MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011

Total Repeats: 2297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020528	TCGCT	2	10	6584	6593	0 %	40 %	20 %	40 %	470186964
2	NC_020528	GCGCG	2	10	7064	7073	0 %	0 %	60 %	40 %	470186964
3	NC_020528	CCCGG	2	10	7757	7766	0 %	0 %	40 %	60 %	470186965
4	NC_020528	CGAGG	2	10	7903	7912	20 %	0 %	60 %	20 %	470186965
5	NC_020528	GTGCT	2	10	9528	9537	0 %	40 %	40 %	20 %	470186967
6	NC_020528	GCTGT	2	10	9693	9702	0 %	40 %	40 %	20 %	470186967
7	NC_020528	CGCGG	2	10	12163	12172	0 %	0 %	60 %	40 %	470186969
8	NC_020528	GGCCG	2	10	12493	12502	0 %	0 %	60 %	40 %	470186969
9	NC_020528	GCCTC	2	10	13233	13242	0 %	20 %	20 %	60 %	470186969
10	NC_020528	GATCA	2	10	14030	14039	40 %	20 %	20 %	20 %	470186970
11	NC_020528	CGCTG	2	10	15381	15390	0 %	20 %	40 %	40 %	470186971
12	NC_020528	CGGCG	2	10	17594	17603	0 %	0 %	60 %	40 %	470186973
13	NC_020528	TGGGC	2	10	18481	18490	0 %	20 %	60 %	20 %	470186974
14	NC_020528	GACCG	2	10	19033	19042	20 %	0 %	40 %	40 %	470186974
15	NC_020528	CATTG	2	10	25903	25912	20 %	40 %	20 %	20 %	470186980
16	NC_020528	CCTGC	2	10	28464	28473	0 %	20 %	20 %	60 %	470186983
17	NC_020528	GCATG	2	10	30931	30940	20 %	20 %	40 %	20 %	470186985
18	NC_020528	GCCGG	2	10	31870	31879	0 %	0 %	60 %	40 %	470186986
19	NC_020528	CCAAA	2	10	33922	33931	60 %	0 %	0 %	40 %	470186987
20	NC_020528	CGCGC	2	10	34997	35006	0 %	0 %	40 %	60 %	470186989
21	NC_020528	GCCGA	2	10	35046	35055	20 %	0 %	40 %	40 %	470186989
22	NC_020528	GCGTC	2	10	36364	36373	0 %	20 %	40 %	40 %	470186989
23	NC_020528	TGCCG	2	10	38576	38585	0 %	20 %	40 %	40 %	470186990
24	NC_020528	CCGAC	2	10	40012	40021	20 %	0 %	20 %	60 %	470186990
25	NC_020528	GCCGT	2	10	40907	40916	0 %	20 %	40 %	40 %	470186990
26	NC_020528	CCGGT	2	10	43707	43716	0 %	20 %	40 %	40 %	470186993
27	NC_020528	GTCGC	2	10	47271	47280	0 %	20 %	40 %	40 %	470186994
28	NC_020528	CCGGT	2	10	51748	51757	0 %	20 %	40 %	40 %	470186999
29	NC_020528	CGCCT	2	10	55814	55823	0 %	20 %	20 %	60 %	470187003
30	NC_020528	TCGCC	2	10	57953	57962	0 %	20 %	20 %	60 %	470187006
31	NC_020528	CGAGG	2	10	58823	58832	20 %	0 %	60 %	20 %	470187007
32	NC_020528	TCGTC	2	10	60895	60904	0 %	40 %	20 %	40 %	470187010
33	NC_020528	TCGGG	2	10	61937	61946	0 %	20 %	60 %	20 %	470187011
34	NC_020528	TGCGC	2	10	62688	62697	0 %	20 %	40 %	40 %	470187013
35	NC_020528	AGCGA	2	10	66812	66821	40 %	0 %	40 %	20 %	470187016
36	NC_020528	CAGGC	2	10	69093	69102	20 %	0 %	40 %	40 %	470187017
37	NC_020528	CGACG	2	10	69641	69650	20 %	0 %	40 %	40 %	470187017
38	NC_020528	CGTGC	2	10	71420	71429	0 %	20 %	40 %	40 %	470187018
39	NC_020528	ATCTC	2	10	72348	72357	20 %	40 %	0 %	40 %	470187019
