MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020524	GAAG	2	8	783	790	50 %	0 %	50 %	0 %	469816146
2	NC_020524	ATTT	2	8	1267	1274	25 %	75 %	0 %	0 %	469816146
3	NC_020524	AAGT	2	8	1277	1284	50 %	25 %	25 %	0 %	469816146
4	NC_020524	AAGA	2	8	1914	1921	75 %	0 %	25 %	0 %	469816147
5	NC_020524	AGAA	2	8	2635	2642	75 %	0 %	25 %	0 %	469816148
6	NC_020524	CTGC	2	8	2760	2767	0 %	25 %	25 %	50 %	469816148
7	NC_020524	TCAA	2	8	3185	3192	50 %	25 %	0 %	25 %	469816149
8	NC_020524	AATA	2	8	3315	3322	75 %	25 %	0 %	0 %	469816149
9	NC_020524	TGAA	2	8	3598	3605	50 %	25 %	25 %	0 %	469816149
10	NC_020524	CATA	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	469816150
11	NC_020524	TCTG	2	8	5486	5493	0 %	50 %	25 %	25 %	469816150
12	NC_020524	TTAC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	469816151
13	NC_020524	TAAG	2	8	6540	6547	50 %	25 %	25 %	0 %	469816152
14	NC_020524	TCAA	2	8	6616	6623	50 %	25 %	0 %	25 %	469816152
15	NC_020524	AATT	2	8	6726	6733	50 %	50 %	0 %	0 %	469816152
16	NC_020524	GGCT	2	8	7067	7074	0 %	25 %	50 %	25 %	469816153
17	NC_020524	CAAT	2	8	7196	7203	50 %	25 %	0 %	25 %	469816153
18	NC_020524	ATTT	2	8	8373	8380	25 %	75 %	0 %	0 %	469816155
19	NC_020524	TGAT	2	8	8770	8777	25 %	50 %	25 %	0 %	469816155
20	NC_020524	TCCA	2	8	9134	9141	25 %	25 %	0 %	50 %	469816155
21	NC_020524	GAAG	2	8	10592	10599	50 %	0 %	50 %	0 %	469816157
22	NC_020524	GAAA	2	8	10602	10609	75 %	0 %	25 %	0 %	469816157
23	NC_020524	TATT	2	8	10752	10759	25 %	75 %	0 %	0 %	469816157
24	NC_020524	AATT	2	8	11081	11088	50 %	50 %	0 %	0 %	469816158
25	NC_020524	AATT	2	8	11611	11618	50 %	50 %	0 %	0 %	469816159
26	NC_020524	CAAA	2	8	11796	11803	75 %	0 %	0 %	25 %	469816159
27	NC_020524	TTGA	2	8	11813	11820	25 %	50 %	25 %	0 %	469816159
28	NC_020524	ATGA	2	8	12428	12435	50 %	25 %	25 %	0 %	469816160
29	NC_020524	CTAT	2	8	12558	12565	25 %	50 %	0 %	25 %	469816160
30	NC_020524	AATA	2	8	12719	12726	75 %	25 %	0 %	0 %	469816161
31	NC_020524	TCTT	2	8	12894	12901	0 %	75 %	0 %	25 %	469816161
32	NC_020524	GAAA	2	8	13458	13465	75 %	0 %	25 %	0 %	469816162
33	NC_020524	TTAA	2	8	13645	13652	50 %	50 %	0 %	0 %	469816163
34	NC_020524	TGAT	2	8	13843	13850	25 %	50 %	25 %	0 %	469816163
35	NC_020524	AGTT	2	8	13923	13930	25 %	50 %	25 %	0 %	469816163
36	NC_020524	AATG	2	8	14817	14824	50 %	25 %	25 %	0 %	469816165
37	NC_020524	CATA	2	8	14829	14836	50 %	25 %	0 %	25 %	469816165
38	NC_020524	TGAT	2	8	14996	15003	25 %	50 %	25 %	0 %	469816165
39	NC_020524	ATTG	2	8	15198	15205	25 %	50 %	25 %	0 %	469816165
40	NC_020524	TGGT	2	8	15947	15954	0 %	50 %	50 %	0 %	469816165
41	NC_020524	GTTA	2	8	16321	16328	25 %	50 %	25 %	0 %	469816165
42	NC_020524	CTCA	2	8	16418	16425	25 %	25 %	0 %	50 %	469816165
43	NC_020524	GTAT	2	8	17340	17347	25 %	50 %	25 %	0 %	469816166
44	NC_020524	CTCA	2	8	18073	18080	25 %	25 %	0 %	50 %	469816166
45	NC_020524	AAAC	2	8	18743	18750	75 %	0 %	0 %	25 %	469816167
46	NC_020524	ATTC	2	8	18762	18769	25 %	50 %	0 %	25 %	469816167
47	NC_020524	TCTT	2	8	19136	19143	0 %	75 %	0 %	25 %	469816168
