376
60	NC_020529	ATACA	2	10	94330	94339	60 %	20 %	0 %	20 %	470190377
61	NC_020529	AAAGA	2	10	95533	95542	80 %	0 %	20 %	0 %	470190377
62	NC_020529	ATGTT	2	10	97018	97027	20 %	60 %	20 %	0 %	470190379
63	NC_020529	TTGCG	2	10	97589	97598	0 %	40 %	40 %	20 %	470190379
64	NC_020529	AGTTA	2	10	99149	99158	40 %	40 %	20 %	0 %	470190380
65	NC_020529	GGTGA	2	10	102944	102953	20 %	20 %	60 %	0 %	470190383
66	NC_020529	GAAAA	2	10	106381	106390	80 %	0 %	20 %	0 %	470190386
67	NC_020529	TTATT	2	10	106548	106557	20 %	80 %	0 %	0 %	470190386
68	NC_020529	AATCA	2	10	109570	109579	60 %	20 %	0 %	20 %	470190388
69	NC_020529	ATTTT	2	10	110268	110277	20 %	80 %	0 %	0 %	470190389
70	NC_020529	ATCAA	2	10	110295	110304	60 %	20 %	0 %	20 %	470190389
71	NC_020529	ATCAC	2	10	111528	111537	40 %	20 %	0 %	40 %	470190390
72	NC_020529	AACGA	2	10	112205	112214	60 %	0 %	20 %	20 %	470190390
73	NC_020529	ACACA	2	10	114261	114270	60 %	0 %	0 %	40 %	470190392
74	NC_020529	GACAA	2	10	115412	115421	60 %	0 %	20 %	20 %	470190393
75	NC_020529	ATTAC	2	10	117596	117605	40 %	40 %	0 %	20 %	470190395
76	NC_020529	TATCT	2	10	118256	118265	20 %	60 %	0 %	20 %	470190396
77	NC_020529	ATACG	2	10	120689	120698	40 %	20 %	20 %	20 %	470190398
78	NC_020529	TTATA	2	10	121347	121356	40 %	60 %	0 %	0 %	470190399
79	NC_020529	TTTTA	2	10	122145	122154	20 %	80 %	0 %	0 %	470190399
80	NC_020529	GTATT	2	10	122658	122667	20 %	60 %	20 %	0 %	470190400
81	NC_020529	AATAA	2	10	123251	123260	80 %	20 %	0 %	0 %	470190400
82	NC_020529	TACGC	2	10	123518	123527	20 %	20 %	20 %	40 %	470190400
83	NC_020529	TCCCT	2	10	126324	126333	0 %	40 %	0 %	60 %	470190403
84	NC_020529	GCTTT	2	10	128558	128567	0 %	60 %	20 %	20 %	470190405
85	NC_020529	TAATT	2	10	128643	128652	40 %	60 %	0 %	0 %	470190405
86	NC_020529	ATACT	2	10	129824	129833	40 %	40 %	0 %	20 %	470190407
87	NC_020529	TAATA	2	10	130988	130997	60 %	40 %	0 %	0 %	470190408
88	NC_020529	ATTTT	2	10	131979	131988	20 %	80 %	0 %	0 %	470190409
89	NC_020529	TTGTA	2	10	134184	134193	20 %	60 %	20 %	0 %	470190411
90	NC_020529	TGCAA	2	10	135189	135198	40 %	20 %	20 %	20 %	470190412
91	NC_020529	ATATG	2	10	137207	137216	40 %	40 %	20 %	0 %	470190413
92	NC_020529	TATGA	2	10	138887	138896	40 %	40 %	20 %	0 %	470190415
93	NC_020529	AATAT	2	10	139893	139902	60 %	40 %	0 %	0 %	470190415
94	NC_020529	TGGTA	2	10	141790	141799	20 %	40 %	40 %	0 %	470190416
95	NC_020529	CGAAC	2	10	141880	141889	40 %	0 %	20 %	40 %	470190416
96	NC_020529	TTCAA	2	10	143905	143914	40 %	40 %	0 %	20 %	470190417
97	NC_020529	ACATC	2	10	144748	144757	40 %	20 %	0 %	40 %	470190419
98	NC_020529	TAATT	2	10	146971	146980	40 %	60 %	0 %	0 %	470190420
99	NC_020529	AGAGA	2	10	149997	150006	60 %	0 %	40 %	0 %	470190423
100	NC_020529	AATCC	2	10	150353	150362	40 %	20 %	0 %	40 %	470190423
101	NC_020529	TGAAT	2	10	159109	159118	40 %	40 %	20 %	0 %	470190432
102	NC_020529	TTCAT	2	10	163347	163356	20 %	60 %	0 %	20 %	470190434
103	NC_020529	TTTAC	2	10	163730	163739	20 %	60 %	0 %	20 %	470190434
104	NC_020529	TTATT	2	10	164944	164953	20 %	80 %	0 %	0 %	470190435
105	NC_020529	GGATT	2	10	165932	165941	20 %	40 %	40 %	0 %	470190436
106	NC_020529	TAACT	2	10	168969	168978	40 %	40 %	0 %	20 %	470190439
107	NC_020529	TTTAT	2	10	171877	171886	20 %	80 %	0 %	0 %	470190441
108	NC_020529	ATGCA	2	10	173480	173489	40 %	20 %	20 %	20 %	470190442
109	NC_020529	TATGA	2	10	180726	180735	40 %	40 %	20 %	0 %	470190443
