MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020528	AGTGTC	2	12	3400	3411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020528	TCCCGC	2	12	51043	51054	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020528	ACCGAG	2	12	56273	56284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020528	CGTTTC	2	12	74807	74818	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020528	AGAGAA	2	12	81569	81580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020528	TTTCTC	2	12	83450	83461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020528	ATCCGG	2	12	86589	86600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020528	CAAAAG	2	12	117731	117742	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020528	TATTTT	2	12	129802	129813	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020528	GCGCGA	2	12	157085	157096	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020528	AGCCGC	2	12	174925	174936	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020528	CAGCGG	2	12	209551	209562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020528	CGCGCT	2	12	251698	251709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020528	CTGCCC	2	12	252808	252819	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020528	ATGGTG	2	12	322848	322859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020528	TCGACT	2	12	349794	349805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020528	CGGGAA	2	12	367060	367071	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020528	GGATAT	2	12	373850	373861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020528	CGCAGG	2	12	437078	437089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020528	GACAGG	2	12	483115	483126	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020528	CGGAGG	2	12	486171	486182	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020528	CGGCCG	2	12	501986	501997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020528	CGTGCG	2	12	561141	561152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020528	GGCAAG	2	12	561324	561335	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020528	CAAAAA	2	12	580084	580095	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020528	CGGGGA	2	12	650632	650643	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020528	AGGCGG	2	12	657266	657277	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020528	TCGTTG	2	12	661327	661338	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020528	CATCGG	2	12	736781	736792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020528	CGGCTT	2	12	751929	751940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020528	GACAAG	2	12	775229	775240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020528	TGCCAT	2	12	778480	778491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020528	AACAAA	2	12	807461	807472	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020528	CTTCTG	2	12	830352	830363	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020528	GAAGCG	2	12	868766	868777	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020528	CGTCGG	2	12	888283	888294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020528	TTCGTC	2	12	892048	892059	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020528	CCGAAC	2	12	909048	909059	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020528	GGCCGC	2	12	918036	918047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020528	GGCAGG	2	12	932415	932426	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020528	AAATAT	2	12	1029683	1029694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020528	CGATAG	2	12	1034029	1034040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020528	TATAGG	2	12	1047577	1047588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020528	TCAACG	2	12	1048676	1048687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020528	GGCCAT	2	12	1051504	1051515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020528	GTTAGA	2	12	1056159	1056170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020528	CTGGCT	2	12	1083448	1083459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020528	GCTTGC	2	12	1124367	1124378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020528	TTCGGC	2	12	1127056	1127067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020528	GTTTAC	2	12	1130121	1130132	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020528	CTTCCC	2	12	1134557	1134568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020528	GAATCG	2	12	1146699	1146710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020528	ATTCCC	2	12	1148026	1148037	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020528	GCGCGT	2	12	1155984	1155995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020528	GTCCCG	2	12	1187498	1187509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020528	CTCCAG	2	12	1198165	1198176	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020528	TTTCCG	2	12	1232416	1232427	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020528	GTGCCG	2	12	1242661	1242672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020528	GCCTCA	2	12	1246136	1246147	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020528	CGGCGC	2	12	1328528	1328539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020528	GACGAA	2	12	1440197	1440208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020528	GCGGGG	2	12	1452331	1452342	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020528	GACGCG	2	12	1462915	1462926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020528	CAGGAA	2	12	1478960	1478971	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020528	GTTCTC	2	12	1518901	1518912	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020528	TGCCGG	2	12	1531055	1531066	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020528	CCGGCC	2	12	1534636	1534647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020528	CTCGGT	2	12	1554880	1554891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020528	GGGACC	2	12	1579048	1579059	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020528	GGGACC	2	12	1580767	1580778	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020528	GCGGCC	2	12	1592052	1592063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020528	CGAATG	2	12	1599429	1599440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020528	TTTCCT	2	12	1604187	1604198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020528	AGACGG	2	12	1655727	1655738	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020528	CAAATT	2	12	