48	NC_020524	CCAA	2	8	19154	19161	50 %	0 %	0 %	50 %	469816168
49	NC_020524	GGAT	2	8	19313	19320	25 %	25 %	50 %	0 %	469816168
50	NC_020524	GAAA	2	8	19448	19455	75 %	0 %	25 %	0 %	469816168
51	NC_020524	TGAT	2	8	20884	20891	25 %	50 %	25 %	0 %	469816169
52	NC_020524	TCTG	2	8	21641	21648	0 %	50 %	25 %	25 %	469816169
53	NC_020524	TAAG	2	8	22174	22181	50 %	25 %	25 %	0 %	469816170
54	NC_020524	AGAC	2	8	22282	22289	50 %	0 %	25 %	25 %	469816170
55	NC_020524	ACAA	2	8	22383	22390	75 %	0 %	0 %	25 %	469816170
56	NC_020524	GTCA	2	8	22488	22495	25 %	25 %	25 %	25 %	469816170
57	NC_020524	AAGA	2	8	22540	22547	75 %	0 %	25 %	0 %	469816170
58	NC_020524	AACA	2	8	22641	22648	75 %	0 %	0 %	25 %	469816171
59	NC_020524	ATTA	2	8	22847	22854	50 %	50 %	0 %	0 %	469816171
60	NC_020524	ATTA	2	8	23236	23243	50 %	50 %	0 %	0 %	469816171
61	NC_020524	AGAT	2	8	23260	23267	50 %	25 %	25 %	0 %	469816171
62	NC_020524	GCAA	2	8	23325	23332	50 %	0 %	25 %	25 %	469816171
63	NC_020524	AGTC	2	8	23648	23655	25 %	25 %	25 %	25 %	469816171
64	NC_020524	TTGC	2	8	24106	24113	0 %	50 %	25 %	25 %	469816172
65	NC_020524	ATCA	2	8	24178	24185	50 %	25 %	0 %	25 %	469816172
66	NC_020524	GAAG	2	8	24312	24319	50 %	0 %	50 %	0 %	469816172
67	NC_020524	GCAG	2	8	24645	24652	25 %	0 %	50 %	25 %	469816172
68	NC_020524	CCGT	2	8	24761	24768	0 %	25 %	25 %	50 %	469816172
69	NC_020524	ATGA	2	8	24925	24932	50 %	25 %	25 %	0 %	469816172
70	NC_020524	TCTT	2	8	25008	25015	0 %	75 %	0 %	25 %	469816172
71	NC_020524	ACGG	2	8	25346	25353	25 %	0 %	50 %	25 %	469816173
72	NC_020524	ATGT	3	12	25374	25385	25 %	50 %	25 %	0 %	469816173
73	NC_020524	TCAT	2	8	26561	26568	25 %	50 %	0 %	25 %	469816174
74	NC_020524	AATC	2	8	27018	27025	50 %	25 %	0 %	25 %	469816174
75	NC_020524	AATT	2	8	27163	27170	50 %	50 %	0 %	0 %	469816175
76	NC_020524	GACT	2	8	27326	27333	25 %	25 %	25 %	25 %	469816175
77	NC_020524	TCAA	2	8	27936	27943	50 %	25 %	0 %	25 %	469816175
78	NC_020524	ATCA	2	8	28537	28544	50 %	25 %	0 %	25 %	469816175
79	NC_020524	GGCA	2	8	28823	28830	25 %	0 %	50 %	25 %	469816175
80	NC_020524	TTAT	2	8	29743	29750	25 %	75 %	0 %	0 %	469816176
81	NC_020524	CCTT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	0 %	50 %	469816178
82	NC_020524	ATCA	2	8	30588	30595	50 %	25 %	0 %	25 %	469816178
83	NC_020524	CGAA	2	8	30734	30741	50 %	0 %	25 %	25 %	469816179
84	NC_020524	TGGC	2	8	30875	30882	0 %	25 %	50 %	25 %	469816179
85	NC_020524	TGAA	2	8	31055	31062	50 %	25 %	25 %	0 %	469816180
86	NC_020524	AACC	2	8	32417	32424	50 %	0 %	0 %	50 %	469816181
87	NC_020524	TTGA	2	8	32679	32686	25 %	50 %	25 %	0 %	469816181
88	NC_020524	AATG	2	8	33051	33058	50 %	25 %	25 %	0 %	469816181
89	NC_020524	GCAA	2	8	33061	33068	50 %	0 %	25 %	25 %	469816181
90	NC_020524	AGTC	2	8	33365	33372	25 %	25 %	25 %	25 %	469816181
91	NC_020524	CAAT	2	8	33787	33794	50 %	25 %	0 %	25 %	469816181
92	NC_020524	AAGA	2	8	33954	33961	75 %	0 %	25 %	0 %	469816181
93	NC_020524	GAAA	2	8	35538	35545	75 %	0 %	25 %	0 %	469816183
94	NC_020524	GAAG	2	8	35785	35792	50 %	0 %	50 %	0 %	469816184
