MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020524	AT	3	6	561	566	50 %	50 %	0 %	0 %	469816146
2	NC_020524	AG	3	6	3026	3031	50 %	0 %	50 %	0 %	469816148
3	NC_020524	CG	3	6	3488	3493	0 %	0 %	50 %	50 %	469816149
4	NC_020524	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	469816149
5	NC_020524	AG	4	8	4364	4371	50 %	0 %	50 %	0 %	469816149
6	NC_020524	CA	3	6	4922	4927	50 %	0 %	0 %	50 %	469816150
7	NC_020524	TA	3	6	5242	5247	50 %	50 %	0 %	0 %	469816150
8	NC_020524	AT	3	6	5313	5318	50 %	50 %	0 %	0 %	469816150
9	NC_020524	CT	3	6	7019	7024	0 %	50 %	0 %	50 %	469816153
10	NC_020524	TA	3	6	7283	7288	50 %	50 %	0 %	0 %	469816153
11	NC_020524	AC	3	6	7367	7372	50 %	0 %	0 %	50 %	469816153
12	NC_020524	GC	3	6	8166	8171	0 %	0 %	50 %	50 %	469816155
13	NC_020524	GA	3	6	8879	8884	50 %	0 %	50 %	0 %	469816155
14	NC_020524	GA	3	6	10709	10714	50 %	0 %	50 %	0 %	469816157
15	NC_020524	TA	3	6	12100	12105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020524	TA	3	6	12112	12117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020524	GC	3	6	13783	13788	0 %	0 %	50 %	50 %	469816163
18	NC_020524	TA	3	6	14563	14568	50 %	50 %	0 %	0 %	469816164
19	NC_020524	TA	3	6	14774	14779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020524	TC	3	6	15058	15063	0 %	50 %	0 %	50 %	469816165
21	NC_020524	TG	3	6	15348	15353	0 %	50 %	50 %	0 %	469816165
22	NC_020524	GC	3	6	17252	17257	0 %	0 %	50 %	50 %	469816166
23	NC_020524	TA	3	6	17678	17683	50 %	50 %	0 %	0 %	469816166
24	NC_020524	AG	3	6	18613	18618	50 %	0 %	50 %	0 %	469816167
25	NC_020524	TA	3	6	18843	18848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020524	AG	3	6	18856	18861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020524	TA	3	6	20098	20103	50 %	50 %	0 %	0 %	469816169
28	NC_020524	AT	3	6	20453	20458	50 %	50 %	0 %	0 %	469816169
29	NC_020524	TA	3	6	20602	20607	50 %	50 %	0 %	0 %	469816169
30	NC_020524	GT	3	6	21439	21444	0 %	50 %	50 %	0 %	469816169
31	NC_020524	TG	3	6	22162	22167	0 %	50 %	50 %	0 %	469816170
32	NC_020524	AT	3	6	22720	22725	50 %	50 %	0 %	0 %	469816171
33	NC_020524	GA	4	8	22957	22964	50 %	0 %	50 %	0 %	469816171
34	NC_020524	AG	3	6	23914	23919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020524	AG	3	6	25786	25791	50 %	0 %	50 %	0 %	469816173
36	NC_020524	AC	3	6	25853	25858	50 %	0 %	0 %	50 %	469816173
37	NC_020524	CA	3	6	26900	26905	50 %	0 %	0 %	50 %	469816174
38	NC_020524	GC	3	6	28173	28178	0 %	0 %	50 %	50 %	469816175
39	NC_020524	CA	3	6	28383	28388	50 %	0 %	0 %	50 %	469816175
40	NC_020524	CA	3	6	29623	29628	50 %	0 %	0 %	50 %	469816176
41	NC_020524	AT	3	6	29778	29783	50 %	50 %	0 %	0 %	469816177
42	NC_020524	AT	3	6	30414	30419	50 %	50 %	0 %	0 %	469816178
43	NC_020524	AT	3	6	30576	30581	50 %	50 %	0 %	0 %	469816178
44	NC_020524	AC	3	6	30980	30985	50 %	0 %	0 %	50 %	469816180
45	NC_020524	TC	3	6	31945	31950	0 %	50 %	0 %	50 %	469816180
46	NC_020524	TC	3	6	32022	32027	0 %	50 %	0 %	50 %	469816180
47	NC_020524	CA	3	6	32910	32915	50 %	0 %	0 %	50 %	469816181
48	NC_020524	GC	3	6	33327	33332	0 %	0 %	50 %	50 %	469816181
49	NC_020524	AG	3	6	34883	34888	50 %	0 %	50 %	0 %	469816182
50	NC_020524	AT	3	6	34974	34979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020524	CG	3	6	35880	35885	0 %	0 %	50 %	50 %	469816184
