MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 33655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190316
2	NC_020529	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190316
3	NC_020529	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190316
4	NC_020529	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190316
5	NC_020529	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
6	NC_020529	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190316
7	NC_020529	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190316
8	NC_020529	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190316
9	NC_020529	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190316
10	NC_020529	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190316
11	NC_020529	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190316
12	NC_020529	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190316
13	NC_020529	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190316
14	NC_020529	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190316
15	NC_020529	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190316
16	NC_020529	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
17	NC_020529	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470190316
18	NC_020529	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
19	NC_020529	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190316
20	NC_020529	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470190316
21	NC_020529	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
22	NC_020529	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
23	NC_020529	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470190316
24	NC_020529	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190316
25	NC_020529	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190316
26	NC_020529	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
27	NC_020529	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190316
28	NC_020529	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
29	NC_020529	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190316
30	NC_020529	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190317
31	NC_020529	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190317
32	NC_020529	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190317
33	NC_020529	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190317
34	NC_020529	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190317
35	NC_020529	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190317
36	NC_020529	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190317
37	NC_020529	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190317
38	NC_020529	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190317
39	NC_020529	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190317
40	NC_020529	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190317
41	NC_020529	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190317
42	NC_020529	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190317
43	NC_020529	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190317
44	NC_020529	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190317
45	NC_020529	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190317
46	NC_020529	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190317
47	NC_020529	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190317
48	NC_020529	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190317
49	NC_020529	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190317
50	NC_020529	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190317
51	NC_020529	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190317
52	NC_020529	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190317
53	NC_020529	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190318
54	NC_020529	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190318
55	NC_020529	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190318
56	NC_020529	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470190318
57	NC_020529	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190318
58	NC_020529	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190318
59	NC_020529	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190318
60	NC_020529	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190318
61	NC_020529	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190318
62	NC_020529	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190318
63	NC_020529	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190318
64	NC_020529	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190318
65	NC_020529	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190318
66	NC_020529	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190318
67	NC_020529	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190318
68	NC_020529	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190318
69	NC_020529	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190319
70	NC_020529	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190319
71	NC_020529	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190319
72	NC_020529	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190319
73	NC_020529	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470190319
74	NC_020529	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190319
75	NC_020529	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190319
76	NC_020529	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190319
77	NC_020529	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190319
78	NC_020529	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190319
79	NC_020529	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190319
80	NC_020529	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190319
81	NC_020529	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190319
82	NC_020529	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190319
83	NC_020529	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190319
84	NC_020529	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190319
85	NC_020529	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190319
86	NC_020529	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190319
87	NC_020529	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190319
88	NC_020529	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470190319
89	NC_020529	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190319
90	NC_020529	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190319
91	NC_020529	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190319
92	NC_020529	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190319
93	NC_020529	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190319
94	NC_020529	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190319
95	NC_020529	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190319
96	NC_020529	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190319
97	NC_020529	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190320
98	NC_020529	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190320
99	NC_020529	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190320
100	NC_020529	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190320
101	NC_020529	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
102	NC_020529	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470190320
103	NC_020529	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470190320
104	NC_020529	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190320
105	NC_020529	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190320
106	NC_020529	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190320
107	NC_020529	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
108	NC_020529	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190320
109	NC_020529	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190320
110	NC_020529	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190320
111	NC_020529	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190320
112	NC_020529	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190320
113	NC_020529	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190320
114	NC_020529	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190320
115	NC_020529	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190320
116	NC_020529	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190320
117	NC_020529	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
118	NC_020529	TAC	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190320
119	NC_020529	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
120	NC_020529	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190320
121	NC_020529	AGA	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190320
122	NC_020529	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190320
123	NC_020529	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190320
124	NC_020529	GTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190320
125	NC_020529	GTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190320
126	NC_020529	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190320
127	NC_020529	ATG	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
128	NC_020529	CTT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190320
129	NC_020529	GTG	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190320
130	NC_020529	AGA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190320
131	NC_020529	TGA	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
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255	NC_020529	AGA	2	6	17854	17859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190326
256	NC_020529	TCA	2	6	17895	17900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190326
257	NC_020529	TAT	2	6	18021	18026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190326
258	NC_020529	ATT	2	6	18035	18040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190326
259	NC_020529	TAT	2	6	18054	18059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190326
260	NC_020529	ACT	2	6	18247	18252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190326
261	NC_020529	AAT	2	6	18296	18301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190326
262	NC_020529	AAT	2	6	18324	18329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190327
263	NC_020529	TCA	2	6	18371	18376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190327
264	NC_020529	ATC	2	6	18379	18384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190327
265	NC_020529	TGA	2	6	18461	18466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190327
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269	NC_020529	ATT	2	6	18858	18863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190327
270	NC_020529	TTA	2	6	18941	18946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190327
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275	NC_020529	ACG	2	6	19470	19475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190327
276	NC_020529	TGA	2	6	19478	19483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190327
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280	NC_020529	GTT	2	6	19639	19644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190327
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284	NC_020529	AAC	2	6	19763	19768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190327
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287	NC_020529	ATC	2	6	20021	20026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190327
288	NC_020529	AGC	2	6	20043	20048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190327
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499	NC_020529	AAG	2	6	37955	37960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190339
500	NC_020529	TCA	2	6	38696	38701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190340

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