MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020523	GTG	2	6	13	18	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020523	CCG	2	6	45	50	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020523	CCG	2	6	99	104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_020523	CCA	3	9	116	124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020523	CCA	3	9	150	158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020523	CCG	2	6	272	277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020523	GCA	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157220
8	NC_020523	CAC	2	6	437	442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
9	NC_020523	ACC	2	6	447	452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
10	NC_020523	AAC	2	6	488	493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157220
11	NC_020523	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470157220
12	NC_020523	CCG	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157220
13	NC_020523	CGT	2	6	777	782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157220
14	NC_020523	ACC	2	6	795	800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
15	NC_020523	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470157220
16	NC_020523	GTG	2	6	977	982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157220
17	NC_020523	CCA	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
18	NC_020523	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157220
19	NC_020523	CAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157220
20	NC_020523	GCA	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157220
21	NC_020523	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
22	NC_020523	GTG	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020523	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020523	CCA	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_020523	TAA	2	6	1973	1978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020523	CAC	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157221
27	NC_020523	CAT	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157221
28	NC_020523	ACC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157221
29	NC_020523	CGA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157222
30	NC_020523	CAC	4	12	2629	2640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157222
31	NC_020523	TGC	2	6	2782	2787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157222
32	NC_020523	AGG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157222
33	NC_020523	AGC	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157222
34	NC_020523	TGC	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157222
35	NC_020523	CCG	2	6	3163	3168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157223
36	NC_020523	CAC	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157223
37	NC_020523	CTA	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157223
38	NC_020523	TAC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157223
39	NC_020523	TGG	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020523	GTG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020523	CGT	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157224
42	NC_020523	TAC	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157224
43	NC_020523	TGC	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020523	TAG	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.