52	NC_020524	TA	3	6	36393	36398	50 %	50 %	0 %	0 %	469816185
53	NC_020524	AT	3	6	37039	37044	50 %	50 %	0 %	0 %	469816185
54	NC_020524	AT	3	6	40208	40213	50 %	50 %	0 %	0 %	469816187
55	NC_020524	GC	4	8	40755	40762	0 %	0 %	50 %	50 %	469816188
56	NC_020524	AG	4	8	42431	42438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020524	AT	3	6	42913	42918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020524	AT	3	6	43026	43031	50 %	50 %	0 %	0 %	469816195
59	NC_020524	AG	3	6	43525	43530	50 %	0 %	50 %	0 %	469816195
60	NC_020524	CT	3	6	44241	44246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020524	AT	3	6	46004	46009	50 %	50 %	0 %	0 %	469816201
62	NC_020524	TG	3	6	46302	46307	0 %	50 %	50 %	0 %	469816202
63	NC_020524	AC	3	6	46652	46657	50 %	0 %	0 %	50 %	469816202
64	NC_020524	TA	3	6	47467	47472	50 %	50 %	0 %	0 %	469816203
65	NC_020524	GC	3	6	47731	47736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020524	AT	3	6	47826	47831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020524	TA	3	6	47914	47919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020524	CT	3	6	48210	48215	0 %	50 %	0 %	50 %	469816204
69	NC_020524	CA	3	6	49297	49302	50 %	0 %	0 %	50 %	469816205
70	NC_020524	TA	3	6	51816	51821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020524	AC	3	6	52233	52238	50 %	0 %	0 %	50 %	469816209
72	NC_020524	TG	3	6	52686	52691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020524	TG	3	6	52790	52795	0 %	50 %	50 %	0 %	469816210
74	NC_020524	TA	3	6	54991	54996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020524	GT	3	6	55378	55383	0 %	50 %	50 %	0 %	469816212
76	NC_020524	AT	3	6	55837	55842	50 %	50 %	0 %	0 %	469816212
77	NC_020524	AC	4	8	57157	57164	50 %	0 %	0 %	50 %	469816213
78	NC_020524	TG	3	6	57725	57730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020524	CA	3	6	58986	58991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020524	CT	3	6	59368	59373	0 %	50 %	0 %	50 %	469816217
81	NC_020524	TA	3	6	59575	59580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020524	CA	3	6	62395	62400	50 %	0 %	0 %	50 %	469816221
83	NC_020524	AT	3	6	63524	63529	50 %	50 %	0 %	0 %	469816223
84	NC_020524	CT	3	6	64038	64043	0 %	50 %	0 %	50 %	469816224
85	NC_020524	AT	3	6	64332	64337	50 %	50 %	0 %	0 %	469816225
86	NC_020524	TA	3	6	64649	64654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020524	TA	3	6	65419	65424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020524	AG	3	6	65601	65606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020524	TA	3	6	65769	65774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020524	TA	3	6	66064	66069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020524	TA	3	6	66158	66163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020524	GA	4	8	66192	66199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020524	AG	3	6	66222	66227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020524	TG	3	6	66270	66275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020524	CT	3	6	66440	66445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020524	CA	3	6	66475	66480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020524	TA	3	6	66545	66550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020524	CT	3	6	67185	67190	0 %	50 %	0 %	50 %	469816229
