MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii D1279779 plasmid pD1279779

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020525	TTC	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469820174
2	NC_020525	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820174
3	NC_020525	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820174
4	NC_020525	GTT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820174
5	NC_020525	AGA	2	6	525	530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820174
6	NC_020525	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820174
7	NC_020525	GTA	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820174
8	NC_020525	ATG	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020525	TGA	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820175
10	NC_020525	ACT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469820175
11	NC_020525	TAT	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020525	TAA	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020525	TAA	2	6	1875	1880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020525	ATT	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020525	AAT	2	6	1934	1939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020525	TAA	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020525	ATC	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469820176
18	NC_020525	TGC	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469820176
19	NC_020525	CAA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820176
20	NC_020525	TCT	2	6	2358	2363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020525	ACC	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020525	CTT	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020525	AAT	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020525	ATT	2	6	2589	2594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020525	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020525	ATA	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020525	GTT	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820177
28	NC_020525	ACA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820177
29	NC_020525	GTC	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469820177
30	NC_020525	TAG	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820177
31	NC_020525	TAA	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820177
32	NC_020525	ATT	2	6	3233	3238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820178
33	NC_020525	TGA	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820178
34	NC_020525	TAA	3	9	3513	3521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820178
35	NC_020525	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020525	AGA	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020525	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020525	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020525	TTA	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820179
40	NC_020525	AGC	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469820179
41	NC_020525	GAT	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820179
42	NC_020525	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820179
43	NC_020525	TGG	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469820179
44	NC_020525	TAA	2	6	4443	4448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020525	TAA	2	6	4742	4747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820180
46	NC_020525	ATT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820180
47	NC_020525	TGA	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820180
48	NC_020525	TGT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820180
49	NC_020525	TTG	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820180
50	NC_020525	GTA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020525	ATT	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020525	TAG	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020525	AGA	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
54	NC_020525	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820181
55	NC_020525	ATT	2	6	5454	5459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820181
56	NC_020525	GCA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469820181
57	NC_020525	AGA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
58	NC_020525	AGA	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
59	NC_020525	ATA	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820181
60	NC_020525	GGT	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469820181
61	NC_020525	TAA	2	6	5894	5899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820181
62	NC_020525	ATA	2	6	5975	5980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020525	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020525	GAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020525	AAG	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020525	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020525	ATT	2	6	6274	6279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020525	ATT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020525	ACA	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020525	AAT	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020525	TCA	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020525	GTT	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020525	AAC	2	6	6610	6615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020525	ATC	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020525	GTG	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020525	CGA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.