MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 2433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020529	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020529	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020529	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020529	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020529	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020529	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020529	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020529	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020529	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020529	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020529	AGTA	2	8	20567	20574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020529	ATTC	2	8	20652	20659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020529	TTTG	2	8	23804	23811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020529	ATCT	2	8	24139	24146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020529	GCCT	2	8	24267	24274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020529	ATTT	2	8	24599	24606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020529	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020529	TTCT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020529	ATAA	2	8	34430	34437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020529	TAAA	2	8	35807	35814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020529	AAAT	2	8	36632	36639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020529	TTAA	2	8	37304	37311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020529	AAGA	2	8	38162	38169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020529	GCAT	2	8	38342	38349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020529	AGCA	2	8	41946	41953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020529	TCTT	2	8	44370	44377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020529	GATA	2	8	44692	44699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020529	ACTT	2	8	45122	45129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020529	TTAT	3	12	45142	45153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020529	TGGT	2	8	45712	45719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020529	TTTC	2	8	46577	46584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020529	GTAA	2	8	46703	46710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020529	ATCC	2	8	46991	46998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020529	TCAA	2	8	48493	48500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020529	AATT	2	8	50544	50551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020529	CTTG	2	8	50595	50602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020529	AATT	2	8	50634	50641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020529	AATG	2	8	54969	54976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020529	TAAT	2	8	55211	55218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020529	ATTT	2	8	56027	56034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020529	TTAT	2	8	56088	56095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020529	CTAA	2	8	56193	56200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020529	GATT	2	8	62454	62461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020529	TAGA	2	8	62641	62648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020529	TTCA	2	8	63033	63040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020529	ATAA	2	8	63239	63246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020529	ATAA	2	8	63249	63256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020529	ATCA	2	8	63374	63381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020529	AACA	2	8	65301	65308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020529	ATTG	2	8	65418	65425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020529	CTTG	2	8	65578	65585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020529	ATTT	2	8	65737	65744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020529	CATA	2	8	66125	66132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020529	ATTA	2	8	66982	66989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020529	TCCT	2	8	67126	67133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020529	TAAT	2	8	71265	71272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020529	TGAC	2	8	71300	71307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020529	ATTT	2	8	72992	72999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020529	AAGA	2	8	73210	73217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020529	ATTT	2	8	73226	73233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020529	AAGA	2	8	73266	73273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020529	TATT	2	8	73290	73297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020529	ATTT	2	8	73460	73467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020529	AATA	2	8	74461	74468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020529	AGCT	2	8	78289	78296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020529	TAAT	2	8	78363	78370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020529	TAAT	2	8	78435	78442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020529	AGAA	2	8	78454	78461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020529	TTGT	2	8	79573	79580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020529	AATC	2	8	82963	82970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020529	ATAA	2	8	86212	86219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020529	TTAT	2	8	88997	89004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020529	ATAA	2	8	89292	89299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020529	CAAT	2	8	91164	91171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020529	AGGG	2	8	94218	94225	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020529	ATAA	2	8	96341	96348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020529	TATT	2	8	96379	96386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020529	AGTA	2	8	98321	98328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020529	TTGT	2	8	98464	98471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020529	AAAT	2	8	99963	99970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020529	ATTG	2	8	101209	101216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020529	GTTA	2	8	101331	101338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020529	TCAG	2	8	108422	108429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020529	TAAA	2	8	115976	115983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020529	TAAA	2	8	116014	116021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020529	GAAA	2	8	116847	116854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020529	ATAA	2	8	117665	117672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020529	TAAA	2	8	117912	117919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020529	AAAT	2	8	123824	123831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020529	ATTA	2	8	123858	123865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020529	ATTA	2	8	124697	124704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020529	TAAA	2	8	124721	124728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020529	GAGC	2	8	125634	125641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020529	TGAA	2	8	125697	125704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020529	ATAG	2	8	126608	126615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020529	TAAA	2	8	128885	128892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020529	CTTT	2	8	133316	133323	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020529	CTTT	2	8	134573	134580	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020529	ATTT	2	8	134660	134667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020529	AAGA	2	8	136246	136253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020529	GAGT	2	8	136269	136276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020529	ACTT	2	8	137831	137838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020529	ATTT	2	8	140169	140176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020529	TATT	2	8	143013	143020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020529	TAAT	2	8	143173	143180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020529	ATTA	2	8	147248	147255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020529	TAAA	2	8	157298	157305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020529	TAAA	2	8	160416	160423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020529	AATA	2	8	162522	162529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020529	GTTT	2	8	162802	162809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020529	TAAC	2	8	162902	162909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020529	AAAT	2	8	164369	164376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020529	GTTT	2	8	164410	164417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020529	TGTA	2	8	164524	164531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020529	TTTA	2	8	164649	164656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020529	GAGT	2	8	166400	166407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020529	TCAT	2	8	171148	171155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020529	TTTG	2	8	171231	171238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020529	ATTT	2	8	172597	172604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020529	ATTT	2	8	172609	172616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020529	ATGT	2	8	172840	172847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020529	TTAA	2	8	172961	172968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020529	AGTA	2	8	173003	173010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020529	ATCA	2	8	181147	181154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020529	TAAA	2	8	181872	181879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020529	ATGT	2	8	186409	186416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020529	TTAA	2	8	187889	187896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020529	AATA	2	8	187969	187976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020529	TGTA	2	8	192727	192734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020529	CTTA	2	8	192816	192823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020529	TAAT	2	8	192842	192849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020529	TTTG	2	8	192932	192939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020529	AAAG	2	8	193113	193120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020529	AGTT	2	8	197612	197619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020529	ATGA	2	8	197860	197867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020529	GTAG	2	8	197913	197920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020529	CTTT	2	8	205358	205365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020529	CTAT	2	8	208520	208527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020529	ACAA	2	8	208567	208574	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020529	ATTT	2	8	208856	208863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020529	GAAA	2	8	208879	208886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020529	ATAA	2	8	208962	208969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020529	TAGT	2	8	209100	209107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020529	TAGT	2	8	217404	217411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020529	ATGA	2	8	217447	217454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020529	TGAA	2	8	228083	228090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020529	TTGT	2	8	228142	228149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020529	TATT	2	8	228974	228981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020529	GAAA	2	8	230772	230779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020529	TTTG	2	8	234262	234269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020529	ACAT	2	8	234588	234595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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