110	NC_020529	GTGAA	2	10	180760	180769	40 %	20 %	40 %	0 %	470190443
111	NC_020529	TTAAT	2	10	181203	181212	40 %	60 %	0 %	0 %	470190444
112	NC_020529	ATATA	2	10	184033	184042	60 %	40 %	0 %	0 %	470190447
113	NC_020529	AAGAT	2	10	187762	187771	60 %	20 %	20 %	0 %	470190449
114	NC_020529	CGTTT	2	10	188210	188219	0 %	60 %	20 %	20 %	470190450
115	NC_020529	AAATG	2	10	190690	190699	60 %	20 %	20 %	0 %	470190452
116	NC_020529	GTAAA	2	10	190854	190863	60 %	20 %	20 %	0 %	470190452
117	NC_020529	TTTAA	2	10	190874	190883	40 %	60 %	0 %	0 %	470190452
118	NC_020529	TTTGC	2	10	191390	191399	0 %	60 %	20 %	20 %	470190452
119	NC_020529	TTGTT	2	10	192396	192405	0 %	80 %	20 %	0 %	470190452
120	NC_020529	CAAAA	2	10	195608	195617	80 %	0 %	0 %	20 %	470190455
121	NC_020529	AGTTT	2	10	196144	196153	20 %	60 %	20 %	0 %	470190455
122	NC_020529	CAACA	2	10	196374	196383	60 %	0 %	0 %	40 %	470190455
123	NC_020529	AAAAT	2	10	197002	197011	80 %	20 %	0 %	0 %	470190456
124	NC_020529	AAATG	2	10	197411	197420	60 %	20 %	20 %	0 %	470190456
125	NC_020529	TTGAA	2	10	198685	198694	40 %	40 %	20 %	0 %	470190457
126	NC_020529	ATTAT	2	10	200641	200650	40 %	60 %	0 %	0 %	470190457
127	NC_020529	AATAG	2	10	201407	201416	60 %	20 %	20 %	0 %	470190458
128	NC_020529	ATACA	2	10	202044	202053	60 %	20 %	0 %	20 %	470190459
129	NC_020529	GTGTT	2	10	204729	204738	0 %	60 %	40 %	0 %	470190461
130	NC_020529	TAATT	2	10	207233	207242	40 %	60 %	0 %	0 %	470190463
131	NC_020529	TCTAT	2	10	207366	207375	20 %	60 %	0 %	20 %	470190463
132	NC_020529	ATAAA	2	10	207481	207490	80 %	20 %	0 %	0 %	470190463
133	NC_020529	AAAGA	2	10	208136	208145	80 %	0 %	20 %	0 %	470190464
134	NC_020529	CATGT	2	10	209341	209350	20 %	40 %	20 %	20 %	470190465
135	NC_020529	TTGAA	2	10	209416	209425	40 %	40 %	20 %	0 %	470190465
136	NC_020529	AATTG	2	10	210741	210750	40 %	40 %	20 %	0 %	470190465
137	NC_020529	TTTTC	2	10	210990	210999	0 %	80 %	0 %	20 %	470190466
138	NC_020529	TCAAT	2	10	211429	211438	40 %	40 %	0 %	20 %	470190466
139	NC_020529	TTATT	2	10	211462	211471	20 %	80 %	0 %	0 %	470190466
140	NC_020529	CTATG	2	10	213718	213727	20 %	40 %	20 %	20 %	470190468
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143	NC_020529	GGAAT	2	10	221270	221279	40 %	20 %	40 %	0 %	470190473
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151	NC_020529	GTAAC	2	10	232089	232098	40 %	20 %	20 %	20 %	470190483
152	NC_020529	ATTGT	2	10	232157	232166	20 %	60 %	20 %	0 %	470190483
153	NC_020529	TAACT	2	10	236748	236757	40 %	40 %	0 %	20 %	470190485
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177	NC_020529	TATTC	2	10	271699	271708	20 %	60 %	0 %	20 %	470190507
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249	NC_020529	TCTAT	2	10	390513	390522	20 %	60 %	0 %	20 %	470190596
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254	NC_020529	CATGC	2	10	398172	398181	20 %	20 %	20 %	40 %	470190601
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256	NC_020529	CAATA	2	10	401104	401113	60 %	20 %	0 %	20 %	470190603
257	NC_020529	TTACT	2	10	402188	402197	20 %	60 %	0 %	20 %	470190604
258	NC_020529	CGATT	2	10	402610	402619	20 %	40 %	20 %	20 %	470190604
259	NC_020529	GCTGT	2	10	403716	403725	0 %	40 %	40 %	20 %	470190605
260	NC_020529	CTGCA	2	10	406641	406650	20 %	20 %	20 %	40 %	470190608
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262	NC_020529	TTAAA	2	10	408441	408450	60 %	40 %	0 %	0 %	470190610
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