MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020524	TGAATT	2	12	1530	1541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	469816146
2	NC_020524	GCAAGA	2	12	2819	2830	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	469816148
3	NC_020524	AAATCT	2	12	3039	3050	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816148
4	NC_020524	TAAAAG	2	12	5950	5961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	469816151
5	NC_020524	CGTGAA	2	12	6991	7002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	469816153
6	NC_020524	ATTTCT	2	12	7084	7095	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	469816153
7	NC_020524	TGAAAA	2	12	8624	8635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	469816155
8	NC_020524	GCCGTT	2	12	12443	12454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816160
9	NC_020524	AAACGA	2	12	18878	18889	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	469816168
10	NC_020524	TCAGCC	2	12	20955	20966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	469816169
11	NC_020524	GAAGAG	2	12	24016	24027	50 %	0 %	50 %	0 %	469816172
12	NC_020524	CTAATC	2	12	26017	26028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816173
13	NC_020524	GCAAAA	2	12	32356	32367	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	469816181
14	NC_020524	ATGACT	2	12	41072	41083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	469816190
15	NC_020524	AACGTA	2	12	43806	43817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	469816197
16	NC_020524	TGCTTT	2	12	58779	58790	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	469816216
17	NC_020524	AGCAGT	2	12	68581	68592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	469816231
18	NC_020524	ATGAGG	2	12	77054	77065	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	469816242
19	NC_020524	CCGCTT	2	12	80769	80780	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	469816247
20	NC_020524	TGACGA	2	12	81949	81960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	469816248
21	NC_020524	AAAAAG	2	12	82188	82199	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	469816248
22	NC_020524	GTTGAT	2	12	83099	83110	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	469816249
23	NC_020524	AAATTA	2	12	83891	83902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816250
24	NC_020524	CAAGAA	2	12	89145	89156	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	469816259
25	NC_020524	CAAAAT	2	12	90279	90290	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	469816259
26	NC_020524	TGAAAA	2	12	92946	92957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	469816259
27	NC_020524	CAAATC	2	12	93937	93948	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	469816259
28	NC_020524	GCATAC	2	12	95395	95406	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	469816262
29	NC_020524	GAAAAA	2	12	96723	96734	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	469816264
30	NC_020524	TTGAGG	2	12	98674	98685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	469816264
31	NC_020524	GCAGCC	2	12	99480	99491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	469816264
32	NC_020524	TACGGG	2	12	102119	102130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	469816264
33	NC_020524	AATGCG	2	12	102381	102392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	469816264

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.