MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020527	GACGAA	2	12	13214	13225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020527	GAGGGG	2	12	54545	54556	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020527	CATTTT	2	12	124798	124809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020527	ATCGAT	2	12	172636	172647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020527	CACCCG	2	12	173840	173851	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020527	ATTGTC	2	12	174831	174842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020527	GAGGAA	2	12	186177	186188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020527	GTGCAA	2	12	206584	206595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020527	TGCCAT	2	12	209816	209827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020527	GTGCAT	2	12	257852	257863	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020527	CCGCAG	2	12	262970	262981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020527	ACGGAA	2	12	288496	288507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020527	TGCGCG	2	12	340721	340732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020527	TCGGCA	2	12	343029	343040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020527	CGTGTC	2	12	347805	347816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020527	AGCGCG	2	12	372096	372107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020527	CGATGC	2	12	391676	391687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020527	TTGCCG	2	12	424225	424236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020527	ACCGTG	2	12	428253	428264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020527	CAGTCG	3	18	452427	452444	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020527	CCACTC	2	12	462169	462180	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020527	CGAGGA	2	12	463886	463897	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020527	TTGCAT	2	12	472041	472052	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020527	CGGCGC	2	12	472242	472253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020527	GAGCGC	2	12	475892	475903	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020527	TCTCCA	2	12	510075	510086	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020527	CGAGAT	2	12	579500	579511	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020527	CTCGCA	2	12	584057	584068	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020527	CGATTA	2	12	607809	607820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020527	TAGCTG	2	12	623285	623296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020527	TCAGCG	2	12	654315	654326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020527	TTGCGC	2	12	658029	658040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020527	CGCTGA	2	12	681987	681998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020527	GCCGCA	2	12	698376	698387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020527	CCCTGC	2	12	763830	763841	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020527	GCCGCA	2	12	798458	798469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020527	GCTCCA	2	12	800847	800858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020527	CCTTGG	2	12	824012	824023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020527	CCGGAT	2	12	838340	838351	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020527	GCCTCG	2	12	888320	888331	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020527	TCCTGT	2	12	924866	924877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020527	GACAGC	2	12	931421	931432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020527	TCACCA	2	12	950836	950847	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020527	GCGCGA	2	12	956942	956953	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020527	CTCGGC	2	12	970056	970067	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020527	CCGCTG	2	12	975096	975107	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020527	CGAAAC	2	12	1033780	1033791	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020527	TCCTTG	2	12	1047615	1047626	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020527	ATCTAA	2	12	1072544	1072555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020527	GCACTG	2	12	1080861	1080872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020527	GTTTCT	2	12	1090522	1090533	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020527	CGTCCG	2	12	1097881	1097892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020527	GCGACG	2	12	1099869	1099880	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020527	TCGTTT	2	12	1105369	1105380	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020527	GACGAA	2	12	1154938	1154949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020527	GCCGCG	2	12	1214654	1214665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020527	AGCTGA	2	12	1214922	1214933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020527	GCAAGA	2	12	1246292	1246303	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020527	TCACTG	2	12	1268028	1268039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020527	CGGTCC	2	12	1284467	1284478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020527	CGGCAA	2	12	1293906	1293917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020527	GCGACG	2	12	1302639	1302650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020527	GGCAGT	2	12	1303144	1303155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020527	GGCATC	2	12	1317586	1317597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020527	TCACTC	2	12	1321046	1321057	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020527	GACGAA	2	12	1338669	1338680	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020527	CGTCAG	2	12	1343118	1343129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.