MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020524	GAAAA	2	10	1231	1240	80 %	0 %	20 %	0 %	469816146
2	NC_020524	GCGAA	2	10	1310	1319	40 %	0 %	40 %	20 %	469816146
3	NC_020524	CAGCT	2	10	6235	6244	20 %	20 %	20 %	40 %	469816151
4	NC_020524	ACTAA	2	10	7204	7213	60 %	20 %	0 %	20 %	469816153
5	NC_020524	TGATT	2	10	8291	8300	20 %	60 %	20 %	0 %	469816155
6	NC_020524	TTAAA	2	10	8905	8914	60 %	40 %	0 %	0 %	469816155
7	NC_020524	ATCGA	2	10	9193	9202	40 %	20 %	20 %	20 %	469816155
8	NC_020524	CAAAA	2	10	12151	12160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020524	AATCA	2	10	12212	12221	60 %	20 %	0 %	20 %	469816160
10	NC_020524	TTTAA	2	10	12617	12626	40 %	60 %	0 %	0 %	469816161
11	NC_020524	GATTG	2	10	12933	12942	20 %	40 %	40 %	0 %	469816161
12	NC_020524	CTGAA	2	10	17051	17060	40 %	20 %	20 %	20 %	469816166
13	NC_020524	TTTAA	2	10	19553	19562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020524	CTAAG	2	10	20485	20494	40 %	20 %	20 %	20 %	469816169
15	NC_020524	CGCAG	2	10	26127	26136	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020524	AGTTG	2	10	27500	27509	20 %	40 %	40 %	0 %	469816175
17	NC_020524	CGCAG	2	10	29661	29670	20 %	0 %	40 %	40 %	469816176
18	NC_020524	AGAAT	2	10	29919	29928	60 %	20 %	20 %	0 %	469816177
19	NC_020524	GAAAA	2	10	30110	30119	80 %	0 %	20 %	0 %	469816177
20	NC_020524	TTCAA	2	10	30553	30562	40 %	40 %	0 %	20 %	469816178
21	NC_020524	AAACA	2	10	33132	33141	80 %	0 %	0 %	20 %	469816181
22	NC_020524	AAGCA	2	10	36036	36045	60 %	0 %	20 %	20 %	469816184
23	NC_020524	TATTT	2	10	38585	38594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020524	ATTCA	2	10	38853	38862	40 %	40 %	0 %	20 %	469816186
25	NC_020524	TTTGG	2	10	39590	39599	0 %	60 %	40 %	0 %	469816186
26	NC_020524	TCAAA	2	10	39671	39680	60 %	20 %	0 %	20 %	469816187
27	NC_020524	CCAAC	2	10	40435	40444	40 %	0 %	0 %	60 %	469816187
28	NC_020524	AACTG	2	10	43323	43332	40 %	20 %	20 %	20 %	469816195
29	NC_020524	GCCTT	2	10	45215	45224	0 %	40 %	20 %	40 %	469816200
30	NC_020524	AAAAT	2	10	47779	47788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020524	TGCAT	2	10	48805	48814	20 %	40 %	20 %	20 %	469816204
32	NC_020524	GAAGC	2	10	49626	49635	40 %	0 %	40 %	20 %	469816206
33	NC_020524	TCCAA	2	10	49753	49762	40 %	20 %	0 %	40 %	469816206
34	NC_020524	GCGAT	2	10	50717	50726	20 %	20 %	40 %	20 %	469816208
35	NC_020524	CAATA	2	10	51685	51694	60 %	20 %	0 %	20 %	469816208
36	NC_020524	TTTCA	2	10	51748	51757	20 %	60 %	0 %	20 %	469816208
37	NC_020524	TTGCA	2	10	52398	52407	20 %	40 %	20 %	20 %	469816209
38	NC_020524	TAAGT	2	10	53263	53272	40 %	40 %	20 %	0 %	469816210
39	NC_020524	TGATC	2	10	56226	56235	20 %	40 %	20 %	20 %	469816213
40	NC_020524	ATTTG	2	10	57795	57804	20 %	60 %	20 %	0 %	469816215
41	NC_020524	GAGCA	2	10	58728	58737	40 %	0 %	40 %	20 %	469816216
42	NC_020524	AATAT	2	10	62183	62192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020524	AAAAG	2	10	62541	62550	80 %	0 %	20 %	0 %	469816221
44	NC_020524	ATTGC	2	10	62701	62710	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020524	ACAAT	2	10	64750	64759	60 %	20 %	0 %	20 %	469816226
46	NC_020524	ACTCT	2	10	65543	65552	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020524	AAAAC	2	10	66644	66653	80 %	0 %	0 %	20 %	469816228
48	NC_020524	TAGGT	2	10	67161	67170	20 %	40 %	40 %	0 %	469816229
49	NC_020524	AAATT	2	10	67452	67461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020524	GCACA	2	10	69010	69019	40 %	0 %	20 %	40 %	469816231
51	NC_020524	GGGAA	2	10	70064	70073	40 %	0 %	60 %	0 %	469816232
52	NC_020524	GGATG	2	10	73441	73450	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020524	GAAGG	2	10	74651	74660	40 %	0 %	60 %	0 %	469816238
54	NC_020524	GTTGG	2	10	81223	81232	0 %	40 %	60 %	0 %	469816247
55	NC_020524	CAATT	2	10	84334	84343	40 %	40 %	0 %	20 %	469816250
56	NC_020524	TTATG	2	10	85226	85235	20 %	60 %	20 %	0 %	469816252
57	NC_020524	AGCAA	2	10	85958	85967	60 %	0 %	20 %	20 %	469816253
58	NC_020524	GCAAT	2	10	87111	87120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020524	AAATC	2	10	88427	88436	60 %	20 %	0 %	20 %	469816258
60	NC_020524	AACAA	2	10	90803	90812	80 %	0 %	0 %	20 %	469816259
61	NC_020524	TGGGC	2	10	93263	93272	0 %	20 %	60 %	20 %	469816259
62	NC_020524	GATTG	2	10	94378	94387	20 %	40 %	40 %	0 %	469816260
63	NC_020524	AATCA	2	10	94435	94444	60 %	20 %	0 %	20 %	469816260
64	NC_020524	TGAAC	2	10	96776	96785	40 %	20 %	20 %	20 %	469816264
65	NC_020524	TTCAG	2	10	97299	97308	20 %	40 %	20 %	20 %	469816264
66	NC_020524	TGATT	2	10	98042	98051	20 %	60 %	20 %	0 %	469816264
67	NC_020524	TAACT	2	10	101702	101711	40 %	40 %	0 %	20 %	469816264
68	NC_020524	AATGT	2	10	104962	104971	40 %	40 %	20 %	0 %	469816264
69	NC_020524	TCAAT	2	10	107256	107265	40 %	40 %	0 %	20 %	469816264
70	NC_020524	ATTAG	2	10	107694	107703	40 %	40 %	20 %	0 %	469816264
71	NC_020524	TGGTT	2	10	110480	110489	0 %	60 %	40 %	0 %	469816270
72	NC_020524	TCTTT	2	10	110882	110891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.