40	NC_020528	GGGCA	2	10	77425	77434	20 %	0 %	60 %	20 %	470187022
41	NC_020528	GGTCG	2	10	79978	79987	0 %	20 %	60 %	20 %	470187025
42	NC_020528	CGTTG	2	10	80071	80080	0 %	40 %	40 %	20 %	470187025
43	NC_020528	GCCTT	2	10	80264	80273	0 %	40 %	20 %	40 %	470187025
44	NC_020528	TTCAT	2	10	80837	80846	20 %	60 %	0 %	20 %	470187025
45	NC_020528	CGCGG	2	10	88371	88380	0 %	0 %	60 %	40 %	470187026
46	NC_020528	TTGCC	2	10	90503	90512	0 %	40 %	20 %	40 %	470187028
47	NC_020528	CACCG	2	10	92439	92448	20 %	0 %	20 %	60 %	470187031
48	NC_020528	TGCCC	2	10	94624	94633	0 %	20 %	20 %	60 %	470187034
49	NC_020528	CAGAC	2	10	99596	99605	40 %	0 %	20 %	40 %	470187038
50	NC_020528	CTTGC	2	10	100411	100420	0 %	40 %	20 %	40 %	470187038
51	NC_020528	TCGGC	2	10	100628	100637	0 %	20 %	40 %	40 %	470187038
52	NC_020528	GTTCG	2	10	100668	100677	0 %	40 %	40 %	20 %	470187038
53	NC_020528	GGGCA	2	10	101124	101133	20 %	0 %	60 %	20 %	470187039
54	NC_020528	CGCAT	2	10	102010	102019	20 %	20 %	20 %	40 %	470187040
55	NC_020528	GCCGC	2	10	102021	102030	0 %	0 %	40 %	60 %	470187040
56	NC_020528	GACCG	2	10	103228	103237	20 %	0 %	40 %	40 %	470187041
57	NC_020528	CGGCT	2	10	103724	103733	0 %	20 %	40 %	40 %	470187042
58	NC_020528	CGCGC	2	10	107531	107540	0 %	0 %	40 %	60 %	470187045
59	NC_020528	GCCGC	2	10	108969	108978	0 %	0 %	40 %	60 %	470187047
60	NC_020528	TGCCG	2	10	109708	109717	0 %	20 %	40 %	40 %	470187048
61	NC_020528	TGCAT	2	10	111433	111442	20 %	40 %	20 %	20 %	470187051
62	NC_020528	GATCG	2	10	120991	121000	20 %	20 %	40 %	20 %	470187059
63	NC_020528	ATCGA	2	10	124619	124628	40 %	20 %	20 %	20 %	470187061
64	NC_020528	GATGG	2	10	126718	126727	20 %	20 %	60 %	0 %	470187062
65	NC_020528	ATCGC	2	10	126875	126884	20 %	20 %	20 %	40 %	470187062
66	NC_020528	TCGCA	2	10	126926	126935	20 %	20 %	20 %	40 %	470187062
67	NC_020528	CCGGC	2	10	127539	127548	0 %	0 %	40 %	60 %	470187063
68	NC_020528	GCAGG	2	10	127659	127668	20 %	0 %	60 %	20 %	470187063
69	NC_020528	CGGCC	2	10	128410	128419	0 %	0 %	40 %	60 %	470187063
70	NC_020528	CGGCG	2	10	128968	128977	0 %	0 %	60 %	40 %	470187064
71	NC_020528	GCTCA	2	10	129309	129318	20 %	20 %	20 %	40 %	470187064
72	NC_020528	CGTCG	2	10	130320	130329	0 %	20 %	40 %	40 %	470187065
73	NC_020528	CCGGA	2	10	130679	130688	20 %	0 %	40 %	40 %	470187065
74	NC_020528	GCGCG	2	10	132698	132707	0 %	0 %	60 %	40 %	470187068
75	NC_020528	CGAGC	2	10	132949	132958	20 %	0 %	40 %	40 %	470187068
76	NC_020528	TGCGA	2	10	134130	134139	20 %	20 %	40 %	20 %	470187069
77	NC_020528	CGATG	2	10	143646	143655	20 %	20 %	40 %	20 %	470187078
78	NC_020528	CTGAT	2	10	144680	144689	20 %	40 %	20 %	20 %	470187078
