MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020524	CTG	2	6	484	489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020524	AAT	2	6	1740	1745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020524	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020524	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020524	ATA	2	6	2579	2584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020524	TTG	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020524	CTT	2	6	9629	9634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020524	TGA	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020524	AAT	2	6	10273	10278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020524	ATT	2	6	12119	12124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020524	TTA	2	6	12164	12169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020524	TAA	2	6	13290	13295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020524	TAT	2	6	13307	13312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020524	AGG	2	6	13446	13451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020524	ACA	2	6	14027	14032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020524	ATT	2	6	14338	14343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020524	AAT	2	6	14587	14592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020524	TTA	2	6	14751	14756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020524	AAT	2	6	14787	14792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020524	CAT	2	6	16758	16763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020524	TAT	2	6	16769	16774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020524	ATG	2	6	16805	16810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020524	GTT	2	6	21993	21998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020524	TTA	2	6	23890	23895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020524	ATT	2	6	25026	25031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020524	ATT	2	6	26095	26100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020524	ATT	2	6	30618	30623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020524	CTT	2	6	30678	30683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020524	TTA	3	9	30930	30938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020524	ATT	2	6	35006	35011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020524	ATT	2	6	35680	35685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020524	TAT	2	6	42372	42377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020524	TAT	2	6	42394	42399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020524	ATT	2	6	42890	42895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020524	CTT	2	6	44216	44221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020524	CCT	2	6	44237	44242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020524	TTA	2	6	44589	44594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020524	GAA	2	6	44632	44637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020524	TAA	2	6	44722	44727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020524	TTC	2	6	44750	44755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020524	GCC	2	6	44767	44772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020524	AAT	2	6	45641	45646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020524	TTA	2	6	46664	46669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020524	ACA	2	6	46683	46688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020524	CAT	2	6	46693	46698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020524	CTT	2	6	46703	46708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020524	GCA	2	6	46739	46744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020524	TAA	2	6	46767	46772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020524	CTT	2	6	47820	47825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020524	ATT	2	6	47895	47900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020524	TTG	2	6	47960	47965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020524	TAA	2	6	49441	49446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020524	TAA	2	6	49547	49552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020524	CAG	2	6	50242	50247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020524	TTA	2	6	50260	50265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020524	CCA	2	6	51859	51864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020524	CAC	2	6	51929	51934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020524	GAG	2	6	52659	52664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020524	TTG	2	6	52667	52672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020524	GAT	2	6	53887	53892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020524	TCA	2	6	53923	53928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020524	GTC	2	6	54004	54009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020524	TAT	2	6	54088	54093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020524	TTG	2	6	54114	54119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020524	CAT	2	6	54400	54405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020524	TGC	2	6	54416	54421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020524	TGT	2	6	54845	54850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020524	GAT	2	6	54969	54974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020524	AAG	2	6	55060	55065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020524	AAC	2	6	55074	55079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020524	TTG	2	6	56040	56045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020524	AAT	2	6	57279	57284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020524	CCT	2	6	57578	57583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_020524	TGA	2	6	57719	57724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020524	TGA	2	6	58939	58944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020524	ATC	2	6	60937	60942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020524	TTG	2	6	60979	60984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020524	TCT	2	6	61663	61668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020524	GTG	2	6	61676	61681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020524	CTT	2	6	61959	61964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020524	CAA	2	6	62012	62017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020524	TAC	2	6	62148	62153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020524	GTA	2	6	62207	62212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020524	AGC	2	6	62226	62231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020524	CTC	2	6	62293	62298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020524	TTG	2	6	62635	62640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020524	AGT	2	6	62717	62722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020524	CTT	2	6	63177	63182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020524	ATT	2	6	63322	63327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020524	TGA	2	6	63866	63871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020524	CAT	2	6	64210	64215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020524	TAG	2	6	64937	64942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020524	ATA	2	6	65427	65432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020524	GAA	2	6	65645	65650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020524	GAA	2	6	65688	65693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020524	AAG	2	6	65864	65869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020524	GTA	2	6	66047	66052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020524	CAC	2	6	66369	66374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_020524	TAT	2	6	66426	66431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020524	ACA	2	6	67354	67359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020524	TCT	2	6	67528	67533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020524	TTC	2	6	67544	67549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020524	AGC	2	6	68107	68112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020524	CTT	2	6	68128	68133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020524	AAC	2	6	68140	68145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020524	AAC	2	6	68212	68217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020524	TAA	2	6	69364	69369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020524	CAC	2	6	69507	69512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020524	ATT	2	6	69590	69595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020524	GAC	2	6	69604	69609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020524	TAA	2	6	69614	69619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020524	TGA	2	6	70895	70900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020524	TTA	2	6	70924	70929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020524	AGT	2	6	72777	72782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020524	AAT	2	6	77589	77594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020524	TAA	2	6	77602	77607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020524	TAT	2	6	77623	77628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020524	ATT	2	6	78067	78072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020524	TTA	2	6	78082	78087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020524	TAG	2	6	78178	78183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020524	TAT	2	6	80078	80083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020524	ATT	2	6	82726	82731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020524	GAA	2	6	82814	82819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020524	ATT	2	6	82840	82845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020524	ATT	2	6	83817	83822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020524	TTA	2	6	83853	83858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020524	TTA	2	6	87134	87139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020524	GCT	2	6	87765	87770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020524	ATG	2	6	96524	96529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020524	TAA	2	6	109124	109129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020524	AAC	2	6	109395	109400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020524	ATT	2	6	109423	109428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020524	CTA	2	6	110580	110585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020524	TAA	2	6	110639	110644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020524	CTT	2	6	110648	110653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020524	CAT	2	6	110697	110702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020524	CTT	2	6	110765	110770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020524	ATA	2	6	110825	110830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020524	TAA	2	6	110921	110926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.