1685004	1685015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020528	TCGGAA	2	12	1723353	1723364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020528	CCTTAC	2	12	1727836	1727847	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020528	CGTTGA	2	12	1733101	1733112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020528	AGGCTG	2	12	1754184	1754195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020528	GGTGCT	2	12	1754232	1754243	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020528	ACCGAA	2	12	1785403	1785414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020528	GCACCG	2	12	1815355	1815366	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020528	TGAGAG	2	12	1851190	1851201	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020528	GGTCAT	2	12	1929051	1929062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020528	CTGTCG	2	12	1983235	1983246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020528	CGGTGC	2	12	2065466	2065477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020528	AGACCG	2	12	2065507	2065518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020528	ATGCCG	2	12	2101287	2101298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020528	AGAAGG	2	12	2152917	2152928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020528	CGGGAT	2	12	2208767	2208778	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020528	CAAGGC	2	12	2217068	2217079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020528	CCGCGT	2	12	2266143	2266154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020528	GCCTCC	2	12	2278966	2278977	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_020528	CCGACG	2	12	2284095	2284106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020528	CATTGG	2	12	2292613	2292624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020528	GTAACT	2	12	2312904	2312915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020528	GGGCTG	2	12	2323002	2323013	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020528	CCGGTT	2	12	2349207	2349218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020528	CGGCCG	2	12	2419106	2419117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020528	GAGGCC	2	12	2474608	2474619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020528	GCGCCC	2	12	2494556	2494567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020528	CTCGAC	2	12	2494573	2494584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020528	TTTGCT	2	12	2495919	2495930	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020528	TGATTC	2	12	2528886	2528897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020528	GGACGA	2	12	2537406	2537417	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_020528	GCGATG	2	12	2566321	2566332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020528	AAATGA	2	12	2673561	2673572	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020528	GCGCTC	2	12	2680451	2680462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020528	ACGATC	2	12	2682047	2682058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020528	GCGGCC	2	12	2710667	2710678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020528	TCGCCC	2	12	2723744	2723755	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_020528	GGCTGC	2	12	2800981	2800992	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020528	CCGGAT	2	12	2806227	2806238	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020528	GAGAAA	2	12	2809366	2809377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020528	TTTCTC	2	12	2811246	2811257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020528	GAATAA	2	12	2822009	2822020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020528	GACCGA	2	12	2824355	2824366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020528	ACGTAA	2	12	2850090	2850101	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020528	AGCGGC	2	12	2894721	2894732	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020528	ACGTCG	2	12	2916346	2916357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020528	AGAGCG	2	12	2916842	2916853	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020528	GTCTAG	2	12	2938787	2938798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020528	CCCCAA	2	12	2939634	2939645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_020528	TCATGT	2	12	3032768	3032779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020528	ACATGA	2	12	3032803	3032814	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020528	GAAGCG	2	12	3051370	3051381	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020528	GCGTTC	2	12	3056670	3056681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020528	ATTCCC	2	12	3106214	3106225	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020528	GATTGA	2	12	3129573	3129584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020528	GAAAAG	2	12	3131620	3131631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020528	CTCGTT	2	12	3188799	3188810	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020528	TATGTG	2	12	3207779	3207790	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020528	CCGGAT	2	12	3209084	3209095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020528	GAGAAA	2	12	3212223	3212234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020528	TTTCTC	2	12	3214103	3214114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020528	CCGAGT	2	12	3238293	3238304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020528	CACTGG	2	12	3300962	3300973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020528	ACGTAA	2	12	3319187	3319198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_020528	TTCGTC	2	12	3357329	3357340	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020528	GAGGCG	2	12	3385783	3385794	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_020528	TCCGCG	2	12	3410700	3410711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020528	CATGTT	2	12	3461425	3461436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_020528	CAGCCC	2	12	3512903	3512914	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_020528	GGGGCC	2	12	3543546	3543557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020528	GAATCG	2	12	3544392	3544403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_020528	GCATAT	2	12	3555822	3555833	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_020528	CCTCTC	2	12	3575073	3575084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_020528	CTCGGT	2	12	3622638	3622649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.