79	NC_020528	GATGG	2	10	144893	144902	20 %	20 %	60 %	0 %	470187079
80	NC_020528	GGATT	2	10	146011	146020	20 %	40 %	40 %	0 %	470187079
81	NC_020528	TGCGG	2	10	153014	153023	0 %	20 %	60 %	20 %	470187085
82	NC_020528	GGCGC	2	10	153598	153607	0 %	0 %	60 %	40 %	470187085
83	NC_020528	TCGGC	2	10	153655	153664	0 %	20 %	40 %	40 %	470187085
84	NC_020528	TGCCG	2	10	153724	153733	0 %	20 %	40 %	40 %	470187085
85	NC_020528	AGCAG	2	10	154637	154646	40 %	0 %	40 %	20 %	470187086
86	NC_020528	CGGGC	2	10	155217	155226	0 %	0 %	60 %	40 %	470187087
87	NC_020528	GCCGC	2	10	156858	156867	0 %	0 %	40 %	60 %	470187088
88	NC_020528	TTTGG	2	10	158735	158744	0 %	60 %	40 %	0 %	470187091
89	NC_020528	GCTTG	2	10	161144	161153	0 %	40 %	40 %	20 %	470187094
90	NC_020528	TCGGC	2	10	161666	161675	0 %	20 %	40 %	40 %	470187095
91	NC_020528	CTCGA	2	10	162925	162934	20 %	20 %	20 %	40 %	470187096
92	NC_020528	GCCGA	2	10	163321	163330	20 %	0 %	40 %	40 %	470187096
93	NC_020528	CAGCG	2	10	163774	163783	20 %	0 %	40 %	40 %	470187096
94	NC_020528	GCCTT	2	10	165245	165254	0 %	40 %	20 %	40 %	470187098
95	NC_020528	GGGGC	2	10	168004	168013	0 %	0 %	80 %	20 %	470187100
96	NC_020528	GCACA	2	10	168863	168872	40 %	0 %	20 %	40 %	470187101
97	NC_020528	CCAAA	2	10	170987	170996	60 %	0 %	0 %	40 %	470187102
98	NC_020528	CGATC	2	10	172321	172330	20 %	20 %	20 %	40 %	470187104
99	NC_020528	CGCGG	2	10	174382	174391	0 %	0 %	60 %	40 %	470187106
100	NC_020528	CGCGC	2	10	174666	174675	0 %	0 %	40 %	60 %	470187106
101	NC_020528	AGCCG	2	10	179023	179032	20 %	0 %	40 %	40 %	470187110
102	NC_020528	GAATG	2	10	182284	182293	40 %	20 %	40 %	0 %	470187112
103	NC_020528	GGCCG	2	10	184136	184145	0 %	0 %	60 %	40 %	470187114
104	NC_020528	GGCGA	2	10	186090	186099	20 %	0 %	60 %	20 %	470187115
105	NC_020528	AGCGG	2	10	186816	186825	20 %	0 %	60 %	20 %	470187115
106	NC_020528	CGAGG	2	10	187201	187210	20 %	0 %	60 %	20 %	470187116
107	NC_020528	GATCT	2	10	189206	189215	20 %	40 %	20 %	20 %	470187118
108	NC_020528	AAGGC	2	10	191859	191868	40 %	0 %	40 %	20 %	470187119
109	NC_020528	AGCGC	2	10	193857	193866	20 %	0 %	40 %	40 %	470187122
110	NC_020528	GGGAG	2	10	194109	194118	20 %	0 %	80 %	0 %	470187122
111	NC_020528	GGGGA	2	10	196990	196999	20 %	0 %	80 %	0 %	470187126
112	NC_020528	GGCCG	2	10	197529	197538	0 %	0 %	60 %	40 %	470187127
113	NC_020528	TCGGA	2	10	199246	199255	20 %	20 %	40 %	20 %	470187128
114	NC_020528	GGCGA	2	10	199550	199559	20 %	0 %	60 %	20 %	470187128
115	NC_020528	ATGCC	2	10	199968	199977	20 %	20 %	20 %	40 %	470187128
116	NC_020528	CCCGG	2	10	200068	200077	0 %	0 %	40 %	60 %	470187128