99	NC_020524	GC	3	6	67439	67444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020524	TA	3	6	68087	68092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020524	GC	3	6	68180	68185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020524	CA	3	6	68787	68792	50 %	0 %	0 %	50 %	469816231
103	NC_020524	AG	3	6	69289	69294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020524	TA	3	6	69419	69424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020524	TA	3	6	69519	69524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020524	CG	3	6	70014	70019	0 %	0 %	50 %	50 %	469816232
107	NC_020524	AT	3	6	70560	70565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020524	AT	3	6	71367	71372	50 %	50 %	0 %	0 %	469816235
109	NC_020524	AG	3	6	76546	76551	50 %	0 %	50 %	0 %	469816241
110	NC_020524	GT	3	6	77359	77364	0 %	50 %	50 %	0 %	469816243
111	NC_020524	AT	3	6	77593	77598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020524	AT	3	6	77631	77636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020524	AC	3	6	77798	77803	50 %	0 %	0 %	50 %	469816244
114	NC_020524	TA	3	6	79298	79303	50 %	50 %	0 %	0 %	469816246
115	NC_020524	AG	4	8	82795	82802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020524	TG	3	6	83334	83339	0 %	50 %	50 %	0 %	469816249
117	NC_020524	GC	3	6	85265	85270	0 %	0 %	50 %	50 %	469816252
118	NC_020524	GA	3	6	85619	85624	50 %	0 %	50 %	0 %	469816252
119	NC_020524	CG	3	6	86000	86005	0 %	0 %	50 %	50 %	469816253
120	NC_020524	AT	3	6	87714	87719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020524	AT	3	6	87736	87741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020524	CT	3	6	88678	88683	0 %	50 %	0 %	50 %	469816259
123	NC_020524	GC	3	6	89184	89189	0 %	0 %	50 %	50 %	469816259
124	NC_020524	AG	3	6	89473	89478	50 %	0 %	50 %	0 %	469816259
125	NC_020524	AG	3	6	92246	92251	50 %	0 %	50 %	0 %	469816259
126	NC_020524	TA	3	6	94082	94087	50 %	50 %	0 %	0 %	469816259
127	NC_020524	AC	3	6	95193	95198	50 %	0 %	0 %	50 %	469816262
128	NC_020524	CG	3	6	95994	95999	0 %	0 %	50 %	50 %	469816263
129	NC_020524	TC	3	6	96314	96319	0 %	50 %	0 %	50 %	469816263
130	NC_020524	GA	3	6	96611	96616	50 %	0 %	50 %	0 %	469816264
131	NC_020524	CT	3	6	96965	96970	0 %	50 %	0 %	50 %	469816264
132	NC_020524	CG	3	6	98070	98075	0 %	0 %	50 %	50 %	469816264
133	NC_020524	AC	3	6	98249	98254	50 %	0 %	0 %	50 %	469816264
134	NC_020524	GC	3	6	100124	100129	0 %	0 %	50 %	50 %	469816264
135	NC_020524	TC	3	6	100717	100722	0 %	50 %	0 %	50 %	469816264
136	NC_020524	TC	3	6	103624	103629	0 %	50 %	0 %	50 %	469816264
137	NC_020524	CT	3	6	104411	104416	0 %	50 %	0 %	50 %	469816264
138	NC_020524	CT	3	6	105441	105446	0 %	50 %	0 %	50 %	469816264
139	NC_020524	TA	3	6	108360	108365	50 %	50 %	0 %	0 %	469816266
140	NC_020524	CT	3	6	108680	108685	0 %	50 %	0 %	50 %	469816266
141	NC_020524	AC	3	6	109411	109416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020524	TG	3	6	109576	109581	0 %	50 %	50 %	0 %	469816269
143	NC_020524	GA	3	6	109629	109634	50 %	0 %	50 %	0 %	469816269
144	NC_020524	GT	3	6	110303	110308	0 %	50 %	50 %	0 %	469816270

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.