95	NC_020524	GTCG	2	8	36229	36236	0 %	25 %	50 %	25 %	469816185
96	NC_020524	TGAT	2	8	36249	36256	25 %	50 %	25 %	0 %	469816185
97	NC_020524	ATTA	2	8	36310	36317	50 %	50 %	0 %	0 %	469816185
98	NC_020524	AGAA	2	8	36636	36643	75 %	0 %	25 %	0 %	469816185
99	NC_020524	GCGG	2	8	36950	36957	0 %	0 %	75 %	25 %	469816185
100	NC_020524	AATT	2	8	36996	37003	50 %	50 %	0 %	0 %	469816185
101	NC_020524	TCTT	2	8	37262	37269	0 %	75 %	0 %	25 %	469816185
102	NC_020524	ATTT	2	8	37404	37411	25 %	75 %	0 %	0 %	469816185
103	NC_020524	AAGC	2	8	37787	37794	50 %	0 %	25 %	25 %	469816185
104	NC_020524	CTTG	2	8	38095	38102	0 %	50 %	25 %	25 %	469816185
105	NC_020524	TCAA	2	8	38260	38267	50 %	25 %	0 %	25 %	469816185
106	NC_020524	CAAT	2	8	38365	38372	50 %	25 %	0 %	25 %	469816185
107	NC_020524	CAGT	2	8	38980	38987	25 %	25 %	25 %	25 %	469816186
108	NC_020524	CTTG	2	8	39128	39135	0 %	50 %	25 %	25 %	469816186
109	NC_020524	TGAG	2	8	40648	40655	25 %	25 %	50 %	0 %	469816188
110	NC_020524	AATT	2	8	40705	40712	50 %	50 %	0 %	0 %	469816188
111	NC_020524	TACA	2	8	40860	40867	50 %	25 %	0 %	25 %	469816189
112	NC_020524	TCAA	2	8	41276	41283	50 %	25 %	0 %	25 %	469816190
113	NC_020524	TAAC	2	8	41301	41308	50 %	25 %	0 %	25 %	469816190
114	NC_020524	ACTC	2	8	42814	42821	25 %	25 %	0 %	50 %	469816194
115	NC_020524	AAAG	2	8	42829	42836	75 %	0 %	25 %	0 %	469816194
116	NC_020524	TTTC	2	8	43536	43543	0 %	75 %	0 %	25 %	469816195
117	NC_020524	GAAA	2	8	43556	43563	75 %	0 %	25 %	0 %	469816195
118	NC_020524	CCTC	2	8	44014	44021	0 %	25 %	0 %	75 %	469816197
119	NC_020524	ACTT	2	8	44032	44039	25 %	50 %	0 %	25 %	469816197
120	NC_020524	ATTC	2	8	44200	44207	25 %	50 %	0 %	25 %	469816198
121	NC_020524	GGAG	2	8	44426	44433	25 %	0 %	75 %	0 %	469816199
122	NC_020524	CTGT	2	8	44996	45003	0 %	50 %	25 %	25 %	469816200
123	NC_020524	TCAC	2	8	45054	45061	25 %	25 %	0 %	50 %	469816200
124	NC_020524	GAAA	2	8	45117	45124	75 %	0 %	25 %	0 %	469816200
125	NC_020524	GCCT	2	8	45753	45760	0 %	25 %	25 %	50 %	469816201
126	NC_020524	ACAG	2	8	46064	46071	50 %	0 %	25 %	25 %	469816201
127	NC_020524	TAAA	2	8	46393	46400	75 %	25 %	0 %	0 %	469816202
128	NC_020524	AAAG	2	8	47333	47340	75 %	0 %	25 %	0 %	469816203
129	NC_020524	CAAC	2	8	48040	48047	50 %	0 %	0 %	50 %	469816204
130	NC_020524	CAAG	2	8	48137	48144	50 %	0 %	25 %	25 %	469816204
131	NC_020524	TTTA	2	8	48200	48207	25 %	75 %	0 %	0 %	469816204
132	NC_020524	GATT	2	8	48572	48579	25 %	50 %	25 %	0 %	469816204
133	NC_020524	TAAA	2	8	48892	48899	75 %	25 %	0 %	0 %	469816204
134	NC_020524	GATG	2	8	49092	49099	25 %	25 %	50 %	0 %	469816205
135	NC_020524	GCCA	2	8	49156	49163	25 %	0 %	25 %	50 %	469816205
136	NC_020524	TGAC	2	8	49221	49228	25 %	25 %	25 %	25 %	469816205
137	NC_020524	ATCT	2	8	49957	49964	25 %	50 %	0 %	25 %	469816206
138	NC_020524	TACT	2	8	50388	50395	25 %	50 %	0 %	25 %	469816207
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140	NC_020524	TTTC	2	8	50481	50488	0 %	75 %	0 %	25 %	469816207
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.