117	NC_020528	GCAGG	2	10	201149	201158	20 %	0 %	60 %	20 %	470187128
118	NC_020528	GTGGC	2	10	201171	201180	0 %	20 %	60 %	20 %	470187128
119	NC_020528	CGCTG	2	10	204991	205000	0 %	20 %	40 %	40 %	470187131
120	NC_020528	GCGCC	2	10	205648	205657	0 %	0 %	40 %	60 %	470187132
121	NC_020528	TCGCG	2	10	207376	207385	0 %	20 %	40 %	40 %	470187134
122	NC_020528	GAAGT	2	10	210398	210407	40 %	20 %	40 %	0 %	470187135
123	NC_020528	GCGCG	2	10	212318	212327	0 %	0 %	60 %	40 %	470187136
124	NC_020528	CACCG	2	10	215015	215024	20 %	0 %	20 %	60 %	470187139
125	NC_020528	CGCGC	3	15	215031	215045	0 %	0 %	40 %	60 %	470187139
126	NC_020528	CCGAG	2	10	215277	215286	20 %	0 %	40 %	40 %	470187139
127	NC_020528	GAGAA	2	10	215297	215306	60 %	0 %	40 %	0 %	470187139
128	NC_020528	CCGCA	2	10	217599	217608	20 %	0 %	20 %	60 %	470187141
129	NC_020528	CGCAG	2	10	219501	219510	20 %	0 %	40 %	40 %	470187144
130	NC_020528	GTCGA	2	10	220182	220191	20 %	20 %	40 %	20 %	470187145
131	NC_020528	ATCGC	2	10	220548	220557	20 %	20 %	20 %	40 %	470187145
132	NC_020528	TCGTC	2	10	220735	220744	0 %	40 %	20 %	40 %	470187145
133	NC_020528	CACCG	2	10	221729	221738	20 %	0 %	20 %	60 %	470187145
134	NC_020528	TCACT	2	10	223065	223074	20 %	40 %	0 %	40 %	470187146
135	NC_020528	GTAGC	2	10	224850	224859	20 %	20 %	40 %	20 %	470187147
136	NC_020528	CGGAA	2	10	229707	229716	40 %	0 %	40 %	20 %	470187151
137	NC_020528	GCCGA	2	10	230125	230134	20 %	0 %	40 %	40 %	470187151
138	NC_020528	CGAGG	2	10	230956	230965	20 %	0 %	60 %	20 %	470187152
139	NC_020528	CGGCG	2	10	233160	233169	0 %	0 %	60 %	40 %	470187155
140	NC_020528	GCGAC	2	10	233573	233582	20 %	0 %	40 %	40 %	470187155
141	NC_020528	GGCAA	2	10	233932	233941	40 %	0 %	40 %	20 %	470187155
142	NC_020528	CGGCG	2	10	234791	234800	0 %	0 %	60 %	40 %	470187156
143	NC_020528	CGGCG	2	10	235609	235618	0 %	0 %	60 %	40 %	470187157
144	NC_020528	GCCGC	2	10	236019	236028	0 %	0 %	40 %	60 %	470187157
145	NC_020528	GTCGC	2	10	236035	236044	0 %	20 %	40 %	40 %	470187157
146	NC_020528	CGATG	2	10	236816	236825	20 %	20 %	40 %	20 %	470187158
147	NC_020528	CGGCG	2	10	237811	237820	0 %	0 %	60 %	40 %	470187159
148	NC_020528	CTTCG	2	10	238376	238385	0 %	40 %	20 %	40 %	470187159
149	NC_020528	GCCTT	2	10	238942	238951	0 %	40 %	20 %	40 %	470187160
150	NC_020528	GAGGC	2	10	240593	240602	20 %	0 %	60 %	20 %	470187162
151	NC_020528	CAGTT	2	10	242168	242177	20 %	40 %	20 %	20 %	470187164
152	NC_020528	ACGGC	2	10	249274	249283	20 %	0 %	40 %	40 %	470187171
153	NC_020528	CGGGA	2	10	250840	250849	20 %	0 %	60 %	20 %	470187172
154	NC_020528	GCTTC	2	10	251454	251463	0 %	40 %	20 %	40 %	470187173
155	NC_020528	CGGCT	2	10	251902	251911	0 %	20 %	40 %	40 %	470187174
156	NC_020528	GGGCA	2	10	252307	252316	20 %	0 %	60 %	20 %	470187174
157	NC_020528	GCCTT	2	10	252374	252383	0 %	40 %	20 %	40 %	470187174
158	NC_020528	ACCGG	2	10	253088	253097	20 %	0 %	40 %	40 %	470187175
159	NC_020528	TTTCG	2	10	255786	255795	0 %	60 %	20 %	20 %	470187177
160	NC_020528	TCGGC	2	10	257445	257454	0 %	20 %	40 %	40 %	470187180
161	NC_020528	GCTCG	2	10	259369	259378	0 %	20 %	40 %	40 %	470187182
162	NC_020528	CCGAA	2	10	261551	261560	40 %	0 %	20 %	40 %	470187184
163	NC_020528	ATGAC	2	10	262508	262517	40 %	20 %	20 %	20 %	470187186
164	NC_020528	GGCGA	2	10	262657	262666	20 %	0 %	60 %	20 %	470187186
165	NC_020528	CGGCG	2	10	263094	263103	0 %	0 %	60 %	40 %	470187186
166	NC_020528	GCCTC	2	10	264140	264149	0 %	20 %	20 %	60 %	470187188
167	NC_020528	ATCGC	2	10	264821	264830	20 %	20 %	20 %	40 %	470187188
168	NC_020528	AAAGC	2	10	265039	265048	60 %	0 %	20 %	20 %	470187188
169	NC_020528	CGACA	2	10	267147	267156	40 %	0 %	20 %	40 %	470187190
170	NC_020528	GCAGG	2	10	270024	270033	20 %	0 %	60 %	20 %	470187192
171	NC_020528	CGCCA	2	10	271464	271473	20 %	0 %	20 %	60 %	470187193
172	NC_020528	GATCC	2	10	272905	272914	20 %	20 %	20 %	40 %	470187193
173	NC_020528	GCGAC	2	10	273667	273676	20 %	0 %	40 %	40 %	470187195
174	NC_020528	ATCGG	2	10	273969	273978	20 %	20 %	40 %	20 %	470187195
175	NC_020528	GACGC	2	10	274303	274312	20 %	0 %	40 %	40 %	470187195
176	NC_020528	CGCGT	2	10	275519	275528	0 %	20 %	40 %	40 %	470187196
177	NC_020528	CCTGC	2	10	276098	276107	0 %	20 %	20 %	60 %	470187196
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180	NC_020528	GCCAG	2	10	277476	277485	20 %	0 %	40 %	40 %	470187198
181	NC_020528	CGGCG	2	10	280405	280414	0 %	0 %	60 %	40 %	470187199
182	NC_020528	TGGAC	2	10	281852	281861	20 %	20 %	40 %	20 %	470187201
183	NC_020528	ACTTC	2	10	283053	283062	20 %	40 %	0 %	40 %	470187202
184	NC_020528	GATCT	2	10	283854	283863	20 %	40 %	20 %	20 %	470187203
185	NC_020528	AGCCG	2	10	285038	285047	20 %	0 %	40 %	40 %	470187205
186	NC_020528	CGAGA	2	10	285696	285705	40 %	0 %	40 %	20 %	470187205
187	NC_020528	TCCGC	2	10	287383	287392	0 %	20 %	20 %	60 %	470187207
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191	NC_020528	GCGCT	2	10	290820	290829	0 %	20 %	40 %	40 %	470187209
192	NC_020528	AGGCC	2	10	291270	291279	20 %	0 %	40 %	40 %	470187210
193	NC_020528	TCGCG	2	10	295200	295209	0 %	20 %	40 %	40 %	470187213
194	NC_020528	GCCGA	2	10	296269	296278	20 %	0 %	40 %	40 %	470187213
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198	NC_020528	TCGCC	2	10	297982	297991	0 %	20 %	20 %	60 %	470187215
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200	NC_020528	GATCG	2	10	299583	299592	20 %	20 %	40 %	20 %	470187217
201	NC_020528	GGCGG	2	10	302332	302341	0 %	0 %	80 %	20 %	470187220
202	NC_020528	TTGTC	2	10	302922	302931	0 %	60 %	20 %	20 %	470187221
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212	NC_020528	GCGCA	2	10	322082	322091	20 %	0 %	40 %	40 %	470187240
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225	NC_020528	ACCGC	2	10	342136	342145	20 %	0 %	20 %	60 %	470187263
226	NC_020528	CGCGG	2	10	343067	343076	0 %	0 %	60 %	40 %	470187265
227	NC_020528	GACGT	2	10	343991	344000	20 %	20 %	40 %	20 %	470187268
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230	NC_020528	GAAGG	2	10	351046	351055	40 %	0 %	60 %	0 %	470187274
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233	NC_020528	CGTTC	2	10	353361	353370	0 %	40 %	20 %	40 %	470187276
234	NC_020528	CGCGA	2	10	361447	361456	20 %	0 %	40 %	40 %	470187284
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238	NC_020528	CGGCG	2	10	366653	366662	0 %	0 %	60 %	40 %	470187291
239	NC_020528	ACGTC	2	10	367923	367932	20 %	20 %	20 %	40 %	470187292
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241	NC_020528	CCGAG	2	10	369407	369416	20 %	0 %	40 %	40 %	470187293
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244	NC_020528	GGGGC	2	10	372366	372375	0 %	0 %	80 %	20 %	470187296
245	NC_020528	ATCGC	2	10	374288	374297	20 %	20 %	20 %	40 %	470187298
246	NC_020528	CATGC	2	10	376611	376620	20 %	20 %	20 %	40 %	470187301
247	NC_020528	GCGGG	2	10	378513	378522	0 %	0 %	80 %	20 %	470187303
248	NC_020528	GGTCG	2	10	378571	378580	0 %	20 %	60 %	20 %	470187303
249	NC_020528	GTTCG	2	10	378781	378790	0 %	40 %	40 %	20 %	470187303
250	NC_020528	CAGGG	2	10	379483	379492	20 %	0 %	60 %	20 %	470187304
251	NC_020528	AGCCG	2	10	388042	388051	20 %	0 %	40 %	40 %	470187310
252	NC_020528	CGAGG	2	10	390160	390169	20 %	0 %	60 %	20 %	470187312
253	NC_020528	AACCG	2	10	390893	390902	40 %	0 %	20 %	40 %	470187313
254	NC_020528	TGATG	2	10	391082	391091	20 %	40 %	40 %	0 %	470187313
255	NC_020528	CGCGG	2	10	391382	391391	0 %	0 %	60 %	40 %	470187314
256	NC_020528	GTCCG	2	10	393015	393024	0 %	20 %	40 %	40 %	470187316
257	NC_020528	GCGCA	2	10	393116	393125	20 %	0 %	40 %	40 %	470187316
258	NC_020528	TCCAT	2	10	394507	394516	20 %	40 %	0 %	40 %	470187317
259	NC_020528	ACGGT	2	10	397049	397058	20 %	20 %	40 %	20 %	470187319
260	NC_020528	CCGCG	2	10	400561	400570	0 %	0 %	40 %	60 %	470187322
261	NC_020528	CACGG	2	10	403298	403307	20 %	0 %	40 %	40 %	470187326
262	NC_020528	GCAGC	2	10	404130	404139	20 %	0 %	40 %	40 %	470187327
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